18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5123 on replicon NC_009507
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009507  Swit_5123  transposase  100 
 
 		 89 aa  186  9e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5067  transposase Tn3 family protein  91.01 
 
 		 969 aa  174  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0388929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1095  putative transposase  65.17 
 
 		 332 aa  125  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0110923 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3698  transposase Tn3 family protein  65.85 
 
 		 974 aa  123  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0861191  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2112  transposase Tn3 family protein  59.52 
 
 		 988 aa  117  7e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3695  transposase Tn3 family protein  58.54 
 
 		 969 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5222  transposase Tn3 family protein  57.14 
 
 		 412 aa  107  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2367  transposase Tn3  57.3 
 
 		 815 aa  106  8.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.462352 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3661  transposase Tn3 family protein  54.12 
 
 		 950 aa  102  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3614  transposase Tn3 family protein  45.88 
 
 		 1009 aa  84.7  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0217  hypothetical protein  44.71 
 
 		 209 aa  84.7  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0025  transposase Tn3 family protein  37.78 
 
 		 1006 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0079  transposase Tn3 family protein  37.78 
 
 		 1006 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.147171 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00240  transposase  37.65 
 
 		 212 aa  47  0.00009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  34.09 
 
 		 1006 aa  46.6  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  32.05 
 
 		 999 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0088  transposase  33.33 
 
 		 771 aa  41.6  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.560561 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02944  Tn5044 transposase  30.12 
 
 		 990 aa  40.4  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0926862  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>