15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1930 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1930  hypothetical protein  100 
 
 
184 aa  365  1e-100  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1462  hypothetical protein  30.94 
 
 
218 aa  71.2  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1557  hypothetical protein  31.67 
 
 
218 aa  70.5  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.116026  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1769  c553-type monoheme cytochrome c  32.73 
 
 
432 aa  68.9  0.00000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2401  hypothetical protein  30.57 
 
 
218 aa  68.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0200192  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1804  hypothetical protein  30.3 
 
 
206 aa  66.2  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.424429  normal  0.53348 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0448  hypothetical protein  29.52 
 
 
188 aa  65.9  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000438737  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0210  hypothetical protein  30.53 
 
 
199 aa  63.2  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1728  hypothetical protein  31.45 
 
 
251 aa  62  0.000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.715812  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0245  hypothetical protein  25.83 
 
 
228 aa  60.5  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.175381  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2013  hypothetical protein  27.81 
 
 
220 aa  60.8  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0441  hypothetical protein  29.7 
 
 
255 aa  59.3  0.00000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.264728  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0008  hypothetical protein  27.85 
 
 
251 aa  58.9  0.00000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000310399  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0694  hypothetical protein  29.24 
 
 
341 aa  56.6  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0701327  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1299  hypothetical protein  25.32 
 
 
260 aa  55.5  0.0000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0330759  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>