30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0801 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0801  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 355 aa  740    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.940089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3781  hypothetical protein  73.58 
 
 		 381 aa  541  1e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0690  endonuclease/exonuclease/phosphatase  52.22 
 
 		 357 aa  382  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0327295  normal  0.622853 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1020  endonuclease/exonuclease/phosphatase  53.96 
 
 		 358 aa  374  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0969  endonuclease/exonuclease/phosphatase  49.16 
 
 		 377 aa  358  9e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1007  endonuclease/exonuclease/phosphatase  49.72 
 
 		 377 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.65557 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0973  endonuclease/exonuclease/phosphatase  49.16 
 
 		 377 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0818  endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.48 
 
 		 379 aa  353  2e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.823594  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1148  hypothetical protein  49.16 
 
 		 377 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2933  endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.45 
 
 		 396 aa  349  5e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3519  endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.51 
 
 		 398 aa  346  3e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.546474  normal  0.80442 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3394  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.33 
 
 		 402 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3298  endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.11 
 
 		 403 aa  341  1e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1308  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  47.73 
 
 		 410 aa  341  1e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1059  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.78 
 
 		 408 aa  340  2e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000904617 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3245  endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.03 
 
 		 377 aa  335  7e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0760  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.16 
 
 		 379 aa  318  7e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1331  hypothetical protein  44.19 
 
 		 338 aa  276  4e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2966  hypothetical protein  38.57 
 
 		 394 aa  247  2e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000220  hypothetical protein  42.94 
 
 		 317 aa  248  2e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05956  hypothetical protein  42.35 
 
 		 317 aa  246  4e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3683  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.66 
 
 		 346 aa  118  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3785  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.83 
 
 		 333 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1653  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.3 
 
 		 341 aa  90.9  3e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5372  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.68 
 
 		 352 aa  89.7  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.18295 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1043  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.93 
 
 		 341 aa  86.3  7e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000546658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5248  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.55 
 
 		 353 aa  85.9  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.284119  normal  0.61528 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1330  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  25.21 
 
 		 341 aa  85.9  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000015519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1438  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.37 
 
 		 374 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3704  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.83 
 
 		 322 aa  59.7  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>