13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0742 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0638  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  34.83 
 
 		 1407 aa  703    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.652963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0742  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  100 
 
 		 1355 aa  2733    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0714  hypothetical protein  33.85 
 
 		 1387 aa  610  1e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  30.57 
 
 		 2074 aa  68.2  0.0000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  31.19 
 
 		 1987 aa  60.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2032  hypothetical protein  39.23 
 
 		 1908 aa  58.2  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1858  IPT/TIG domain-containing protein  45.07 
 
 		 1081 aa  53.5  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0239021  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2574  LamG domain-containing protein  34.11 
 
 		 3861 aa  52.4  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1325  hypothetical protein  39.36 
 
 		 483 aa  50.8  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000125315 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00005  transcriptional regulator, AraC family with Parallel beta-helix repeat  39.36 
 
 		 8918 aa  50.4  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3066  hypothetical protein  35 
 
 		 3925 aa  48.5  0.0009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.455665 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5254  OmpA/MotB domain protein  35.42 
 
 		 1264 aa  47.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  33.78 
 
 		 14609 aa  47.8  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>