281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_29240 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_29240  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
433 aa  866    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.500225 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1004  nicotinate phosphoribosyltransferase  77.59 
 
 
437 aa  637    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.704184  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1959  nicotinate phosphoribosyltransferase  68.21 
 
 
439 aa  550  1e-155  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1097  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  67.61 
 
 
428 aa  546  1e-154  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1693  nicotinate phosphoribosyltransferase  67.83 
 
 
438 aa  542  1e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0334582  normal  0.146455 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1520  nicotinate phosphoribosyltransferase  66.51 
 
 
432 aa  543  1e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357665  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0986  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  68.08 
 
 
428 aa  530  1e-149  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.937586  normal  0.155542 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3767  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  69.5 
 
 
430 aa  523  1e-147  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4297  nicotinate phosphoribosyltransferase  67.8 
 
 
454 aa  523  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.997092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3840  nicotinate phosphoribosyltransferase  67.9 
 
 
440 aa  518  1e-146  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0914379  normal  0.0918112 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1286  nicotinate phosphoribosyltransferase  67.2 
 
 
455 aa  518  1e-146  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3854  nicotinate phosphoribosyltransferase  67.9 
 
 
440 aa  518  1e-146  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0484851  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3928  nicotinate phosphoribosyltransferase  67.9 
 
 
440 aa  518  1e-146  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2348  nicotinate phosphoribosyltransferase  67.72 
 
 
454 aa  520  1e-146  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.243675  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11362  nicotinate phosphoribosyltransferase  67.76 
 
 
448 aa  507  9.999999999999999e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000455701  normal  0.17111 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2742  nicotinate phosphoribosyltransferase  65.3 
 
 
442 aa  486  1e-136  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.659062  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1352  nicotinate phosphoribosyltransferase  66.04 
 
 
427 aa  480  1e-134  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1722  Nicotinate phosphoribosyltransferase  61.07 
 
 
428 aa  474  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.203111  normal  0.0930389 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1692  nicotinate phosphoribosyltransferase  61.47 
 
 
443 aa  472  1e-132  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230632  hitchhiker  0.00000832621 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10690  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  61.43 
 
 
446 aa  468  1.0000000000000001e-131  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.132626  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3876  nicotinate phosphoribosyltransferase  64.27 
 
 
450 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.210079  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1052  nicotinate phosphoribosyltransferase  61.56 
 
 
465 aa  471  1.0000000000000001e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0380  nicotinate phosphoribosyltransferase  60.09 
 
 
433 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132237  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1489  nicotinate phosphoribosyltransferase  59.4 
 
 
433 aa  466  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5658  nicotinate phosphoribosyltransferase  59.96 
 
 
473 aa  459  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2373  nicotinate phosphoribosyltransferase  59.3 
 
 
438 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0933  nicotinate phosphoribosyltransferase  62.15 
 
 
424 aa  455  1e-127  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.570353  normal  0.55165 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1320  nicotinate phosphoribosyltransferase  58.47 
 
 
465 aa  449  1e-125  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.6984  hitchhiker  0.00295081 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25100  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  61.47 
 
 
440 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.473276  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2318  nicotinate phosphoribosyltransferase  56.82 
 
 
442 aa  442  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000251567 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08320  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  58.84 
 
 
450 aa  443  1e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2586  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  56.59 
 
 
442 aa  443  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.145484  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1307  nicotinate phosphoribosyltransferase  60.74 
 
 
439 aa  442  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2863  nicotinate phosphoribosyltransferase  59 
 
 
454 aa  434  1e-120  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0781042  normal  0.0115492 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0882  nicotinate phosphoribosyltransferase  57.62 
 
 
443 aa  426  1e-118  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2828  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  55.23 
 
 
440 aa  426  1e-118  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.11088  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20100  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  54.12 
 
 
462 aa  419  1e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0330  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  52.17 
 
 
445 aa  414  1e-114  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0860  nicotinate phosphoribosyltransferase  56.29 
 
 
461 aa  407  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1032  nicotinate phosphoribosyltransferase  52.86 
 
 
440 aa  389  1e-107  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1559  nicotinate phosphoribosyltransferase  52.93 
 
 
443 aa  317  2e-85  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4654  nicotinate phosphoribosyltransferase  41.53 
 
 
453 aa  290  4e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3577  nicotinate phosphoribosyltransferase  41.53 
 
 
453 aa  290  4e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.924497  normal  0.771098 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0797  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.02 
 
 
485 aa  269  5.9999999999999995e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1212  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  38.88 
 
 
446 aa  267  2.9999999999999995e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0716961 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2057  nicotinate phosphoribosyltransferase  43.18 
 
 
445 aa  259  7e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134189  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1325  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.42 
 
 
462 aa  257  3e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6179  nicotinate phosphoribosyltransferase  41.46 
 
 
458 aa  256  7e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466995  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0195  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.36 
 
 
453 aa  253  6e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0827  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.22 
 
 
460 aa  252  7e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0511  nicotinate phosphoribosyltransferase  40.79 
 
 
487 aa  252  9.000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0939  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.9 
 
 
451 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0513  nicotinate phosphoribosyltransferase  40.12 
 
 
487 aa  251  1e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1046  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.05 
 
 
489 aa  250  3e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.655171  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0775  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.66 
 
 
451 aa  250  4e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.344543  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1780  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.72 
 
 
441 aa  249  5e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0763  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.66 
 
 
451 aa  249  7e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3666  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.06 
 
 
495 aa  249  9e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.335827  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1177  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.04 
 
 
486 aa  248  1e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0494715  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4703  nicotinate phosphoribosyltransferase  40.18 
 
 
487 aa  247  2e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0101236 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0664  nicotinate phosphoribosyltransferase  40.18 
 
 
487 aa  248  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.38019  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1009  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.7 
 
 
460 aa  248  2e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.948322  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0507  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.88 
 
 
487 aa  247  3e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0509  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.88 
 
 
487 aa  247  3e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0724  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.88 
 
 
487 aa  247  3e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46230  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.09 
 
 
452 aa  247  3e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.346477  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0122  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.57 
 
 
465 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1538  nicotinate phosphoribosyltransferase  40.64 
 
 
491 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10583  nicotinate phosphoribosyltransferase  41.15 
 
 
463 aa  246  6e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.127794  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0565  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.58 
 
 
487 aa  245  9e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0596  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.58 
 
 
487 aa  245  9e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2593  nicotinate phosphoribosyltransferase related  40.48 
 
 
458 aa  245  9e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0996  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.53 
 
 
501 aa  245  9e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0354541  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0653  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.58 
 
 
487 aa  245  9e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000067551 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0635  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.88 
 
 
487 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.821455  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2602  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.63 
 
 
461 aa  244  9.999999999999999e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0907  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.8 
 
 
457 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.275384  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0284  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.68 
 
 
488 aa  244  1.9999999999999999e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4911  nicotinate phosphoribosyltransferase  32.67 
 
 
489 aa  244  3e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.489735  normal  0.186236 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1180  nicotinate phosphoribosyltransferase  32.49 
 
 
458 aa  244  3e-63  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.690233  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5927  nicotinate phosphoribosyltransferase  40.38 
 
 
459 aa  243  6e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2003  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.01 
 
 
489 aa  243  6e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.675811  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1969  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.01 
 
 
489 aa  243  6e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.411515  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1215  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.62 
 
 
451 aa  242  1e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2987  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.48 
 
 
479 aa  241  1e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0625  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.56 
 
 
453 aa  241  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09180  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  36.43 
 
 
489 aa  239  6.999999999999999e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.346116 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2627  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.3 
 
 
489 aa  238  1e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1528  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.67 
 
 
490 aa  238  2e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.10447 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2471  nicotinate phosphoribosyltransferase  41.98 
 
 
451 aa  238  2e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0320218  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2253  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.93 
 
 
484 aa  237  3e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1964  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.93 
 
 
484 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0253491  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2760  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.82 
 
 
449 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1071  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.81 
 
 
483 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000207171  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5746  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.54 
 
 
523 aa  235  1.0000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2289  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.25 
 
 
481 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1758  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.51 
 
 
475 aa  234  3e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3792  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  37.16 
 
 
491 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.94991 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2646  nicotinate phosphoribosyltransferase  42.49 
 
 
450 aa  233  5e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159209  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1985  nicotinate phosphoribosyltransferase  41.69 
 
 
447 aa  233  5e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000236264  hitchhiker  0.00837081 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>