34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1971 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1971  hypothetical protein  100 
 
 
103 aa  203  6e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.866936  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1691  plasmid stabilization system  82.52 
 
 
103 aa  177  5.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13720  addiction module toxin, RelE/StbE family  43.14 
 
 
103 aa  69.3  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000898727  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4492  addiction module toxin, RelE/StbE family  37.25 
 
 
106 aa  68.6  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000251401  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3876  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.24 
 
 
102 aa  59.7  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3300  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.92 
 
 
107 aa  52.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000161062  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1043  plasmid stabilization system  40.2 
 
 
109 aa  53.5  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.222943  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4125  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.29 
 
 
100 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000028611  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2205  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.61 
 
 
104 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000157964  hitchhiker  0.00000000176055 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0649  plasmid stabilization system  29.7 
 
 
102 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000217975  unclonable  0.000000000111993 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0926  prophage LambdaSa04, RelE/ParE family protein  32.97 
 
 
100 aa  49.3  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0629  plasmid stabilization system  28.71 
 
 
102 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000313345  unclonable  0.0000000000769926 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1411  hypothetical protein  34.31 
 
 
109 aa  48.5  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0345542  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0496  hypothetical protein  33.67 
 
 
102 aa  48.5  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.693106  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2208  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.01 
 
 
107 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000269214  unclonable  0.00000000006105 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1487  plasmid stabilization system protein  32.08 
 
 
107 aa  47.8  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5558  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.77 
 
 
107 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15873  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0577  hypothetical protein  36.11 
 
 
74 aa  47  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000459224  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0570  plasmid stabilization system  33.33 
 
 
108 aa  45.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0151  hypothetical protein  33.68 
 
 
112 aa  45.1  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000158576  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02600  hypothetical protein  34 
 
 
100 aa  44.3  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003262  plasmid stabilization system protein  33 
 
 
100 aa  43.9  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0531  hypothetical protein  35.24 
 
 
112 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.681359  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0677  plasmid stabilization system protein  32.04 
 
 
108 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.781878 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2186  plasmid stabilization system protein  34.91 
 
 
109 aa  41.6  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1668  plasmid stabilization system  32.71 
 
 
110 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.106027 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0757  hypothetical protein  26.92 
 
 
112 aa  41.2  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5833  plasmid stabilization system protein  31.07 
 
 
105 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.24244  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0849  hypothetical protein  34 
 
 
100 aa  41.2  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0750  plasmid stabilization system protein  32.71 
 
 
110 aa  40.8  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0654  plasmid stabilization system toxin protein  26.92 
 
 
112 aa  40.8  0.006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0757  hypothetical protein  34 
 
 
100 aa  40.8  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2937  plasmid stabilization system  28.85 
 
 
106 aa  40.4  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2653  hypothetical protein  31.63 
 
 
111 aa  40.4  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>