More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_2275 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_2275  carbonic anhydrase  100 
 
 		 231 aa  472  1e-132  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2647  twin-arginine translocation pathway signal  55.41 
 
 		 232 aa  260  1e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5352  carbonic anhydrase  34 
 
 		 245 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.541632  normal  0.601447 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0990  twin-arginine translocation pathway signal  35.32 
 
 		 243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0151815  normal  0.34063 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4750  carbonic anhydrase  37.44 
 
 		 239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7305  carbonic anhydrase  35.27 
 
 		 234 aa  119  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4620  carbonic anhydrase  33.2 
 
 		 234 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10408  Carbonic anhydrase  36.41 
 
 		 188 aa  119  3.9999999999999996e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.477644  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4079  carbonic anhydrase  31.67 
 
 		 236 aa  116  3e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1171  carbonic anhydrase family protein  33.04 
 
 		 240 aa  116  3e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.133462  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6172  putative carbonic anhydrase  31.82 
 
 		 246 aa  116  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.114722 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2488  carbonic anhydrase  33.62 
 
 		 235 aa  115  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000357075  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2454  carbonic anhydrase  36.32 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2668  carbonic anhydrase  39.49 
 
 		 245 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4310  carbonic anhydrase  28.98 
 
 		 232 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000873696  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4248  carbonic anhydrase  28.98 
 
 		 232 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1257  putative carbonic anhydrase precursor  35.41 
 
 		 242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3139  carbonic anhydrase  34.52 
 
 		 217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.213297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2696  carbonic anhydrase  34.27 
 
 		 272 aa  110  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0790  carbonic anhydrase  31.73 
 
 		 234 aa  108  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.518522 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1242  carbonic anhydrase  30.73 
 
 		 233 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.6887  normal  0.056664 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1700  carbonic anhydrase  35.55 
 
 		 237 aa  108  8.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4062  carbonic anhydrase  30.45 
 
 		 233 aa  108  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.54316  normal  0.613582 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1442  carbonic anhydrase family protein  33.17 
 
 		 233 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0231091  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3600  carbonic anhydrase  35.2 
 
 		 212 aa  105  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.672815  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3696  carbonic anhydrase  32.31 
 
 		 251 aa  105  5e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1994  carbonic anhydrase  32.35 
 
 		 234 aa  105  6e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00658745  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0991  twin-arginine translocation pathway signal  32.71 
 
 		 244 aa  103  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0388173  normal  0.219389 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1148  carbonic anhydrase  30.8 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3684  carbonic anhydrase  31.6 
 
 		 232 aa  102  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000316532  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3303  carbonic anhydrase  38.93 
 
 		 243 aa  102  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.015811  normal  0.554874 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0526  carbonic anhydrase  31.02 
 
 		 235 aa  102  5e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00212922 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1737  carbonic anhydrase  31.71 
 
 		 252 aa  102  6e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1098  carbonic anhydrase  29.95 
 
 		 245 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2753  carbonic anhydrase  32.51 
 
 		 236 aa  101  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0066  carbonic anhydrase  39.1 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4087  carbonic anhydrase  34.47 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00019736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2003  carbonic anhydrase  31.37 
 
 		 256 aa  99.8  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000744018  normal  0.230248 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1340  carbonic anhydrase  32.51 
 
 		 258 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0634  carbonic anhydrase  32.04 
 
 		 238 aa  99.8  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6116  carbonic anhydrase  34.87 
 
 		 246 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0240  carbonic anhydrase  32.2 
 
 		 212 aa  99.4  4e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0948086  normal  0.991169 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0743  carbonic anhydrase  33.97 
 
 		 210 aa  99  5e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.576778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2396  carbonic anhydrase  31.96 
 
 		 243 aa  99  5e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3139  carbonic anhydrase  30.8 
 
 		 230 aa  98.6  7e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2193  carbonic anhydrase  30 
 
 		 239 aa  98.6  7e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0405981  normal  0.318261 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3323  carbonic anhydrase  32.78 
 
 		 243 aa  98.2  9e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0867  carbonic anhydrase  29.77 
 
 		 235 aa  98.2  9e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0728812  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0405  carbonic anhydrase  33.72 
 
 		 215 aa  97.8  1e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.481966  normal  0.0139247 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0217  carbonic anhydrase  31.07 
 
 		 212 aa  96.7  3e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0194382 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1487  carbonic anhydrase  37.74 
 
 		 247 aa  95.9  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3601  carbonic anhydrase  29.72 
 
 		 238 aa  95.5  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0800  carbonic anhydrase  30.58 
 
 		 221 aa  95.5  6e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000181873  normal  0.299491 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1182  carbonic anhydrase  30.73 
 
 		 204 aa  95.5  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0271788  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1607  carbonic anhydrase  32.44 
 
 		 244 aa  94.7  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1253  carbonic anhydrase  36.84 
 
 		 204 aa  93.6  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000175923 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4065  carbonic anhydrase  30.83 
 
 		 232 aa  93.2  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1001  carbonic anhydrase  31.96 
 
 		 251 aa  92.8  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.936543  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1911  carbonic anhydrase  31.78 
 
 		 203 aa  92.8  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0884493  normal  0.586468 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0950  putative carbonic anhydrase  31.96 
 
 		 225 aa  92.8  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.430149  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3272  putative carbonic anhydrase  31.96 
 
 		 225 aa  92.8  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000205018  hitchhiker  0.000000000568785 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3786  carbonic anhydrase  28.97 
 
 		 248 aa  92  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0964  carbonic anhydrase  31.43 
 
 		 216 aa  92  7e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0890219  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0301  carbonic anhydrase  30.88 
 
 		 325 aa  91.7  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000471687  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1094  carbonic anhydrase  31.82 
 
 		 236 aa  90.5  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0137152  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0095  Carbonate dehydratase  36.31 
 
 		 726 aa  90.5  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431657  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2569  hypothetical protein  26.01 
 
 		 246 aa  90.9  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20500  carbonic anhydrase  29.95 
 
 		 204 aa  90.1  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.196424  normal  0.646859 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0878  carbonic anhydrase  32.04 
 
 		 257 aa  90.1  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1408  carbonic anhydrase  30.3 
 
 		 227 aa  89  7e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0530  carbonic anhydrase  34.71 
 
 		 246 aa  87.8  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.153181  normal  0.0507934 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0442  carbonic anhydrase  30.95 
 
 		 236 aa  87.8  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0752  hypothetical protein  30.14 
 
 		 768 aa  87.8  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0734  hypothetical protein  30.14 
 
 		 768 aa  87.8  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2423  hypothetical protein  25.79 
 
 		 245 aa  87.4  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0017  carbonate dehydratase  41.94 
 
 		 219 aa  88.2  1e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00361281 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1920  carbonate dehydratase  27.91 
 
 		 224 aa  87  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0185278  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4100  carbonic anhydrase  35.65 
 
 		 246 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.325478 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2007  carbonic anhydrase-like  41.67 
 
 		 215 aa  86.7  3e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.224132  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05180  carbonic anhydrase  36.36 
 
 		 223 aa  86.7  3e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.110377  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4468  carbonic anhydrase  35.65 
 
 		 246 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.873511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13621  carbonic anhydrase  40.34 
 
 		 207 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.80194e-33  normal  0.0391144 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5345  carbonic anhydrase  37.61 
 
 		 206 aa  85.5  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2939  carbonic anhydrase  30.21 
 
 		 269 aa  85.1  8e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.10436e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4235  Carbonate dehydratase  32.94 
 
 		 213 aa  85.1  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.200227 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26460  carbonic anhydrase  32.47 
 
 		 216 aa  84.7  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.111686  normal  0.310613 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0361  carbonic anhydrase  27.76 
 
 		 236 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.738606  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0965  carbonic anhydrase  31.98 
 
 		 230 aa  84.7  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000253307 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13920  Carbonate dehydratase  28.82 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000593664  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4745  carbonic anhydrase  35.04 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5131  carbonic anhydrase  35.04 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4831  carbonic anhydrase  35.04 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.7634 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09780  carbonic anhydrase  36.98 
 
 		 284 aa  82.4  0.000000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.550137 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0596  carbonic anhydrase  28.22 
 
 		 217 aa  82  0.000000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.179386  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3371  carbonate dehydratase  28.5 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2979  carbonic anhydrase-like  29.38 
 
 		 399 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.095103  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0010  Mig5  32.28 
 
 		 246 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3911  Carbonate dehydratase  32.35 
 
 		 213 aa  81.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.121235 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3958  carbonic anhydrase  27.73 
 
 		 250 aa  79.3  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.222966  normal  0.366344 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5682  Carbonate dehydratase  33.74 
 
 		 739 aa  79.3  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.555807  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>