48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2190 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2190  F0F1 ATP synthase subunit B  100 
 
 		 160 aa  305  2.0000000000000002e-82  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0486  F0F1 ATP synthase subunit B  80.62 
 
 		 160 aa  241  1.9999999999999999e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.405146  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15721  F0F1 ATP synthase subunit B  56.13 
 
 		 171 aa  163  8e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0983  F0F1 ATP synthase subunit B  52.9 
 
 		 170 aa  159  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18511  F0F1 ATP synthase subunit B  52.9 
 
 		 170 aa  159  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04811  F0F1 ATP synthase subunit B  55.7 
 
 		 172 aa  156  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16431  F0F1 ATP synthase subunit B  46.15 
 
 		 170 aa  133  8e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1546  F0F1 ATP synthase subunit B  45.51 
 
 		 170 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16551  F0F1 ATP synthase subunit B  46.15 
 
 		 170 aa  132  3e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.513601  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16321  F0F1 ATP synthase subunit B  46.15 
 
 		 170 aa  131  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.339041  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0334  F0F1 ATP synthase subunit B  40 
 
 		 171 aa  105  4e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.603951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2718  F0F1 ATP synthase subunit B  38.06 
 
 		 178 aa  94.4  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3385  F0F1 ATP synthase subunit B  38.06 
 
 		 178 aa  94.4  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000169967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2621  ATP synthase F0, B subunit  40 
 
 		 179 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3336  ATP synthase F0 subunit B  38.71 
 
 		 180 aa  85.1  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1490  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  37.25 
 
 		 181 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0893456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2201  F0F1 ATP synthase subunit B  35.17 
 
 		 177 aa  70.5  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.357638  normal  0.24068 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2613  F0F1 ATP synthase subunit B  36.81 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.387005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2827  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  31.29 
 
 		 189 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0989  ATP synthase F0, B subunit  29.93 
 
 		 192 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0367033  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2169  F0F1 ATP synthase subunit B  22.88 
 
 		 156 aa  50.4  0.000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000388738  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  30.57 
 
 		 175 aa  48.9  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3711  F0F1 ATP synthase subunit B  30.57 
 
 		 196 aa  48.1  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  29.94 
 
 		 166 aa  46.2  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2748  F0F1 ATP synthase subunit B  27.11 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000265032  normal  0.27853 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2883  F0F1 ATP synthase subunit B  29.3 
 
 		 175 aa  46.2  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126633  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  31.65 
 
 		 168 aa  45.8  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1020  F0F1 ATP synthase subunit B  29.38 
 
 		 193 aa  45.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  26.75 
 
 		 162 aa  44.7  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3309  F0F1 ATP synthase subunit B  23.03 
 
 		 156 aa  44.3  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.384998  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3207  ATP synthase F0, B subunit  25.77 
 
 		 159 aa  43.9  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0472132  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2811  ATP synthase F0, B subunit  25.77 
 
 		 159 aa  43.9  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.182804  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2707  F0F1 ATP synthase subunit B  26.97 
 
 		 175 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  27.81 
 
 		 161 aa  43.1  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2489  F0F1 ATP synthase subunit B  29.3 
 
 		 175 aa  42.4  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305387  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06108  ATP synthase B chain  28.93 
 
 		 156 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4490  F0F1 ATP synthase subunit B  26.42 
 
 		 156 aa  42  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00698245  hitchhiker  0.00000569533 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4370  F0F1 ATP synthase subunit B  25.64 
 
 		 156 aa  41.6  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000255144  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0517  F0F1 ATP synthase subunit B  28.65 
 
 		 165 aa  41.6  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0641052  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2191  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  29.45 
 
 		 188 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  29.11 
 
 		 175 aa  41.2  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4511  F0F1 ATP synthase subunit B  25.64 
 
 		 156 aa  41.2  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00356652  normal  0.0257912 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4314  F0F1 ATP synthase subunit B  25.64 
 
 		 156 aa  41.2  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0812029  hitchhiker  0.0000000000716533 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4369  F0F1 ATP synthase subunit B  25.64 
 
 		 156 aa  41.2  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.011989  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3530  F0F1 ATP synthase subunit B  25.79 
 
 		 156 aa  40.8  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.037276 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3756  F0F1 ATP synthase subunit B  26.28 
 
 		 156 aa  40.8  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0289991  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0036  F0F1 ATP synthase subunit B  28.57 
 
 		 156 aa  40.8  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00144365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3849  F0F1 ATP synthase subunit B  25.64 
 
 		 156 aa  40.4  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.28383  hitchhiker  0.0000250407 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>