More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_R0046 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_rrsVIMSS1309392  16S ribosomal RNA  96.86 
 
 		 1465 bp  2533    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_rrsVIMSS1309386  16S ribosomal RNA  96.73 
 
 		 1465 bp  2518    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_rrsVIMSS1309438  16S ribosomal RNA  97.54 
 
 		 1465 bp  2613    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.227011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0042  16S ribosomal RNA  87.64 
 
 		 1479 bp  1413    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00382367  normal  0.418818 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0016  16S ribosomal RNA  87.7 
 
 		 1477 bp  1439    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000540831  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0008  16S ribosomal RNA  87.71 
 
 		 1478 bp  1433    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0215211  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0043  16S ribosomal RNA  89.65 
 
 		 1474 bp  1653    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000929778  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0024  16S ribosomal RNA  87.71 
 
 		 1479 bp  1421    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0041  16S ribosomal RNA  87.71 
 
 		 1479 bp  1421    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0038  16S ribosomal RNA  87.7 
 
 		 1477 bp  1439    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.319157  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0025  16S ribosomal RNA  87.7 
 
 		 1477 bp  1439    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0178526  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0029  16S ribosomal RNA  86.68 
 
 		 1479 bp  1344    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.726938 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0006  16S ribosomal RNA  89.65 
 
 		 1474 bp  1653    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00882532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0011  16S ribosomal RNA  86.61 
 
 		 1479 bp  1336    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0023  16S ribosomal RNA  87.71 
 
 		 1479 bp  1421    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.382487  normal  0.0885357 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0036  16S ribosomal RNA  96.63 
 
 		 1394 bp  2385    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0006  16S ribosomal RNA  88.47 
 
 		 1488 bp  1513    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0630804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0024  16S ribosomal RNA  88.47 
 
 		 1490 bp  1513    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000346513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0035  16S ribosomal RNA  88.47 
 
 		 1488 bp  1513    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0053  16S ribosomal RNA  88.47 
 
 		 1490 bp  1513    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0046  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1479 bp  2932    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.76597  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0051  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1458 bp  2890    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0016  16S ribosomal RNA  99.44 
 
 		 1440 bp  2791    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0817625  normal  0.696082 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0051  16S ribosomal RNA  99.44 
 
 		 1440 bp  2791    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_rrsVIMSS1309404  16S ribosomal RNA  96.73 
 
 		 1465 bp  2518    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.712316 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0038  16S ribosomal RNA  86.61 
 
 		 1479 bp  1336    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_rrsVIMSS1309398  16S ribosomal RNA  96.89 
 
 		 1498 bp  2559    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0009  16S ribosomal RNA  96.93 
 
 		 1465 bp  2541    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0004  16S ribosomal RNA  91.02 
 
 		 1490 bp  1842    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000000000245039  normal  0.031985 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0052  16S ribosomal RNA  91.02 
 
 		 1490 bp  1842    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000728584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_rrsVIMSS1309420  16S ribosomal RNA  98.36 
 
 		 1401 bp  2589    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.169301 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_rrsVIMSS1309419  16S ribosomal RNA  98.36 
 
 		 1401 bp  2589    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0014  16S ribosomal RNA  87.85 
 
 		 1482 bp  1447    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000301057  normal  0.0729234 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0029  16S ribosomal RNA  87.85 
 
 		 1482 bp  1447    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00282638  decreased coverage  0.00054709 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0012  16S ribosomal RNA  84.57 
 
 		 1555 bp  613  1e-173  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000489495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0001  16S ribosomal RNA  83.77 
 
 		 1612 bp  567  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.764538  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0094  16S ribosomal RNA  83.66 
 
 		 1612 bp  559  1e-157  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.209006  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0014  16S ribosomal RNA  83.66 
 
 		 1612 bp  559  1e-157  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000823591  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0031  16S ribosomal RNA  83.66 
 
 		 1612 bp  559  1e-157  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000490683  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0078  16S ribosomal RNA  83.54 
 
 		 1612 bp  551  1e-154  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0047  16S ribosomal RNA  83.54 
 
 		 1612 bp  551  1e-154  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.550323  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0061  16S ribosomal RNA  83.54 
 
 		 1612 bp  551  1e-154  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000932008  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0050  16S ribosomal RNA  83.54 
 
 		 1612 bp  551  1e-154  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000108329  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna52  16S ribosomal RNA  83.22 
 
 		 1535 bp  529  1e-148  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00245736  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0061  16S ribosomal RNA  83.12 
 
 		 1554 bp  531  1e-148  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0018  16S ribosomal RNA  83.12 
 
 		 1554 bp  531  1e-148  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000694535  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna59  16S ribosomal RNA  83.22 
 
 		 1535 bp  529  1e-148  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00000514214  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0041  16S ribosomal RNA  83.41 
 
 		 1521 bp  523  1e-146  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0058  16S ribosomal RNA  83.41 
 
 		 1521 bp  523  1e-146  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0008  16S ribosomal RNA  83.16 
 
 		 1530 bp  517  1e-144  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0950518  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0015  16S ribosomal RNA  83.16 
 
 		 1689 bp  517  1e-144  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.015768  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0020  16S ribosomal RNA  83.16 
 
 		 1502 bp  517  1e-144  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0066  16S ribosomal RNA  83.3 
 
 		 1521 bp  515  1e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0054  16S ribosomal RNA  83.3 
 
 		 1521 bp  515  1e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0158667  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0003  16S ribosomal RNA  83.18 
 
 		 1587 bp  511  9.999999999999999e-143  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000280659  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0062  16S ribosomal RNA  85.59 
 
 		 1545 bp  511  9.999999999999999e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0065  16S ribosomal RNA  85.59 
 
 		 1545 bp  511  9.999999999999999e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0081  16S ribosomal RNA  83.18 
 
 		 1587 bp  511  9.999999999999999e-143  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000506344  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0030  16S ribosomal RNA  85.59 
 
 		 1545 bp  511  9.999999999999999e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0716332  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0027  16S ribosomal RNA  85.59 
 
 		 1545 bp  511  9.999999999999999e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0024  16S ribosomal RNA  83.28 
 
 		 1536 bp  509  9.999999999999999e-143  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0068  16S ribosomal RNA  85.59 
 
 		 1545 bp  511  9.999999999999999e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0071  16S ribosomal RNA  85.59 
 
 		 1545 bp  511  9.999999999999999e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0094  16S ribosomal RNA  85.59 
 
 		 1545 bp  511  9.999999999999999e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000260573  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0074  16S ribosomal RNA  85.59 
 
 		 1545 bp  511  9.999999999999999e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0190037  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0011  16S ribosomal RNA  83.89 
 
 		 1556 bp  509  9.999999999999999e-143  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.170551  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0146  16S ribosomal RNA  85.59 
 
 		 1545 bp  511  9.999999999999999e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000258872  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0015  16S ribosomal RNA  85.59 
 
 		 1545 bp  511  9.999999999999999e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000381882  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0059  16S ribosomal RNA  85.59 
 
 		 1545 bp  511  9.999999999999999e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0054  16S ribosomal RNA  85.59 
 
 		 1545 bp  511  9.999999999999999e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000307984  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0008  16S ribosomal RNA  85.59 
 
 		 1545 bp  511  9.999999999999999e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.331596  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0001  16S ribosomal RNA  85.59 
 
 		 1545 bp  511  9.999999999999999e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0073  16S ribosomal RNA  82.78 
 
 		 1661 bp  507  1e-141  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000134012  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0080  16S ribosomal RNA  82.78 
 
 		 1671 bp  507  1e-141  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.088848  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0006  16S ribosomal RNA  82.78 
 
 		 1554 bp  507  1e-141  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00174832  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0009  16S ribosomal RNA  83.06 
 
 		 1587 bp  504  1e-140  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000146343  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0022  16S ribosomal RNA  83.06 
 
 		 1587 bp  504  1e-140  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107044  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0064  16S ribosomal RNA  83.06 
 
 		 1587 bp  504  1e-140  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000848951  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0051  16S ribosomal RNA  84.05 
 
 		 1555 bp  498  9.999999999999999e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000203426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0046  16S ribosomal RNA  82.95 
 
 		 1587 bp  496  1e-137  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000560958  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_r01  16S ribosomal RNA  85.44 
 
 		 1555 bp  496  1e-137  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0013  16S ribosomal RNA  83.91 
 
 		 1555 bp  490  1e-136  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000280692  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_12  16S ribosomal RNA  85.43 
 
 		 1510 bp  492  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.379759  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0043  16S ribosomal RNA  83.71 
 
 		 1526 bp  490  1e-136  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000809065  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5771  16S ribosomal RNA  85.29 
 
 		 1562 bp  488  1e-135  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000116476  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5671  16S ribosomal RNA  85.38 
 
 		 1509 bp  488  1e-135  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000020932 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5664  16S ribosomal RNA  85.38 
 
 		 1509 bp  488  1e-135  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-1  16S ribosomal RNA  85.28 
 
 		 1510 bp  484  1e-134  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0302  16S ribosomal RNA  85.05 
 
 		 1509 bp  486  1e-134  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000398573  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-11  16S ribosomal RNA  85.28 
 
 		 1510 bp  484  1e-134  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-4  16S ribosomal RNA  85.28 
 
 		 1510 bp  484  1e-134  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.823998  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_11  16S ribosomal RNA  85.28 
 
 		 1510 bp  484  1e-134  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_2  16S ribosomal RNA  85.28 
 
 		 1510 bp  484  1e-134  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_3  16S ribosomal RNA  85.28 
 
 		 1510 bp  484  1e-134  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_4  16S ribosomal RNA  85.28 
 
 		 1510 bp  484  1e-134  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_6  16S ribosomal RNA  85.28 
 
 		 1510 bp  484  1e-134  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.457482  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0058  16S ribosomal RNA  81.71 
 
 		 1545 bp  486  1e-134  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0053  16S ribosomal RNA  81.71 
 
 		 1545 bp  486  1e-134  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.271159  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_7  16S ribosomal RNA  85.28 
 
 		 1510 bp  484  1e-134  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.153942  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_8  16S ribosomal RNA  85.28 
 
 		 1510 bp  484  1e-134  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>