25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2390 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2390  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  100 
 
 		 373 aa  772    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.951238 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2234  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  60.5 
 
 		 377 aa  461  1e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3366  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  43.87 
 
 		 361 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.424876  normal  0.320471 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3572  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like  44.97 
 
 		 357 aa  301  2e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0154888  normal  0.0251545 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1074  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  28.37 
 
 		 358 aa  119  9e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0468  ABC transport protein  24.62 
 
 		 372 aa  92.8  8e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1208  extracellular solute-binding protein  24.23 
 
 		 366 aa  89  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.139759  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0492  transport protein  22.16 
 
 		 369 aa  73.9  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1360  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  28.93 
 
 		 377 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0349752 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3926  extracellular solute-binding protein  26.48 
 
 		 374 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.808306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4491  extracellular solute-binding protein  26.13 
 
 		 376 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4390  extracellular solute-binding protein  25.66 
 
 		 374 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.243685  normal  0.0624884 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5813  extracellular solute-binding protein  26.13 
 
 		 376 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3878  extracellular solute-binding protein  26.13 
 
 		 376 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3242  extracellular solute-binding protein  24.77 
 
 		 340 aa  56.2  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.532256  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3673  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  23.66 
 
 		 348 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5429  extracellular solute-binding protein  24.03 
 
 		 370 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal  0.485743 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5951  extracellular solute-binding protein family 1  26.47 
 
 		 382 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3955  twin-arginine translocation pathway signal  22.79 
 
 		 374 aa  47.4  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1048  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  24.28 
 
 		 345 aa  45.4  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00610599  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1035  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  23.7 
 
 		 345 aa  45.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000879227  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4308  extracellular solute-binding protein  22.98 
 
 		 369 aa  44.7  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00256094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4157  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 374 aa  44.3  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.194913  normal  0.672619 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2867  extracellular solute-binding protein  33.98 
 
 		 345 aa  43.5  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1361  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  32.05 
 
 		 431 aa  42.7  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.721333  normal  0.0486797 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>