More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2595 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_4405  NAD synthetase  62.26 
 
 
690 aa  811    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.863566  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2533  NAD synthetase  57.33 
 
 
691 aa  754    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2679  NAD synthetase  59.7 
 
 
686 aa  794    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12465  NAD synthetase  59.58 
 
 
738 aa  795    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000230879  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2610  NAD synthetase  54.79 
 
 
682 aa  737    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3271  NAD(+) synthase (glutamine-hydrolyzing)  61.09 
 
 
682 aa  800    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5214  NAD+ synthetase  60.53 
 
 
680 aa  813    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0536681  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3633  NAD+ synthetase  56.53 
 
 
704 aa  760    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400497  hitchhiker  0.00213692 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2095  NAD synthetase  51.75 
 
 
714 aa  697    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3548  NAD synthetase  59.02 
 
 
680 aa  804    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3909  NAD synthase  54.81 
 
 
678 aa  695    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28360  NAD synthase  48.53 
 
 
846 aa  664    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.455485  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2169  NAD synthetase  53.86 
 
 
685 aa  715    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0634324  hitchhiker  0.00000227772 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4517  NAD synthetase  61.8 
 
 
690 aa  809    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.516148 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0919  NAD synthetase  51.88 
 
 
802 aa  650    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4914  NAD synthetase  62.92 
 
 
683 aa  826    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4906  NAD synthetase  62.8 
 
 
679 aa  791    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0664942  hitchhiker  0.00795147 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0680  NAD synthetase  53.87 
 
 
716 aa  720    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.576503 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3543  NAD synthetase  59.02 
 
 
680 aa  804    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4206  NAD synthetase  65.63 
 
 
681 aa  860    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3750  NAD synthetase  59.94 
 
 
699 aa  776    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0534527 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0483  NAD+ synthetase  61.96 
 
 
679 aa  837    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2595  NAD synthetase  100 
 
 
687 aa  1392    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.649167  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2204  NAD synthetase  60.21 
 
 
692 aa  802    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0453723  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1782  NAD+ synthetase  61.86 
 
 
686 aa  789    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0217619 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2164  NAD synthetase  51.38 
 
 
689 aa  689    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2642  NAD synthetase  59.02 
 
 
680 aa  795    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309043  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0979  NAD synthetase  60.92 
 
 
678 aa  792    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.989674  normal  0.179553 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1103  NAD synthetase  59.59 
 
 
684 aa  787    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.635077 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4035  NAD synthetase  61.96 
 
 
690 aa  806    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0650104 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2044  NAD synthetase  60.59 
 
 
681 aa  808    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3616  NAD synthetase  59.02 
 
 
680 aa  804    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.4812  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3940  NAD synthetase  59.47 
 
 
680 aa  800    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381812  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2890  NAD synthetase  63.24 
 
 
679 aa  839    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1200  NAD synthetase  46.19 
 
 
642 aa  583  1.0000000000000001e-165  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0325  NAD synthetase  45.67 
 
 
645 aa  576  1.0000000000000001e-163  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0404544  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2216  NAD synthetase  46.38 
 
 
652 aa  551  1e-155  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808702  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1314  NAD synthetase  42.38 
 
 
635 aa  519  1e-146  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103341  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1130  NAD synthetase  41.93 
 
 
635 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0531  NAD synthetase  41.41 
 
 
647 aa  507  9.999999999999999e-143  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3426  NAD+ synthetase  40.21 
 
 
647 aa  487  1e-136  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0182  NAD+ synthetase  42.36 
 
 
676 aa  478  1e-133  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0620  NAD+ synthetase  40.77 
 
 
644 aa  425  1e-117  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.232331  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0507  NAD+ synthetase  30.19 
 
 
600 aa  281  3e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1400  NAD synthetase  31.7 
 
 
650 aa  277  5e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3480  NAD+ synthetase  30.73 
 
 
587 aa  185  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0342868  normal  0.0247199 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1518  NAD synthetase  29.47 
 
 
576 aa  177  7e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1567  NAD synthetase  29.3 
 
 
576 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0951  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  28.42 
 
 
566 aa  172  3e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1558  NAD+ synthetase  25.81 
 
 
573 aa  171  6e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0286387  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1122  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  27.93 
 
 
566 aa  170  7e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.049761  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0876  NAD+ synthetase  32.54 
 
 
554 aa  168  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0767  NAD+ synthetase  27.13 
 
 
583 aa  167  5e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.296939  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_940  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  27.93 
 
 
566 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1290  NAD synthetase  27.69 
 
 
538 aa  160  5e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.279167 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2360  NAD+ synthetase  28.05 
 
 
564 aa  160  8e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.869499  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2763  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  29.97 
 
 
577 aa  157  7e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0150  NAD+ synthetase  27.77 
 
 
543 aa  151  4e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1761  NAD+ synthetase  29.66 
 
 
554 aa  145  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2309  NAD+ synthetase  26.69 
 
 
562 aa  144  6e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0449  NAD+ synthetase  28.99 
 
 
556 aa  144  7e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.270974 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11920  glutamine-dependent NAD+ synthase  28.9 
 
 
556 aa  142  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1036  NAD+ synthetase  26.66 
 
 
558 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0925  NAD+ synthetase  28.73 
 
 
590 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1869  NAD+ synthetase  26.07 
 
 
575 aa  140  4.999999999999999e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0461361  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1524  NAD+ synthetase  26.73 
 
 
559 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.14105 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3650  NAD synthetase  26.07 
 
 
540 aa  140  6e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0311  NAD+ synthetase  30.21 
 
 
567 aa  140  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1699  NAD+ synthetase  28.28 
 
 
561 aa  139  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100102  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1961  NAD+ synthetase  29.21 
 
 
554 aa  139  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0553  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  28.05 
 
 
577 aa  138  4e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.795829  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1045  NAD+ synthetase  26.77 
 
 
658 aa  137  6.0000000000000005e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.700176  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1154  NAD synthetase  25.28 
 
 
540 aa  137  7.000000000000001e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3630  NAD synthetase  25.28 
 
 
540 aa  137  7.000000000000001e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1261  NAD synthetase  25.28 
 
 
540 aa  137  7.000000000000001e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.143958  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0640  NAD+ synthetase  24.7 
 
 
700 aa  137  8e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0635505 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3297  NAD+ synthetase  27.38 
 
 
599 aa  137  8e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3340  NAD+ synthetase  27.47 
 
 
598 aa  136  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.316593  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2961  NAD+ synthetase  25.99 
 
 
545 aa  135  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0904337 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3593  NAD+ synthetase  27.5 
 
 
577 aa  135  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2296  NAD+ synthetase  25.18 
 
 
543 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1093  NAD+ synthetase  24.37 
 
 
542 aa  134  5e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.588996  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1404  NAD synthetase  24.08 
 
 
574 aa  134  6e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189594  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1737  NAD+ synthetase  28.09 
 
 
552 aa  134  6.999999999999999e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.364272 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2553  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  27.75 
 
 
540 aa  133  7.999999999999999e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0396005 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0727  NAD+ synthetase  25.54 
 
 
567 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.47874  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0922  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  24.21 
 
 
542 aa  131  3e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.906814  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2832  NAD+ synthetase  24.67 
 
 
686 aa  130  7.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0983  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  28.32 
 
 
577 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.29742  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0426  NAD+ synthetase  27.67 
 
 
548 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.277898  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1886  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  27.93 
 
 
535 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15260  NAD+ synthetase  27.11 
 
 
553 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.874771  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1990  NAD+ synthetase  26.99 
 
 
561 aa  129  3e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6745  NAD+ synthetase  26.01 
 
 
688 aa  128  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.960806 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1372  NAD+ synthetase  26.44 
 
 
545 aa  127  6e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2601  NAD(+) synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.25 
 
 
597 aa  126  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.588325 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1759  NAD synthetase  26.48 
 
 
542 aa  126  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0908  NAD+ synthetase  26.62 
 
 
571 aa  126  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.31123  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1882  NAD+ synthetase  25.44 
 
 
552 aa  125  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3120  NAD+ synthetase  28.8 
 
 
550 aa  125  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>