More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1156 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_1156  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase-like protein  100 
 
 
875 aa  1754    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.165699  normal  0.0390371 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01920  aminopeptidase N  33.86 
 
 
905 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.384896  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3098  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  34.11 
 
 
933 aa  360  8e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.020169  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1419  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  34.93 
 
 
859 aa  345  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3198  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  32.8 
 
 
932 aa  343  8e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.747524  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3293  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  32.84 
 
 
932 aa  341  2.9999999999999998e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00996699  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2441  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  35.64 
 
 
859 aa  340  5.9999999999999996e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.312278  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2528  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  35.33 
 
 
857 aa  339  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00982821  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2381  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.14 
 
 
859 aa  336  1e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.42945  normal  0.881926 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2417  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  35.1 
 
 
853 aa  322  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.900684 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1050  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  29.31 
 
 
877 aa  320  6e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0939422  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0324  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  32.45 
 
 
874 aa  316  9e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.161681  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6491  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  29.77 
 
 
929 aa  295  2e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5674  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  32.33 
 
 
913 aa  294  6e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0620443 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0335  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  33.63 
 
 
878 aa  284  5.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0957  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.43 
 
 
830 aa  283  7.000000000000001e-75  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00150459 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2167  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  33.38 
 
 
882 aa  283  1e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0347  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  33.19 
 
 
878 aa  278  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.707127  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1912  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.56 
 
 
863 aa  278  3e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.97634  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02632  aminopeptidase N  29.11 
 
 
890 aa  273  1e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0443  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  30.26 
 
 
888 aa  271  4e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.089278  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0493  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  30.56 
 
 
852 aa  271  4e-71  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0003  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  30.44 
 
 
886 aa  268  5e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.350265  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04282  aminopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G04330)  27.74 
 
 
881 aa  264  6e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01638  hypothetical protein similar to aminopeptidase (Broad)  28.06 
 
 
883 aa  252  2e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0575  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  29 
 
 
778 aa  250  9e-65  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.509843  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77752  arginine/alanine aminopeptidase  27.58 
 
 
890 aa  249  1e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.204376 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_65905  alanine/arginine aminopeptidase  27.62 
 
 
870 aa  244  6e-63  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.167791  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0490  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  33.79 
 
 
784 aa  239  2e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.559596  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2881  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.83 
 
 
785 aa  233  2e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29758  predicted protein  29.68 
 
 
895 aa  224  4e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1058  lysyl aminopeptidase  31.75 
 
 
844 aa  215  3.9999999999999995e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0341  lysyl aminopeptidase  31.57 
 
 
846 aa  212  3e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1883  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase-like protein  34.78 
 
 
843 aa  208  4e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0504  lysyl aminopeptidase  29.18 
 
 
844 aa  208  4e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.777579  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1059  aminopeptidase N  27.84 
 
 
877 aa  207  8e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1012  lysyl-aminopeptidase, aminopeptidase N  26.63 
 
 
846 aa  206  1e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0715  aminopeptidase N  31.8 
 
 
844 aa  204  6e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.063007  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0986  aminopeptidase N  28.89 
 
 
849 aa  201  5e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.977905  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3016  aminopeptidase N  27.54 
 
 
877 aa  199  3e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31787  alanine/arginine aminopeptidase  27.16 
 
 
870 aa  198  4.0000000000000005e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0897  aminopeptidase N  27.08 
 
 
877 aa  197  7e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.77386  normal  0.216424 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3602  aminopeptidase N  27.64 
 
 
918 aa  197  7e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.104568  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3479  aminopeptidase N  27.64 
 
 
877 aa  197  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0883  aminopeptidase N  27.64 
 
 
877 aa  197  9e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.540659  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3404  aminopeptidase N  27.35 
 
 
877 aa  194  7e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3040  aminopeptidase N  26.95 
 
 
877 aa  189  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.623964  normal  0.59258 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0932  aminopeptidase N  26.95 
 
 
877 aa  189  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0957943  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5329  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.76 
 
 
727 aa  183  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.628963  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3603  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.92 
 
 
738 aa  182  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.604033  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4680  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.92 
 
 
738 aa  182  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00411  putative aminopeptidase transmembrane protein  28.06 
 
 
748 aa  181  5.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2915  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.57 
 
 
878 aa  179  1e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0708644  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2917  aminopeptidase N  31.89 
 
 
875 aa  177  5e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3244  aminopeptidase N  28.73 
 
 
887 aa  177  7e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0913  aminopeptidase N  26.44 
 
 
879 aa  174  5e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120566 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0823  aminopeptidase N  28.44 
 
 
889 aa  174  6.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04910  leucyl aminopeptidase, putative  30.96 
 
 
1018 aa  173  1e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5445  aminopeptidase N  30.11 
 
 
848 aa  173  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24580  aminopeptidase N  33.83 
 
 
850 aa  172  3e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.571572 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1142  aminopeptidase N  31.2 
 
 
852 aa  171  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929946  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2577  aminopeptidase N  33.14 
 
 
889 aa  171  4e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.99467 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09020  aminopeptidase N  31.36 
 
 
887 aa  170  1e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.259746  normal  0.0340911 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2358  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.78 
 
 
855 aa  169  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.249972  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11670  aminopeptidase G  32.38 
 
 
882 aa  169  2e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.756822  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3156  Membrane alanyl aminopeptidase  27.52 
 
 
743 aa  168  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.315095  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0760  aminopeptidase N  26.83 
 
 
906 aa  167  5.9999999999999996e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.393425 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0653  aminopeptidase N  28.6 
 
 
853 aa  167  6.9999999999999995e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0576  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  33.24 
 
 
869 aa  167  8e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2818  M1 family peptidase  25.47 
 
 
721 aa  165  3e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.316749  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3161  M1 family peptidase  25.47 
 
 
721 aa  165  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3613  M1 family peptidase  25.47 
 
 
721 aa  165  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3637  M1 family peptidase  25.47 
 
 
721 aa  165  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0040  M1 family peptidase  25.47 
 
 
721 aa  165  3e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1727  M1 family peptidase  25.47 
 
 
721 aa  165  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.357596  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3622  peptidase  25.47 
 
 
746 aa  165  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.178496  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4965  aminopeptidase N  30.73 
 
 
857 aa  165  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861412  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2945  M1 family peptidase  25.89 
 
 
740 aa  163  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1349  aminopeptidase N  29.82 
 
 
850 aa  163  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000264041  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7988  aminopeptidase N  29.67 
 
 
858 aa  163  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3892  aminopeptidase N  29.64 
 
 
848 aa  163  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.213595 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1546  aminopeptidase N  32.96 
 
 
861 aa  163  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.966303  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3517  aminopeptidase N  29.4 
 
 
851 aa  162  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4057  aminopeptidase N  32.53 
 
 
869 aa  162  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.5742  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0910  aminopeptidase N  31.59 
 
 
807 aa  162  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5477  aminopeptidase N  29.22 
 
 
838 aa  160  9e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.908342  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1330  aminopeptidase N  30.06 
 
 
853 aa  160  9e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.86376  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2534  aminopeptidase N  29.36 
 
 
855 aa  160  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.652237  normal  0.722591 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1828  aminopeptidase N  32.81 
 
 
853 aa  160  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00705438  normal  0.315608 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1408  aminopeptidase N  29.86 
 
 
848 aa  159  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00342541 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12492  aminopeptidase N pepN (lysyl aminopeptidase)  31.81 
 
 
861 aa  159  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.414324 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2038  aminopeptidase N  32.3 
 
 
862 aa  158  4e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5040  aminopeptidase N  30.88 
 
 
860 aa  157  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1102  aminopeptidase N  32.57 
 
 
862 aa  157  7e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11521  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3525  aminopeptidase N  30.28 
 
 
853 aa  157  9e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0714128  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3610  aminopeptidase N  32.1 
 
 
867 aa  157  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.913388 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3605  aminopeptidase N  32.1 
 
 
867 aa  157  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0943  aminopeptidase N  31.47 
 
 
849 aa  157  1e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2903  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.77 
 
 
723 aa  157  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3678  aminopeptidase N  32.1 
 
 
867 aa  157  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.701702  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>