28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0342 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0342  sporulation domain-containing protein  100 
 
 		 464 aa  939    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4263  sporulation domain-containing protein  54.71 
 
 		 483 aa  480  1e-134  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.353854  normal  0.0664789 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0215  sporulation domain-containing protein  41.7 
 
 		 511 aa  366  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0241134 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0240  sporulation domain-containing protein  45.03 
 
 		 493 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000377836  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4001  Sporulation domain protein  41.56 
 
 		 482 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.512353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4200  sporulation domain-containing protein  42.24 
 
 		 483 aa  352  1e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0495455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4111  sporulation domain-containing protein  41.03 
 
 		 482 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.128924  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4082  sporulation domain-containing protein  41.92 
 
 		 483 aa  348  2e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3704  sporulation domain-containing protein  42.39 
 
 		 463 aa  339  5.9999999999999996e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.16262  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0288  DamX domain-containing protein  40.17 
 
 		 470 aa  338  9e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3892  sporulation domain-containing protein  40.93 
 
 		 471 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.598853  normal  0.606435 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3696  sporulation domain-containing protein  40.43 
 
 		 471 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.951592  normal  0.829888 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0249  sporulation domain-containing protein  41.42 
 
 		 464 aa  333  4e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.899829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0377  sporulation domain-containing protein  38.72 
 
 		 467 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22835  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3366  DamX domain-containing protein  36.99 
 
 		 512 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0263  sporulation related  46.83 
 
 		 511 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0840788  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2204  hypothetical protein  27.4 
 
 		 491 aa  76.3  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00510376  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002329  DamX-related protein  25.99 
 
 		 504 aa  71.6  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.116356  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00026  hypothetical protein  26.67 
 
 		 497 aa  69.3  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2724  putative cell division protein  24.1 
 
 		 505 aa  67.4  0.0000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3749  ATPase  27.2 
 
 		 271 aa  47.4  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0474  hypothetical protein  26.12 
 
 		 469 aa  47  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1924  hypothetical protein  24.84 
 
 		 414 aa  44.3  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.42704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0412  hypothetical protein  25.58 
 
 		 533 aa  44.3  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0974914  normal  0.234903 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2983  peptidoglycan binding domain-containing protein  23.19 
 
 		 557 aa  44.3  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0687  general secretion pathway protein-related protein  27.44 
 
 		 306 aa  43.5  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1354  hypothetical protein  30.77 
 
 		 382 aa  43.1  0.009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0537927  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0686  general secretion pathway protein-related protein  27.44 
 
 		 306 aa  43.1  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.731417  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>