60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0544 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0544  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  512  1e-144  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.240626  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2130  hypothetical protein  84.4 
 
 		 254 aa  434  1e-121  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.143043  normal  0.41065 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0917  SAM-dependent methyltransferase  59.92 
 
 		 248 aa  319  3e-86  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17731  hypothetical protein  59.5 
 
 		 248 aa  318  3.9999999999999996e-86  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.252781  normal  0.926498 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14001  hypothetical protein  66.5 
 
 		 206 aa  293  2e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.254784 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15071  hypothetical protein  51.52 
 
 		 247 aa  256  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1444  hypothetical protein  51.57 
 
 		 224 aa  241  9e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15321  hypothetical protein  51.8 
 
 		 224 aa  239  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.579815  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15471  hypothetical protein  51.8 
 
 		 224 aa  239  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.109184  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4288  hypothetical protein  50 
 
 		 247 aa  231  9e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2822  Methyltransferase type 11  45.61 
 
 		 247 aa  224  8e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3277  Methyltransferase type 11  45.61 
 
 		 247 aa  224  8e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3468  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  26.95 
 
 		 420 aa  53.9  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3149  glycosyl transferase family protein  30.1 
 
 		 753 aa  52  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  32.03 
 
 		 283 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.53 
 
 		 239 aa  50.1  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1427  methyltransferase type 12  31.13 
 
 		 251 aa  48.5  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1029  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 210 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.53 
 
 		 238 aa  48.1  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  25.85 
 
 		 282 aa  48.1  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3283  Methyltransferase type 11  35.19 
 
 		 252 aa  47.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48669  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32 
 
 		 246 aa  47.4  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3889  methyltransferase type 11  34.95 
 
 		 281 aa  47  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1216  methyltransferase type 11  26.49 
 
 		 510 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.218616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4011  methyltransferase type 12  30.95 
 
 		 317 aa  46.6  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.550687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  34.65 
 
 		 240 aa  46.2  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1574  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33 
 
 		 246 aa  46.2  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1091  Methyltransferase type 11  31.43 
 
 		 187 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2117  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.73 
 
 		 262 aa  45.4  0.0009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  29.55 
 
 		 274 aa  45.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1742  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.41 
 
 		 239 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0121  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.82 
 
 		 276 aa  45.1  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.83628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5502  Methyltransferase type 12  35.64 
 
 		 217 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.222085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0312  hypothetical protein  65.62 
 
 		 216 aa  45.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.121352 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.03 
 
 		 402 aa  44.3  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.280031  unclonable  0.0000000000741696 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.51 
 
 		 276 aa  44.3  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0329  hypothetical protein  29.27 
 
 		 414 aa  44.3  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0364813  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15760  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.83 
 
 		 232 aa  43.9  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4039  methyltransferase type 12  30 
 
 		 209 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.668919  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4072  Methyltransferase type 11  27.1 
 
 		 192 aa  43.9  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4654  Methyltransferase type 11  31.4 
 
 		 257 aa  43.5  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.302301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23220  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.78 
 
 		 232 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0574161  hitchhiker  0.00443225 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2393  Methyltransferase type 12  28 
 
 		 537 aa  43.9  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.21 
 
 		 280 aa  43.5  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1047  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34.45 
 
 		 403 aa  43.1  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.350309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1419  Methyltransferase type 11  30.6 
 
 		 256 aa  43.5  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2267  Methyltransferase type 11  24 
 
 		 208 aa  43.1  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1190  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25 
 
 		 241 aa  43.1  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1845  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.1 
 
 		 234 aa  43.1  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00431464  normal  0.756459 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3650  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.67 
 
 		 232 aa  42.7  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  24.04 
 
 		 392 aa  42.7  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0498  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 235 aa  42.7  0.006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1309  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.28 
 
 		 423 aa  42.4  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1462  Methyltransferase type 12  30.77 
 
 		 434 aa  42.4  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2828  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.53 
 
 		 252 aa  42.4  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0566454  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0429  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  65.38 
 
 		 764 aa  42.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2631  Methyltransferase type 12  29.13 
 
 		 399 aa  42  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4717  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.25 
 
 		 240 aa  42  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970873 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6701  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.5 
 
 		 223 aa  42  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2471  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  27.68 
 
 		 253 aa  42  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>