68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2454 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2454  uridylate kinase  100 
 
 		 277 aa  563  1.0000000000000001e-159  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2394  aspartate/glutamate/uridylate kinase  57.82 
 
 		 276 aa  338  5e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0277  aspartate/glutamate/uridylate kinase  52.84 
 
 		 286 aa  273  2.0000000000000002e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.366502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0932  putative uridylate kinase  46.77 
 
 		 268 aa  263  2e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1890  aspartate/glutamate/uridylate kinase  44.53 
 
 		 268 aa  260  2e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2386  uridylate kinase  47.55 
 
 		 268 aa  259  4e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.802310000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0348  aspartate/glutamate/uridylate kinase  50.59 
 
 		 279 aa  257  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0355  aspartate/glutamate/uridylate kinase  50.59 
 
 		 279 aa  257  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1531  aspartate/glutamate/uridylate kinase  46.77 
 
 		 268 aa  249  3e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.215337  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2625  aspartate/glutamate/uridylate kinase  44.53 
 
 		 268 aa  248  8e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0024261  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0516  aspartate/glutamate/uridylate kinase  45.69 
 
 		 271 aa  248  8e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.316838  normal  0.700434 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1574  aspartate/glutamate/uridylate kinase  45 
 
 		 270 aa  248  1e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0638  aspartate/glutamate/uridylate kinase  45.77 
 
 		 270 aa  246  3e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3843  molybdenum storage protein beta subunit  44.53 
 
 		 270 aa  244  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43210  Molybdenum storage protein beta subunit, MosB  49.15 
 
 		 258 aa  243  3e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1627  aspartate/glutamate/uridylate kinase  44.62 
 
 		 270 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2956  aspartate/glutamate/uridylate kinase  43.68 
 
 		 270 aa  240  2e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0593  aspartate/glutamate/uridylate kinase  45.77 
 
 		 286 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0949  aspartate/glutamate/uridylate kinase  44.53 
 
 		 269 aa  237  1e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.560652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1693  aspartate/glutamate/uridylate kinase  41.73 
 
 		 270 aa  228  1e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0354  aspartate/glutamate/uridylate kinase  40.82 
 
 		 277 aa  209  4e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0347  aspartate/glutamate/uridylate kinase  40.82 
 
 		 277 aa  209  5e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0688  hypothetical protein  41.13 
 
 		 273 aa  198  6e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.512522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0637  aspartate/glutamate/uridylate kinase  34.59 
 
 		 277 aa  172  5e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2954  aspartate/glutamate/uridylate kinase  35.85 
 
 		 298 aa  170  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0592  aspartate/glutamate/uridylate kinase  34.85 
 
 		 276 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.719802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1575  aspartate/glutamate/uridylate kinase  36.36 
 
 		 277 aa  169  6e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0950  aspartate/glutamate/uridylate kinase  34.93 
 
 		 277 aa  168  7e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.406129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1694  aspartate/glutamate/uridylate kinase  32.45 
 
 		 277 aa  167  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1626  aspartate/glutamate/uridylate kinase  34.47 
 
 		 273 aa  165  9e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43200  Molybdenum storage protein subunit A  34.47 
 
 		 276 aa  163  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3842  molybdenum storage protein alpha subunit  34.09 
 
 		 276 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1763  uridylate kinase  24.37 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.538162 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0707  uridylate kinase  25.69 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000200842 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1191  uridylate kinase  26.87 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1400  uridylate kinase  24.9 
 
 		 255 aa  55.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12897  uridylate kinase  30.77 
 
 		 261 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4124  uridylate kinase  29.81 
 
 		 247 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1540  uridylate kinase  28.32 
 
 		 266 aa  52.4  0.000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.3492 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0405  uridylate kinase  30.56 
 
 		 235 aa  49.7  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.899064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2220  uridylate kinase  29.81 
 
 		 251 aa  48.9  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.118147  normal  0.160064 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09910  uridylate kinase  28.85 
 
 		 250 aa  48.5  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1673  uridylate kinase  29.81 
 
 		 252 aa  48.1  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1317  aspartate kinase  32.1 
 
 		 406 aa  46.6  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.573615  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1569  uridylate kinase  23.46 
 
 		 234 aa  46.2  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2351  uridylate kinase  29.81 
 
 		 236 aa  46.6  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.164432  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1274  uridylate kinase  27.22 
 
 		 239 aa  45.8  0.0007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.315976  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2110  uridylate kinase  26.92 
 
 		 246 aa  45.8  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0810  uridylate kinase  28.3 
 
 		 243 aa  45.8  0.0009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.128283  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5909  uridylate kinase  29.81 
 
 		 263 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.166242  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  31.73 
 
 		 245 aa  45.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0426  uridylate kinase  29.13 
 
 		 239 aa  45.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.777884  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1984  uridylate kinase  28.85 
 
 		 252 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08491  gamma-glutamyl kinase  28.83 
 
 		 360 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.768779  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1919  uridylate kinase  28.02 
 
 		 239 aa  44.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08521  gamma-glutamyl kinase  28.83 
 
 		 360 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2049  uridylate kinase  28.85 
 
 		 287 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2008  uridylate kinase  29.81 
 
 		 236 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2046  uridylate kinase  25.91 
 
 		 239 aa  44.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.198854  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2003  uridylate kinase  28.85 
 
 		 252 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0344  gamma-glutamyl kinase  24.69 
 
 		 376 aa  44.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000011704  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2844  uridylate kinase  28.57 
 
 		 234 aa  43.9  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000917545  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0518  uridylate kinase, putative  27.6 
 
 		 232 aa  43.5  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1646  uridylate kinase  28.3 
 
 		 239 aa  43.5  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1252  uridylate kinase  25.31 
 
 		 239 aa  43.1  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000157297  hitchhiker  0.0010531 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0744  uridylate kinase  24.12 
 
 		 225 aa  43.1  0.006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0705972  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1382  uridylate kinase  25.86 
 
 		 263 aa  42.7  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.1666  normal  0.0472283 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1744  uridylate kinase  30.77 
 
 		 238 aa  42.7  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>