178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0027 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0027  hypothetical protein  100 
 
 
113 aa  224  3e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00241  hypothetical protein  82.88 
 
 
113 aa  187  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0023  hypothetical protein  91.15 
 
 
113 aa  187  4e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00191  hypothetical protein  70.54 
 
 
115 aa  167  4e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0824475  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1347  hypothetical protein  69.64 
 
 
115 aa  166  1e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.202023  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00201  hypothetical protein  70.27 
 
 
115 aa  165  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.076053  normal  0.0532755 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00191  hypothetical protein  65.77 
 
 
116 aa  152  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0020  hypothetical protein  63.96 
 
 
116 aa  146  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0229091  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00191  hypothetical protein  62.16 
 
 
116 aa  144  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00191  hypothetical protein  63.06 
 
 
116 aa  144  5e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2224  hypothetical protein  50.49 
 
 
114 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0861526 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0464  hypothetical protein  44.95 
 
 
131 aa  97.4  6e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0817  hypothetical protein  47.71 
 
 
116 aa  95.1  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2322  hypothetical protein  47.71 
 
 
115 aa  93.2  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.424482  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0899  hypothetical protein  46.15 
 
 
114 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.782878 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4027  hypothetical protein  54 
 
 
134 aa  90.1  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.265106  normal  0.223264 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3552  hypothetical protein  48.62 
 
 
114 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.680351  normal  0.883284 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2554  hypothetical protein  48.62 
 
 
114 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0510  hypothetical protein  35.85 
 
 
110 aa  62.4  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4902  hypothetical protein  34.91 
 
 
110 aa  60.5  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2645  hypothetical protein  35.58 
 
 
110 aa  60.5  0.000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00439109 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1459  hypothetical protein  34.07 
 
 
108 aa  59.3  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1508  hypothetical protein  33.02 
 
 
110 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2349  hypothetical protein  33.02 
 
 
110 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.625657  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2533  hypothetical protein  35.29 
 
 
108 aa  58.9  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.180603  normal  0.572241 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4847  hypothetical protein  34.31 
 
 
105 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.246843  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1458  hypothetical protein  33.98 
 
 
110 aa  57.4  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.542371  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2331  hypothetical protein  33.65 
 
 
110 aa  57.4  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1854  hypothetical protein  35.96 
 
 
108 aa  57  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.817534  normal  0.34836 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0573  hypothetical protein  33.33 
 
 
120 aa  56.2  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000610964  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1975  hypothetical protein  34.31 
 
 
108 aa  56.6  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.119548 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2111  hypothetical protein  32.99 
 
 
108 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00197936  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0530  hypothetical protein  35.42 
 
 
109 aa  55.8  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00315324  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2128  hypothetical protein  32.99 
 
 
108 aa  55.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144377  normal  0.413822 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1074  hypothetical protein  35.05 
 
 
108 aa  55.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03086  hypothetical protein  33.33 
 
 
109 aa  55.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1592  hypothetical protein  33.98 
 
 
107 aa  56.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.107966  normal  0.0589589 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1920  hypothetical protein  33.98 
 
 
107 aa  56.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1360  hypothetical protein  32.99 
 
 
108 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472442  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2372  hypothetical protein  32.99 
 
 
108 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002886  hypothetical protein  33.33 
 
 
109 aa  55.5  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.503063  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1850  hypothetical protein  32.99 
 
 
108 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00325862  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0046  hypothetical protein  32.99 
 
 
108 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.432428  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2205  hypothetical protein  32.99 
 
 
108 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0750998  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2243  hypothetical protein  32.99 
 
 
108 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0461553  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1122  hypothetical protein  32.99 
 
 
108 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.408475  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0952  hypothetical protein  32.99 
 
 
108 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0417166  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1811  hypothetical protein  38.14 
 
 
107 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.82325  normal  0.803316 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2220  hypothetical protein  31.96 
 
 
108 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187397  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1311  hypothetical protein  32.41 
 
 
109 aa  54.7  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000397187  normal  0.0452389 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2851  hypothetical protein  32.41 
 
 
109 aa  54.7  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000248364  hitchhiker  0.000000268908 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1827  hypothetical protein  32.99 
 
 
108 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.878322  normal  0.172483 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2360  hypothetical protein  32.99 
 
 
108 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0900418  normal  0.142992 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1447  hypothetical protein  31.96 
 
 
108 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144293  normal  0.0886096 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1336  valyl-tRNA synthetase  29.47 
 
 
106 aa  53.9  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0849671  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5127  hypothetical protein  31.96 
 
 
108 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0017453  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3472  hypothetical protein  32.71 
 
 
107 aa  53.9  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.153266  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1850  hypothetical protein  31.96 
 
 
108 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.183453  normal  0.129775 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6253  hypothetical protein  31.96 
 
 
108 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.127485  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1826  hypothetical protein  31.96 
 
 
108 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0387614  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1794  hypothetical protein  31.48 
 
 
109 aa  53.9  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000138787  hitchhiker  0.000000117364 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1737  hypothetical protein  31.96 
 
 
108 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.101629  normal  0.0464843 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1764  hypothetical protein  31.96 
 
 
108 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0408382  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1192  hypothetical protein  32.99 
 
 
115 aa  53.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.237084  normal  0.460114 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01098  hypothetical protein  28.57 
 
 
109 aa  52.8  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0142015  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1086  hypothetical protein  33.7 
 
 
111 aa  53.5  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1573  hypothetical protein  31.37 
 
 
108 aa  52.8  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0202181  hitchhiker  0.00000255943 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4056  hypothetical protein  36.84 
 
 
107 aa  53.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0251815  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2325  hypothetical protein  31.53 
 
 
111 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000151444  hitchhiker  0.000451117 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2276  hypothetical protein  29.67 
 
 
109 aa  52.8  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2234  hypothetical protein  31.48 
 
 
109 aa  52.8  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000846885  hitchhiker  0.000165912 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1128  hypothetical protein  34.02 
 
 
115 aa  52  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.846076 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2380  hypothetical protein  31.25 
 
 
110 aa  52  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000806852  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2253  hypothetical protein  31.53 
 
 
111 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000393048  normal  0.185455 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2445  hypothetical protein  31.53 
 
 
111 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000775754  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1036  hypothetical protein  34.02 
 
 
115 aa  52  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.438552  normal  0.657971 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2301  hypothetical protein  31.48 
 
 
109 aa  52  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000177847  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02442  hypothetical protein  34.38 
 
 
98 aa  51.6  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1122  hypothetical protein  32.99 
 
 
107 aa  51.6  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1216  hypothetical protein  32.99 
 
 
107 aa  51.6  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1857  hypothetical protein  31.37 
 
 
108 aa  51.2  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1239  hypothetical protein  29.29 
 
 
108 aa  51.6  0.000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00422  hypothetical protein  30.1 
 
 
109 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000789262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3139  conserved hypothetical protein  30.1 
 
 
109 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000114318  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00427  hypothetical protein  30.1 
 
 
109 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000717849  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0536  hypothetical protein  30.1 
 
 
109 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.529498  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0546  hypothetical protein  30.1 
 
 
109 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0403  hypothetical protein  30.1 
 
 
109 aa  51.2  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0388761  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1770  hypothetical protein  31.48 
 
 
109 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000205784  hitchhiker  0.00167408 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0530  hypothetical protein  30.1 
 
 
109 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3145  hypothetical protein  30.1 
 
 
109 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000177659  normal  0.0402565 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0514  hypothetical protein  30.1 
 
 
109 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0066094  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0562  hypothetical protein  30.1 
 
 
109 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140124  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0548  hypothetical protein  30.1 
 
 
109 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0978192  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1400  hypothetical protein  32.29 
 
 
107 aa  51.2  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.851701  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0530  hypothetical protein  30.1 
 
 
109 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.560508  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0590  hypothetical protein  30.1 
 
 
109 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.849512  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2689  hypothetical protein  31.48 
 
 
121 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000229424  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2573  hypothetical protein  31.48 
 
 
121 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000212761  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2614  hypothetical protein  31.48 
 
 
121 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000245202  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>