20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1031 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1031  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  283  5e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000817032  normal  0.63467 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0982  hypothetical protein  63.71 
 
 		 139 aa  172  9e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0757327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0879  hypothetical protein  54.33 
 
 		 127 aa  149  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0133146  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0897  hypothetical protein  48.18 
 
 		 133 aa  142  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0111601  normal  0.417141 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3005  hypothetical protein  46.21 
 
 		 130 aa  130  5e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109936  normal  0.100935 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3086  hypothetical protein  46.21 
 
 		 130 aa  130  5e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000744436  normal  0.456635 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3593  hypothetical protein  47.29 
 
 		 127 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1011  hypothetical protein  45.11 
 
 		 137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00108871  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3183  hypothetical protein  46.21 
 
 		 130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0657806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1105  hypothetical protein  44.7 
 
 		 136 aa  123  7e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0528492  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1072  hypothetical protein  44.7 
 
 		 136 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00263359  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1003  hypothetical protein  43.94 
 
 		 136 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000302233  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3286  hypothetical protein  46.43 
 
 		 118 aa  120  7e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000912714  normal  0.19871 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2799  hypothetical protein  35.96 
 
 		 133 aa  95.1  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0708465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0549  peptidoglycan-binding LysM  26.72 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00118336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0153  hypothetical protein  29.2 
 
 		 126 aa  52  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.489061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3203  hypothetical protein  25 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.647543  normal  0.274146 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0820  hypothetical protein  25 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0772039  hitchhiker  0.0000156242 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3306  hypothetical protein  23.15 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0153759  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1424  hypothetical protein  23.08 
 
 		 146 aa  42  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259146  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>