24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3292 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3292  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  270  4.0000000000000004e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.918096  hitchhiker  0.0000025592 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3172  hypothetical protein  89.15 
 
 		 129 aa  249  1e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.87367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1336  hypothetical protein  75 
 
 		 128 aa  211  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2646  hypothetical protein  82.17 
 
 		 129 aa  205  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.995481 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1469  hypothetical protein  71.09 
 
 		 128 aa  202  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0253681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1439  hypothetical protein  71.09 
 
 		 128 aa  202  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.925762  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1433  hypothetical protein  71.09 
 
 		 128 aa  202  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2914  hypothetical protein  70.31 
 
 		 128 aa  201  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0257108  normal  0.856074 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2894  hypothetical protein  74.05 
 
 		 131 aa  199  8e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0780795  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1259  hypothetical protein  67.19 
 
 		 128 aa  191  4e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.44122  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1128  hypothetical protein  64.34 
 
 		 129 aa  188  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.162296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2653  hypothetical protein  72.97 
 
 		 128 aa  185  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2720  hypothetical protein  72.97 
 
 		 128 aa  185  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2827  hypothetical protein  72.97 
 
 		 128 aa  185  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1543  hypothetical protein  60.94 
 
 		 128 aa  175  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1617  hypothetical protein  72.97 
 
 		 128 aa  169  7.999999999999999e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3187  hypothetical protein  28.57 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.207132  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0832  hypothetical protein  28.41 
 
 		 105 aa  49.3  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.191887  normal  0.109117 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0407  hypothetical protein  33.33 
 
 		 100 aa  47.8  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.135299  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002739  hypothetical protein  27.84 
 
 		 99 aa  47.4  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0446734  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03040  hypothetical protein  25.32 
 
 		 100 aa  44.3  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0686  hypothetical protein  35.62 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0890579  normal  0.814866 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2341  hypothetical protein  34.78 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3652  hypothetical protein  20.62 
 
 		 100 aa  40.4  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>