28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1638 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1638  transformation system protein  100 
 
 
191 aa  392  1e-108  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1469  transformation system protein  48.4 
 
 
189 aa  169  2e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0309  hypothetical protein  43.62 
 
 
190 aa  160  1e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0760  transformation system protein  43.98 
 
 
191 aa  154  7e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00157325  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1172  transformation system protein  44.5 
 
 
191 aa  154  8e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.363092  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1047  transformation system protein  44.5 
 
 
191 aa  154  8e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.733048  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1143  conserved hypothetical protein, possible purine/pyrimidine phosphoribosyltransferase  42.02 
 
 
190 aa  147  1.0000000000000001e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1458  transformation system protein  39.36 
 
 
189 aa  146  1.0000000000000001e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.476694  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1215  transformation system protein  38.96 
 
 
233 aa  144  1e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0860  hypothetical protein  41.49 
 
 
189 aa  130  1.0000000000000001e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.535933  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0200  competence protein  25.23 
 
 
269 aa  47  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2296  hypothetical protein  34.72 
 
 
241 aa  45.8  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.658532  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3458  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  26.14 
 
 
250 aa  45.8  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000183907  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0661  phosphoribosyltransferase  30.11 
 
 
222 aa  44.7  0.0008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4012  competence protein ComF  29.29 
 
 
249 aa  44.3  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4986  comF operon protein 3  25.29 
 
 
234 aa  44.3  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1247  phosphoribosyltransferase  23.59 
 
 
202 aa  44.7  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1208  phosphoribosyltransferase  23.59 
 
 
202 aa  44.7  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195663  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1385  hypothetical protein  21.78 
 
 
204 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.653561  normal  0.716012 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15330  predicted amidophosphoribosyltransferase  32.29 
 
 
230 aa  43.1  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0698628  normal  0.0235577 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  21.53 
 
 
243 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3237  late competence protein  25.81 
 
 
230 aa  43.1  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1369  hypothetical protein  21.29 
 
 
204 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1351  hypothetical protein  21.29 
 
 
204 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.163602  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2141  comFC protein  28.83 
 
 
219 aa  42.4  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3746  hypothetical protein  23 
 
 
219 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.345034 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0024  phosphoribosyltransferase  23.33 
 
 
206 aa  41.6  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118488  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  22.66 
 
 
237 aa  42  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>