16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1299 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1299  hypothetical protein  100 
 
 
260 aa  531  1e-150  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0330759  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1769  c553-type monoheme cytochrome c  52.73 
 
 
432 aa  294  9e-79  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1728  hypothetical protein  54.58 
 
 
251 aa  285  5e-76  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.715812  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0008  hypothetical protein  51.2 
 
 
251 aa  278  6e-74  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000310399  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0441  hypothetical protein  53.57 
 
 
255 aa  278  7e-74  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.264728  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1568  hypothetical protein  55.41 
 
 
330 aa  94.4  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00971838  normal  0.55843 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2013  hypothetical protein  31.18 
 
 
220 aa  89.4  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0210  hypothetical protein  31.05 
 
 
199 aa  63.5  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0245  hypothetical protein  29.22 
 
 
228 aa  62.8  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.175381  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0448  hypothetical protein  30.29 
 
 
188 aa  62.8  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000438737  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1462  hypothetical protein  28.31 
 
 
218 aa  60.1  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1804  hypothetical protein  29.14 
 
 
206 aa  59.7  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.424429  normal  0.53348 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1557  hypothetical protein  28.31 
 
 
218 aa  59.7  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.116026  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2401  hypothetical protein  27.1 
 
 
218 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0200192  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0694  hypothetical protein  24.84 
 
 
341 aa  56.2  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0701327  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1930  hypothetical protein  25.32 
 
 
184 aa  55.5  0.0000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>