223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_22300 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2192  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  80.09 
 
 		 461 aa  681    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22300  Mg-chelatase subunit ChlI  100 
 
 		 475 aa  919    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.102515  normal  0.184518 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0952  putative magnesium chelatase subunit ChlI  69.5 
 
 		 462 aa  607  9.999999999999999e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3299  magnesium chelatase subunit ChlI  70.5 
 
 		 473 aa  599  1e-170  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4314  putative magnesium chelatase  70.65 
 
 		 461 aa  589  1e-167  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.569649  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4400  putative magnesium chelatase  70.65 
 
 		 461 aa  589  1e-167  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.803447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4854  putative magnesium chelatase  69.11 
 
 		 463 aa  588  1e-167  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.454565 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4694  putative magnesium chelatase  70.65 
 
 		 461 aa  589  1e-167  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0396421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1877  putative magnesium chelatase  69.11 
 
 		 463 aa  586  1e-166  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0595129 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1378  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  66.38 
 
 		 480 aa  574  1.0000000000000001e-162  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10976  magnesium chelatase  71.06 
 
 		 459 aa  561  1e-158  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.915369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1986  putative magnesium chelatase  65.65 
 
 		 469 aa  557  1e-157  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.106493  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0551  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  69.35 
 
 		 464 aa  545  1e-154  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1097  magnesium chelatase, ChlI subunit  67.6 
 
 		 476 aa  538  1e-151  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.3392 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1769  putative magnesium chelatase  64.11 
 
 		 478 aa  535  1e-151  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000539061 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0443  magnesium chelatase subunit ChlI  62.06 
 
 		 475 aa  529  1e-149  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1892  magnesium chelatase, ChlI subunit  62.83 
 
 		 463 aa  530  1e-149  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.460358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1054  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  63.4 
 
 		 471 aa  524  1e-147  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8559  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  61.99 
 
 		 465 aa  524  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3114  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  64.15 
 
 		 469 aa  523  1e-147  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.53029  hitchhiker  0.0000243059 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0934  putative magnesium chelatase  60.2 
 
 		 511 aa  501  1e-140  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.550686  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0823  putative magnesium chelatase  60.13 
 
 		 503 aa  484  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.421013 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3905  magnesium chelatase, ChlI subunit  58.39 
 
 		 507 aa  461  9.999999999999999e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0246892  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0090  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  57.33 
 
 		 477 aa  451  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1872  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  48.16 
 
 		 464 aa  415  1e-114  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0311  magnesium chelatase, ChlI subunit  48.61 
 
 		 460 aa  372  1e-102  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4671  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  48.31 
 
 		 499 aa  369  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  hitchhiker  0.00000156753 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3739  magnesium chelatase, subunit ChlI  50.55 
 
 		 510 aa  370  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08801  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  48.34 
 
 		 487 aa  366  1e-100  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.240112  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2682  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  43.67 
 
 		 505 aa  365  1e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1164  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  41.44 
 
 		 475 aa  362  6e-99  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0006  magnesium chelatase, subunit ChlI  51.3 
 
 		 512 aa  352  1e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.388384  normal  0.114957 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3256  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  42.3 
 
 		 502 aa  350  3e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.149717  normal  0.233846 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0326  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  49.28 
 
 		 510 aa  349  5e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0370  Mg-chelatase subunit ChlI  49.57 
 
 		 497 aa  341  2e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.591136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0412  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  44.03 
 
 		 486 aa  341  2e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1093  magnesium chelatase related protein  45.12 
 
 		 473 aa  340  4e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4336  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  46.93 
 
 		 487 aa  339  5.9999999999999996e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.799132  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2429  magnesium protoporphyrin chelatase putative  43.54 
 
 		 473 aa  325  9e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3731  magnesium chelatase ATPase subunit I  31.74 
 
 		 368 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.786606  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0511  ATPase  27.19 
 
 		 334 aa  58.9  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2068  magnesium chelatase ATPase subunit I  30.58 
 
 		 341 aa  58.9  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.876863 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1403  ATPase  27.41 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0648  magnesium chelatase ATPase subunit I  27.01 
 
 		 357 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1916  magnesium chelatase subunit I  28.77 
 
 		 334 aa  54.7  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.808705 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0273  magnesium chelatase subunit I  28.77 
 
 		 334 aa  54.7  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.308898  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1519  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  26.79 
 
 		 374 aa  54.3  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0208517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0850  ATPase  28.79 
 
 		 304 aa  53.9  0.000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.243473 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3171  magnesium chelatase, ChlI subunit; methanol dehydrogenase regulator  33.6 
 
 		 309 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3413  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.26 
 
 		 324 aa  53.1  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.265752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8515  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  35.51 
 
 		 327 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  0.0546803 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0970  magnesium chelatase ATPase subunit I  29.91 
 
 		 369 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.726798  normal  0.50852 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0954  ATPase  33.04 
 
 		 307 aa  52.8  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2942  MoxR-like ATPase  32 
 
 		 309 aa  52.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000701608  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0467  magnesium chelatase ATPase subunit I  27.49 
 
 		 358 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.571149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1250  magnesium chelatase ATPase subunit I  28.71 
 
 		 340 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136205 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0454  magnesium chelatase ATPase subunit I  27.49 
 
 		 358 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2433  magnesium chelatase ATPase subunit I  28.44 
 
 		 337 aa  52  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1022  magnesium chelatase subunit I  27.83 
 
 		 334 aa  52.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0936495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2611  magnesium chelatase ATPase subunit D  30.16 
 
 		 673 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2505  magnesium chelatase ATPase subunit I  28.44 
 
 		 337 aa  52  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.57993  normal  0.244137 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3505  magnesium chelatase ATPase subunit D  30.16 
 
 		 673 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2728  magnesium chelatase ATPase subunit I  28 
 
 		 337 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.111269 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4017  magnesium chelatase ATPase subunit I  27.39 
 
 		 340 aa  50.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0371739  normal  0.311095 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4029  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.3 
 
 		 306 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5963  Mg chelatase, subunit ChlI  29.83 
 
 		 525 aa  50.4  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3280  magnesium chelatase ATPase subunit I  26.32 
 
 		 373 aa  50.4  0.00007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03742  chelatase protein  27.97 
 
 		 637 aa  49.3  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.84057 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1776  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  25.82 
 
 		 688 aa  49.7  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03121  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  26.34 
 
 		 711 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3056  Mg chelatase, subunit ChlI  28.44 
 
 		 509 aa  49.7  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2044  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.33 
 
 		 314 aa  49.7  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2041  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  36.23 
 
 		 611 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.115359  normal  0.637814 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3502  magnesium chelatase subunit I  27.92 
 
 		 334 aa  49.7  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602006  normal  0.630421 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4062  Mg chelatase, subunit ChlI  28.86 
 
 		 507 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0481  Mg chelatase-like protein  28.86 
 
 		 507 aa  48.5  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0704284 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2773  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  33.6 
 
 		 310 aa  49.3  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0680478  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3622  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  28.57 
 
 		 405 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0153  Mg chelatase-like protein  28.86 
 
 		 507 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0320  ATPase  26.94 
 
 		 310 aa  49.3  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1261  magnesium chelatase  29.02 
 
 		 689 aa  48.9  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1835  magnesium chelatase ATPase subunit I  28.57 
 
 		 336 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.053644 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1622  magnesium chelatase ATPase subunit I  25.94 
 
 		 341 aa  49.3  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1915  ATPase  27.18 
 
 		 304 aa  48.9  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3458  ATPase  33.02 
 
 		 350 aa  48.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3068  ATPase, AAA family  33.6 
 
 		 310 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0718148  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1837  ATPase  28.14 
 
 		 302 aa  48.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4762  Mg chelatase, subunit ChlI  29.63 
 
 		 507 aa  48.5  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2455  ATPase  31.06 
 
 		 332 aa  48.5  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03111  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  25.89 
 
 		 727 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6449  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  30.39 
 
 		 348 aa  48.5  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2759  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  32.8 
 
 		 309 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3936  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.25 
 
 		 337 aa  48.1  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.528453  normal  0.396618 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3152  ATPase  32.78 
 
 		 620 aa  48.1  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50740  predicted protein  28.35 
 
 		 800 aa  47.8  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1686  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.39 
 
 		 326 aa  47.8  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3552  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.11 
 
 		 403 aa  48.1  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27460  MoxR-like ATPase  30.77 
 
 		 352 aa  48.1  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1274  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.95 
 
 		 351 aa  47.8  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.150646  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5532  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  34.41 
 
 		 319 aa  47.4  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237409  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>