23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1769 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1769  c553-type monoheme cytochrome c  100 
 
 
432 aa  885    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1299  hypothetical protein  52.73 
 
 
260 aa  294  2e-78  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0330759  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0441  hypothetical protein  50 
 
 
255 aa  258  1e-67  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.264728  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0008  hypothetical protein  45.97 
 
 
251 aa  242  1e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000310399  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1728  hypothetical protein  44.49 
 
 
251 aa  236  4e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.715812  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2013  hypothetical protein  31.76 
 
 
220 aa  87  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0210  hypothetical protein  33.52 
 
 
199 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1303  hypothetical protein  37.88 
 
 
166 aa  79.7  0.00000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00330826  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0694  hypothetical protein  28.76 
 
 
341 aa  71.2  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0701327  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0445  hypothetical protein  43.84 
 
 
149 aa  71.2  0.00000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1568  hypothetical protein  45.21 
 
 
330 aa  70.9  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00971838  normal  0.55843 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1930  hypothetical protein  32.73 
 
 
184 aa  68.9  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1462  hypothetical protein  30.95 
 
 
218 aa  66.6  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1557  hypothetical protein  30.95 
 
 
218 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.116026  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1724  hypothetical protein  36.36 
 
 
153 aa  65.9  0.000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.751234  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0245  hypothetical protein  31.41 
 
 
228 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.175381  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2401  hypothetical protein  30.13 
 
 
218 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0200192  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0448  hypothetical protein  31.07 
 
 
188 aa  64.3  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000438737  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0669  hypothetical protein  35.48 
 
 
157 aa  63.5  0.000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0140591  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1804  hypothetical protein  30.56 
 
 
206 aa  59.7  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.424429  normal  0.53348 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0952  cytochrome c, class I  23.43 
 
 
192 aa  50.1  0.00008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000198815  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0629  cytochrome c, class I  37.31 
 
 
102 aa  47  0.0007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4034  ethanolamine ammonia-lyase heavy chain  27.83 
 
 
455 aa  45.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.680075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>