More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2829 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_2829  dephospho-CoA kinase  100 
 
 
202 aa  399  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0960542 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2839  dephospho-CoA kinase  65.26 
 
 
207 aa  241  6e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0481374 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0114  dephospho-CoA kinase  58.67 
 
 
201 aa  218  3.9999999999999997e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1488  dephospho-CoA kinase  54.64 
 
 
217 aa  186  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0833932  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3481  dephospho-CoA kinase  51.28 
 
 
194 aa  185  5e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.286559  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1766  dephospho-CoA kinase  54.12 
 
 
217 aa  184  8e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.294685  normal  0.215779 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0850  dephospho-CoA kinase  50.76 
 
 
222 aa  177  8e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0397  dephospho-CoA kinase  48.44 
 
 
199 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0302  dephospho-CoA kinase  48.96 
 
 
199 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.747826  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5012  dephospho-CoA kinase  52.82 
 
 
207 aa  172  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0195  dephospho-CoA kinase  52.38 
 
 
194 aa  171  5e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2070  dephospho-CoA kinase  48.73 
 
 
200 aa  169  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0114  dephospho-CoA kinase  48.69 
 
 
199 aa  168  4e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.147885  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3212  dephospho-CoA kinase  48.98 
 
 
194 aa  168  5e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1990  dephospho-CoA kinase  47.45 
 
 
200 aa  168  6e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1488  dephospho-CoA kinase  53.33 
 
 
206 aa  167  8e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0808878  normal  0.0946842 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0424  dephospho-CoA kinase  46.32 
 
 
199 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1830  dephospho-CoA kinase  51.76 
 
 
200 aa  166  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.037258 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1253  dephospho-CoA kinase  47.45 
 
 
208 aa  166  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0104  dephospho-CoA kinase  49.74 
 
 
199 aa  164  8e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.118217 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0159  dephospho-CoA kinase  47.12 
 
 
199 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1034  dephospho-CoA kinase  51.81 
 
 
204 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.108495  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3197  dephospho-CoA kinase  52.27 
 
 
211 aa  161  5.0000000000000005e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.189898  normal  0.0250351 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2538  dephospho-CoA kinase  49.73 
 
 
201 aa  160  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0005  dephospho-CoA kinase  47.15 
 
 
195 aa  158  6e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1276  dephospho-CoA kinase  50.78 
 
 
207 aa  158  6e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40654  predicted protein  47.37 
 
 
201 aa  156  2e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.114893  normal  0.0526833 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2814  dephospho-CoA kinase  56.21 
 
 
198 aa  154  7e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2672  dephospho-CoA kinase  47.31 
 
 
197 aa  154  8e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.152116  normal  0.348643 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4284  dephospho-CoA kinase  53.65 
 
 
212 aa  150  8e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00917274 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4264  dephospho-CoA kinase  45.92 
 
 
203 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.914249  normal  0.426289 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3449  dephospho-CoA kinase  44.5 
 
 
198 aa  149  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0296  dephospho-CoA kinase  46.35 
 
 
199 aa  148  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3385  dephospho-CoA kinase  50 
 
 
204 aa  147  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.31936 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2896  dephospho-CoA kinase  45.16 
 
 
197 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0215113  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1235  dephospho-CoA kinase  45.16 
 
 
197 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3612  dephospho-CoA kinase  52.84 
 
 
229 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2977  dephospho-CoA kinase  43.88 
 
 
200 aa  143  1e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3938  dephospho-CoA kinase  44.39 
 
 
203 aa  143  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.39098  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0005  dephospho-CoA kinase  39.69 
 
 
200 aa  134  7.000000000000001e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00364709  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2760  dephospho-CoA kinase  48.96 
 
 
215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2859  dephospho-CoA kinase  42.94 
 
 
197 aa  128  5.0000000000000004e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.68987  normal  0.490957 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0189  dephospho-CoA kinase  38.89 
 
 
208 aa  109  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0529  dephospho-CoA kinase  36.27 
 
 
206 aa  108  7.000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1420  dephospho-CoA kinase  38.05 
 
 
218 aa  107  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2472  dephospho-CoA kinase  38.38 
 
 
200 aa  102  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.73797e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3709  dephospho-CoA kinase  39.43 
 
 
207 aa  102  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0757  dephospho-CoA kinase  40.51 
 
 
211 aa  100  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000263981  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1583  dephospho-CoA kinase  40.22 
 
 
192 aa  100  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.311661  normal  0.292339 
 
 
-
 
NC_002978  WD0185  kinase, putative  33.68 
 
 
195 aa  100  2e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1245  dephospho-CoA kinase  32.83 
 
 
199 aa  99.8  3e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000344021  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1022  dephospho-CoA kinase  34.5 
 
 
204 aa  98.6  6e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0506  dephospho-CoA kinase  37.31 
 
 
207 aa  97.4  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0667373 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4223  dephospho-CoA kinase  39.18 
 
 
201 aa  97.4  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.254941  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2671  dephospho-CoA kinase  35.18 
 
 
199 aa  97.4  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177736  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2184  dephospho-CoA kinase  32.67 
 
 
205 aa  97.1  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000448141  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2215  dephospho-CoA kinase  36.76 
 
 
207 aa  96.3  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4316  dephospho-CoA kinase  38.14 
 
 
211 aa  97.1  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0789  dephospho-CoA kinase  37.69 
 
 
201 aa  97.1  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4694  dephospho-CoA kinase  35.98 
 
 
200 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000280087  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3462  dephospho-CoA kinase  28.16 
 
 
198 aa  96.3  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0035973  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2684  dephospho-CoA kinase  37.69 
 
 
211 aa  95.1  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4715  dephospho-CoA kinase  36.22 
 
 
200 aa  95.1  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000225461  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0544  dephospho-CoA kinase  35.45 
 
 
200 aa  94.7  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000847962  hitchhiker  1.1531e-16 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2675  dephospho-CoA kinase  41.08 
 
 
210 aa  94.7  8e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597099  normal  0.0402246 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0277  dephospho-CoA kinase  32.2 
 
 
200 aa  94.4  1e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09488  putative dephospho-CoA kinase  29.23 
 
 
197 aa  93.2  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3656  dephospho-CoA kinase  38.55 
 
 
204 aa  93.6  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.248965  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4314  dephospho-CoA kinase  34.38 
 
 
200 aa  93.2  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000130257  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4709  dephospho-CoA kinase  34.92 
 
 
201 aa  92.4  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000925481  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0020  dephospho-CoA kinase  35.1 
 
 
220 aa  92.4  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2226  dephospho-CoA kinase  35.11 
 
 
202 aa  92  5e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000129832  normal  0.59943 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0513  dephospho-CoA kinase  39.44 
 
 
197 aa  91.7  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167933  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4479  dephospho-CoA kinase  33.85 
 
 
200 aa  91.7  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0168528  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0677  dephospho-CoA kinase  29.47 
 
 
297 aa  91.7  7e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.347634  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4828  dephospho-CoA kinase  33.85 
 
 
200 aa  91.7  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000028193  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2728  dephospho-CoA kinase  34.72 
 
 
202 aa  91.7  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.652095  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2367  dephospho-CoA kinase  37.89 
 
 
202 aa  91.3  8e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2777  dephospho-CoA kinase  36.04 
 
 
211 aa  91.3  8e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.03803  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4414  dephospho-CoA kinase  34.22 
 
 
200 aa  91.3  9e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3660  dephospho-CoA kinase  36.78 
 
 
202 aa  90.9  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528577  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4699  dephospho-CoA kinase  32.99 
 
 
200 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3423e-36 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1788  dephospho-CoA kinase  35.35 
 
 
202 aa  90.5  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1419  dephospho-CoA kinase  33.33 
 
 
198 aa  90.5  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000153204  hitchhiker  0.000000000230419 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2870  dephospho-CoA kinase  36.55 
 
 
211 aa  90.9  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4180  dephospho-CoA kinase  37.7 
 
 
204 aa  89.7  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.376004  unclonable  0.000000000202737 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2187  dephospho-CoA kinase  39.53 
 
 
203 aa  90.5  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.724848  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2023  dephospho-CoA kinase  34.44 
 
 
206 aa  89.7  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2023  dephospho-CoA kinase  38.27 
 
 
210 aa  89  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0993224  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0417  dephospho-CoA kinase  32.8 
 
 
205 aa  89  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1121  dephospho-CoA kinase  29.23 
 
 
198 aa  88.6  6e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.22108  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1838  dephospho-CoA kinase  35.79 
 
 
212 aa  88.6  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.329616  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1427  dephospho-CoA kinase  31.03 
 
 
194 aa  88.6  6e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.355175  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4325  dephospho-CoA kinase  33.86 
 
 
200 aa  88.2  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00383074  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0828  dephospho-CoA kinase  42.86 
 
 
219 aa  88.2  8e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0501  dephospho-CoA kinase  35.23 
 
 
200 aa  87.8  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.197247 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2093  dephospho-CoA kinase  41.21 
 
 
198 aa  87.4  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0503  dephospho-CoA kinase  36.21 
 
 
202 aa  87.4  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.206836  normal  0.43555 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0183  dephospho-CoA kinase  32.81 
 
 
206 aa  87.8  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.26164  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2828  dephospho-CoA kinase  37.43 
 
 
204 aa  87  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103932  normal  0.134526 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>