38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2749 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2749  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  261  2e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.495938 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0606  glyoxalase family protein  57.6 
 
 		 130 aa  156  9e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.114771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4457  hypothetical protein  51.59 
 
 		 119 aa  123  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.720982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1377  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  49.21 
 
 		 120 aa  104  4e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6151  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.09 
 
 		 118 aa  102  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.606403  normal  0.343074 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0588  hypothetical protein  48.41 
 
 		 127 aa  101  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4341  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.41 
 
 		 141 aa  95.1  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0402058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1060  hypothetical protein  38.28 
 
 		 123 aa  92.4  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0670433  normal  0.188198 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03735  glyoxalase  39.85 
 
 		 128 aa  89.7  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494145  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0792  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.88 
 
 		 128 aa  85.9  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.379546  normal  0.0722466 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1042  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.06 
 
 		 140 aa  83.6  9e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.129945 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2769  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.69 
 
 		 125 aa  83.2  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2245  glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase family protein  34.92 
 
 		 115 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589372  hitchhiker  0.000106854 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1617  hypothetical protein  37.88 
 
 		 127 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000562608  decreased coverage  0.000000795999 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2179  hypothetical protein  42.64 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000382039  normal  0.0298403 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3030  hypothetical protein  33.33 
 
 		 115 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0736667  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2166  lactoylglutathione lyase  37.21 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6298  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.62 
 
 		 125 aa  77.4  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1461  hypothetical protein  36.72 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000145947  unclonable  0.0000259601 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2772  hypothetical protein  38.76 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000034854  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1586  hypothetical protein  38.76 
 
 		 128 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000390951  hitchhiker  0.0000000000775525 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2867  hypothetical protein  38.76 
 
 		 128 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00121266  normal  0.675776 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2822  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.15 
 
 		 136 aa  75.9  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0875651  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2792  hypothetical protein  38.76 
 
 		 128 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000962258  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1449  hypothetical protein  36.72 
 
 		 128 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745945  unclonable  0.0000000000491458 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2762  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.74 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.132325  normal  0.78823 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2471  hypothetical protein  36.84 
 
 		 128 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000395628  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2437  hypothetical protein  36.43 
 
 		 128 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000639887  hitchhiker  0.000966367 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1396  hypothetical protein  35.16 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000125062  unclonable  0.0000000000128265 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1459  putative glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase superfamily protein  36.5 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3038  hypothetical protein  33.33 
 
 		 128 aa  72  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000260642  normal  0.0188377 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3100  hypothetical protein  35.11 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3411  hypothetical protein  38.06 
 
 		 124 aa  66.6  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.111796  normal  0.118068 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2973  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48 
 
 		 141 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.196846  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3805  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.54 
 
 		 311 aa  41.6  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00564691 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3078  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48 
 
 		 141 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0313  hypothetical protein  33.59 
 
 		 161 aa  40.4  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.783426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1440  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.41 
 
 		 297 aa  40  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.946299 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>