16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1804 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1804  hypothetical protein  100 
 
 
206 aa  410  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.424429  normal  0.53348 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2401  hypothetical protein  47.54 
 
 
218 aa  167  7e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0200192  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0245  hypothetical protein  47.54 
 
 
228 aa  160  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.175381  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1462  hypothetical protein  46.94 
 
 
218 aa  159  3e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1557  hypothetical protein  46.94 
 
 
218 aa  158  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.116026  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0694  hypothetical protein  38.3 
 
 
341 aa  106  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0701327  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0210  hypothetical protein  37.38 
 
 
199 aa  101  9e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0448  hypothetical protein  35.54 
 
 
188 aa  99.4  3e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000438737  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2013  hypothetical protein  31.98 
 
 
220 aa  81.3  0.000000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1728  hypothetical protein  32.56 
 
 
251 aa  77  0.0000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.715812  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0441  hypothetical protein  32.16 
 
 
255 aa  75.9  0.0000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.264728  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1930  hypothetical protein  29.89 
 
 
184 aa  73.6  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0008  hypothetical protein  31.4 
 
 
251 aa  73.2  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000310399  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1164  hypothetical protein  31.96 
 
 
284 aa  68.6  0.00000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.828155  normal  0.0879348 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1299  hypothetical protein  27.18 
 
 
260 aa  65.1  0.0000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0330759  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1769  c553-type monoheme cytochrome c  31.29 
 
 
432 aa  63.9  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>