82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5357 on replicon NC_009507
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009507  Swit_5357  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  336  9e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.831164 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3673  hypothetical protein  47.62 
 
 		 153 aa  119  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0544  hypothetical protein  47.86 
 
 		 128 aa  117  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0606  hypothetical protein  47.62 
 
 		 153 aa  116  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0571  hypothetical protein  47.62 
 
 		 153 aa  116  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4735  hypothetical protein  50 
 
 		 151 aa  114  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1754  hypothetical protein  44.44 
 
 		 151 aa  114  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.113582  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2237  hypothetical protein  42.66 
 
 		 149 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.483595  normal  0.0351044 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3035  hypothetical protein  49.12 
 
 		 143 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0408489  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1293  hypothetical protein  46.55 
 
 		 150 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00206734 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2417  hypothetical protein  47.37 
 
 		 143 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.000693417  normal  0.14669 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1385  hypothetical protein  44.83 
 
 		 151 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.497809  normal  0.308816 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2179  hypothetical protein  42.86 
 
 		 143 aa  99.4  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0449499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0930  hypothetical protein  43.36 
 
 		 151 aa  99  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.849799 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2439  hypothetical protein  44.92 
 
 		 146 aa  97.1  9e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0760053  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6673  hypothetical protein  38.1 
 
 		 170 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.975454  normal  0.699702 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1714  hypothetical protein  46.09 
 
 		 146 aa  97.1  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.671018  normal  0.409198 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3981  hypothetical protein  42.98 
 
 		 139 aa  92.8  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0881431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3573  hypothetical protein  41.67 
 
 		 154 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.717578 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3537  hypothetical protein  46.43 
 
 		 142 aa  91.3  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3863  hypothetical protein  41.94 
 
 		 181 aa  90.5  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3024  hypothetical protein  40.34 
 
 		 149 aa  89  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3844  protein of unknown function DUF983  43.64 
 
 		 163 aa  89  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0754377 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1352  hypothetical protein  40.35 
 
 		 145 aa  85.9  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.27643  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2381  hypothetical protein  41.35 
 
 		 165 aa  84.7  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2658  protein of unknown function DUF983  41.35 
 
 		 165 aa  84.7  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2074  hypothetical protein  41.59 
 
 		 136 aa  84.7  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0271122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0418  hypothetical protein  41.59 
 
 		 136 aa  84.7  6e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2829  hypothetical protein  41.07 
 
 		 141 aa  83.2  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.162886  normal  0.543485 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2342  hypothetical protein  41.32 
 
 		 136 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.000430301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2338  protein of unknown function DUF983  43.75 
 
 		 145 aa  82.4  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.749275  normal  0.454228 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3136  hypothetical protein  38.32 
 
 		 137 aa  80.1  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.932871  normal  0.247414 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7412  protein of unknown function DUF983  41.44 
 
 		 171 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00641789  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2821  hypothetical protein  39.64 
 
 		 132 aa  77.8  0.00000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.641842  normal  0.332013 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0724  hypothetical protein  36.28 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.123547 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0674  hypothetical protein  32.06 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.722288 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0609  protein of unknown function DUF983  35.35 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0027  hypothetical protein  36.36 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.431177  normal  0.352354 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0587  hypothetical protein  35.35 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.017099  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3453  protein of unknown function DUF983  36.36 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.412881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2343  hypothetical protein  35.19 
 
 		 122 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.76851  normal  0.642219 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4642  hypothetical protein  35.35 
 
 		 128 aa  62  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.242788  normal  0.0997926 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0266  protein of unknown function DUF983  37.25 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.550192  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0563  hypothetical protein  32.32 
 
 		 147 aa  62  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3581  protein of unknown function DUF983  35.35 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3257  hypothetical protein  35.35 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0865368 
 
 
-
 
NC_004310  BR0473  hypothetical protein  32.43 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0478  cytochrome c oxidase, subunit III  33.33 
 
 		 439 aa  61.6  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.152736  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1169  hypothetical protein  36.67 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.446143  normal  0.052337 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0649  protein of unknown function DUF983  34.34 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.643544  normal  0.177978 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0525  hypothetical protein  30.39 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1973  hypothetical protein  29.75 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4734  protein of unknown function DUF983  30.17 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1249  protein of unknown function DUF983  30.3 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0767  hypothetical protein  32.71 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.12977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0390  hypothetical protein  33.33 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.351536 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4793  hypothetical protein  33.05 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1611  hypothetical protein  31.68 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.991152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2074  hypothetical protein  29.17 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.148673  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6977  protein of unknown function DUF983  30.7 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.906063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0908  protein of unknown function DUF983  30.69 
 
 		 122 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1558  protein of unknown function DUF983  31.68 
 
 		 130 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.602074  normal  0.0157873 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3457  hypothetical protein  31.78 
 
 		 129 aa  53.9  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.85085  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0261  hypothetical protein  31.78 
 
 		 129 aa  53.9  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4500  hypothetical protein  33.67 
 
 		 125 aa  52.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  0.323308 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3291  hypothetical protein  31.31 
 
 		 135 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1055  protein of unknown function DUF983  29.7 
 
 		 122 aa  52.4  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0431012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2765  hypothetical protein  33.01 
 
 		 147 aa  51.6  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.934534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0415  hypothetical protein  29.03 
 
 		 162 aa  51.2  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.363772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0159  hypothetical protein  35.92 
 
 		 147 aa  51.2  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.595754  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2484  hypothetical protein  31.31 
 
 		 132 aa  50.1  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.159149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1046  hypothetical protein  29.36 
 
 		 126 aa  49.7  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.52629  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4592  protein of unknown function DUF983  30 
 
 		 147 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0893278 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4222  hypothetical protein  30 
 
 		 168 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.867791 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4582  hypothetical protein  31.19 
 
 		 132 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.67774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0820  hypothetical protein  30.58 
 
 		 130 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.478279 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3881  hypothetical protein  32.1 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.868081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2228  hypothetical protein  27.27 
 
 		 119 aa  46.6  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.519289  normal  0.0128796 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4739  protein of unknown function DUF983  27.52 
 
 		 143 aa  45.1  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0123069 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0834  hypothetical protein  38.1 
 
 		 129 aa  44.7  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.833113 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0905  protein of unknown function DUF983  39.34 
 
 		 131 aa  44.3  0.0009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6945  protein of unknown function DUF983  43.75 
 
 		 134 aa  42.4  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>