294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0464 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0464  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  260  4.999999999999999e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0817  hypothetical protein  72.07 
 
 
116 aa  163  9e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2322  hypothetical protein  71.05 
 
 
115 aa  159  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.424482  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0899  hypothetical protein  68.93 
 
 
114 aa  141  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.782878 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2224  hypothetical protein  61.39 
 
 
114 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0861526 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3552  hypothetical protein  63.06 
 
 
114 aa  111  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.680351  normal  0.883284 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2554  hypothetical protein  63.06 
 
 
114 aa  111  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1347  hypothetical protein  49.54 
 
 
115 aa  108  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.202023  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00191  hypothetical protein  49.54 
 
 
115 aa  108  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0824475  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4027  hypothetical protein  55.22 
 
 
134 aa  107  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.265106  normal  0.223264 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00241  hypothetical protein  45.87 
 
 
113 aa  103  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0020  hypothetical protein  44.95 
 
 
116 aa  100  6e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0229091  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00191  hypothetical protein  44.04 
 
 
116 aa  99  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00201  hypothetical protein  48.15 
 
 
115 aa  99  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.076053  normal  0.0532755 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00191  hypothetical protein  43.12 
 
 
116 aa  98.6  2e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0027  hypothetical protein  44.95 
 
 
113 aa  97.4  5e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00191  hypothetical protein  42.2 
 
 
116 aa  94.4  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0023  hypothetical protein  45.87 
 
 
113 aa  84.3  5e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1336  valyl-tRNA synthetase  44.79 
 
 
106 aa  82.8  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0849671  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1573  hypothetical protein  42.71 
 
 
108 aa  80.5  0.000000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0202181  hitchhiker  0.00000255943 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1737  hypothetical protein  44.79 
 
 
108 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.101629  normal  0.0464843 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1447  hypothetical protein  43.75 
 
 
108 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144293  normal  0.0886096 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1764  hypothetical protein  44.79 
 
 
108 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0408382  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2243  hypothetical protein  44.33 
 
 
108 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0461553  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1360  hypothetical protein  44.33 
 
 
108 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472442  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2111  hypothetical protein  43.3 
 
 
108 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00197936  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2372  hypothetical protein  44.33 
 
 
108 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5127  hypothetical protein  44.79 
 
 
108 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0017453  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0046  hypothetical protein  44.33 
 
 
108 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.432428  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2205  hypothetical protein  44.33 
 
 
108 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0750998  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1122  hypothetical protein  44.33 
 
 
108 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.408475  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2220  hypothetical protein  44.33 
 
 
108 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187397  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2128  hypothetical protein  43.3 
 
 
108 aa  78.6  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144377  normal  0.413822 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1850  hypothetical protein  44.33 
 
 
108 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00325862  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6253  hypothetical protein  44.79 
 
 
108 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.127485  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1850  hypothetical protein  44.79 
 
 
108 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.183453  normal  0.129775 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1826  hypothetical protein  44.79 
 
 
108 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0387614  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1074  hypothetical protein  41.67 
 
 
108 aa  77.8  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0952  hypothetical protein  43.3 
 
 
108 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0417166  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2533  hypothetical protein  39.58 
 
 
108 aa  76.6  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.344639  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2360  hypothetical protein  43.3 
 
 
108 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0900418  normal  0.142992 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1827  hypothetical protein  43.3 
 
 
108 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.878322  normal  0.172483 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1975  hypothetical protein  41.24 
 
 
108 aa  75.1  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.119548 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1854  hypothetical protein  43.33 
 
 
108 aa  75.1  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.817534  normal  0.34836 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1309  hypothetical protein  37.5 
 
 
109 aa  75.1  0.0000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000243937  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1400  hypothetical protein  42.71 
 
 
107 aa  75.1  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.851701  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2594  hypothetical protein  39.8 
 
 
106 aa  74.3  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0325916  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1192  hypothetical protein  44.33 
 
 
115 aa  73.6  0.0000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.237084  normal  0.460114 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1857  hypothetical protein  38.54 
 
 
108 aa  73.6  0.0000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00422  hypothetical protein  38.54 
 
 
109 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000789262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3139  conserved hypothetical protein  38.54 
 
 
109 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000114318  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0590  hypothetical protein  38.54 
 
 
109 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.849512  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1327  hypothetical protein  40.62 
 
 
107 aa  72.8  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0536  hypothetical protein  38.54 
 
 
109 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.529498  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0562  hypothetical protein  38.54 
 
 
109 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140124  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0530  hypothetical protein  38.54 
 
 
109 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0514  hypothetical protein  38.54 
 
 
109 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0066094  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0548  hypothetical protein  38.54 
 
 
109 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0978192  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0530  hypothetical protein  38.54 
 
 
109 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.560508  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0546  hypothetical protein  38.54 
 
 
109 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0403  hypothetical protein  38.54 
 
 
109 aa  73.2  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0388761  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0573  hypothetical protein  37.5 
 
 
120 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000610964  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3145  hypothetical protein  38.54 
 
 
109 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000177659  normal  0.0402565 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1020  hypothetical protein  37.5 
 
 
109 aa  73.2  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.186171  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2276  hypothetical protein  36.46 
 
 
109 aa  72.8  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00427  hypothetical protein  38.54 
 
 
109 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000717849  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03086  hypothetical protein  36.46 
 
 
109 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0509  hypothetical protein  38.54 
 
 
109 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00428727  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1086  hypothetical protein  38.14 
 
 
111 aa  72.4  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2533  hypothetical protein  40.21 
 
 
108 aa  72.4  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.180603  normal  0.572241 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0516  hypothetical protein  39.58 
 
 
108 aa  71.6  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.384172 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002886  hypothetical protein  35.42 
 
 
109 aa  71.6  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.503063  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2349  hypothetical protein  40.4 
 
 
110 aa  71.6  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.625657  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01098  hypothetical protein  36.46 
 
 
109 aa  71.2  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0142015  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4847  hypothetical protein  40 
 
 
105 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.246843  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1592  hypothetical protein  38.38 
 
 
107 aa  71.2  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.107966  normal  0.0589589 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1920  hypothetical protein  38.38 
 
 
107 aa  71.2  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1508  hypothetical protein  40.4 
 
 
110 aa  71.6  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1128  hypothetical protein  43.3 
 
 
115 aa  71.2  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.846076 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1036  hypothetical protein  43.3 
 
 
115 aa  71.2  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.438552  normal  0.657971 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0231  hypothetical protein  37.5 
 
 
107 aa  70.9  0.000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.513324  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4902  hypothetical protein  41.41 
 
 
110 aa  70.5  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0807  hypothetical protein  40.62 
 
 
107 aa  70.5  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0237853  hitchhiker  0.000000927658 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0951  hypothetical protein  38.46 
 
 
110 aa  70.5  0.000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0862598  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2234  hypothetical protein  37.5 
 
 
109 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000846885  hitchhiker  0.000165912 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3038  hypothetical protein  35.42 
 
 
109 aa  70.1  0.000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1739  hypothetical protein  40.71 
 
 
127 aa  70.1  0.000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243349  normal  0.0708671 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19840  hypothetical protein  38.54 
 
 
108 aa  69.7  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2851  hypothetical protein  36.46 
 
 
109 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000248364  hitchhiker  0.000000268908 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2646  hypothetical protein  39.58 
 
 
108 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108892  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4268  hypothetical protein  39.39 
 
 
111 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0432211  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0645  hypothetical protein  41.67 
 
 
107 aa  68.9  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1794  hypothetical protein  36.46 
 
 
109 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000138787  hitchhiker  0.000000117364 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3800  hypothetical protein  37.5 
 
 
111 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1600  hypothetical protein  39.39 
 
 
111 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.599296  normal  0.129358 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3833  hypothetical protein  39.39 
 
 
111 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.869154  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0507  hypothetical protein  36.36 
 
 
100 aa  68.9  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.845644  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44620  hypothetical protein  37.5 
 
 
108 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.151408  normal  0.274128 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0701  hypothetical protein  41.67 
 
 
107 aa  67.8  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3586  hypothetical protein  39.39 
 
 
111 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>