More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1610 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1610  Acyl carrier protein (ACP)  100 
 
 
90 aa  175  2e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1836  acyl carrier protein  82.43 
 
 
76 aa  116  9.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000000576824  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0493  acyl carrier protein  71.62 
 
 
77 aa  103  1e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0468  acyl carrier protein  70.27 
 
 
77 aa  102  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0285  acyl carrier protein  72.97 
 
 
77 aa  102  2e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1362  acyl carrier protein  70.27 
 
 
77 aa  100  5e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.915786  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1496  acyl carrier protein  68.92 
 
 
77 aa  100  6e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0230  acyl carrier protein  70.27 
 
 
79 aa  99  2e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0561  acyl carrier protein  69.86 
 
 
77 aa  99  2e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2462  acyl carrier protein  63.01 
 
 
73 aa  97.4  6e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0113419  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20601  acyl carrier protein  64.94 
 
 
80 aa  96.3  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417158  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1185  acyl carrier protein  64.94 
 
 
80 aa  96.3  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00688444  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26061  acyl carrier protein  66.22 
 
 
103 aa  95.9  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2564  acyl carrier protein  58.67 
 
 
77 aa  95.5  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0663  acyl carrier protein  58.67 
 
 
77 aa  94.4  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00175647  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0170  acyl carrier protein  63.64 
 
 
80 aa  94  7e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.519616  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1181  acyl carrier protein  63.01 
 
 
76 aa  93.6  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185913  decreased coverage  0.00116588 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0066  acyl carrier protein  62.67 
 
 
76 aa  93.6  8e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0126  acyl carrier protein  62.34 
 
 
80 aa  93.2  1e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.395264  hitchhiker  0.00283985 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2071  acyl carrier protein  61.64 
 
 
74 aa  92  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431599  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0168  acyl carrier protein  59.46 
 
 
76 aa  92.8  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000122767  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17331  acyl carrier protein (ACP)  66.22 
 
 
80 aa  91.7  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0088  acyl carrier protein  64.71 
 
 
78 aa  91.7  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0975  acyl carrier protein  64.18 
 
 
80 aa  91.7  3e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.553759  normal  0.616153 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3247  acyl carrier protein  61.64 
 
 
78 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2874  acyl carrier protein  61.64 
 
 
78 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0334524  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2736  acyl carrier protein  61.76 
 
 
80 aa  91.3  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.875192  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0507  acyl carrier protein  57.33 
 
 
77 aa  91.3  5e-18  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0583644  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1664  Acyl carrier protein (ACP)  63.77 
 
 
78 aa  90.9  5e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0513886  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0280  acyl carrier protein  64.71 
 
 
78 aa  91.3  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.344257 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2839  acyl carrier protein  60.29 
 
 
79 aa  90.9  6e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0510  acyl carrier protein  62.32 
 
 
77 aa  90.9  6e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2931  acyl carrier protein  60.29 
 
 
79 aa  90.9  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2747  acyl carrier protein  60.29 
 
 
79 aa  90.9  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18181  acyl carrier protein  65.75 
 
 
79 aa  90.5  7e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0959  acyl carrier protein  54.43 
 
 
80 aa  90.5  7e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18011  acyl carrier protein  65.75 
 
 
79 aa  90.5  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1606  acyl carrier protein  66.18 
 
 
110 aa  90.1  8e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  8.57537e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17961  acyl carrier protein  64.38 
 
 
80 aa  89.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0258441  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1687  acyl carrier protein  66.67 
 
 
78 aa  89.4  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000299329  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1579  acyl carrier protein  66.67 
 
 
78 aa  89.4  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.86341e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3498  acyl carrier protein  66.67 
 
 
78 aa  89.4  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000503689  hitchhiker  0.00947262 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5387  acyl carrier protein  66.15 
 
 
78 aa  89.7  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1701  acyl carrier protein  65.75 
 
 
79 aa  89.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1096  acyl carrier protein  56.16 
 
 
83 aa  89.4  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000417281  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0685  acyl carrier protein  62.5 
 
 
75 aa  89.4  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00698969  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2298  acyl carrier protein  68.18 
 
 
77 aa  89  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00108603  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1351  acyl carrier protein  61.76 
 
 
82 aa  88.6  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1347  acyl carrier protein  61.76 
 
 
82 aa  88.6  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0660  acyl carrier protein  60.29 
 
 
81 aa  89  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.179037  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1630  acyl carrier protein  66.67 
 
 
78 aa  89.4  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000123369  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0643  acyl carrier protein  62.5 
 
 
77 aa  89  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000166271  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1584  acyl carrier protein  64.29 
 
 
82 aa  89  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34262  normal  0.0373148 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0933  acyl carrier protein  56.16 
 
 
74 aa  88.6  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000201436  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4505  acyl carrier protein  66.67 
 
 
81 aa  89.4  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265662  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1909  acyl carrier protein  64.29 
 
 
82 aa  89  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.045523  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0436  acyl carrier protein  58.67 
 
 
76 aa  88.2  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.20002  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1361  acyl carrier protein  60 
 
 
76 aa  88.6  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000207547  normal  0.0506091 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1339  acyl carrier protein  62.32 
 
 
78 aa  87.8  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52176  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1041  acyl carrier protein  73.77 
 
 
77 aa  87.4  5e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000252182  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1866  acyl carrier protein  65.15 
 
 
77 aa  87.4  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00815396  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1834  acyl carrier protein  65.15 
 
 
79 aa  87.4  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0103322  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2121  acyl carrier protein  62.12 
 
 
79 aa  87  7e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000862864  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1090  acyl carrier protein  62.12 
 
 
77 aa  87  7e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.343466  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0713  acyl carrier protein  60.87 
 
 
78 aa  87  8e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000031745  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02907  acyl carrier protein  63.24 
 
 
77 aa  86.7  9e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0536  acyl carrier protein  66.67 
 
 
80 aa  86.7  9e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.75126  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002997  acyl carrier protein  63.24 
 
 
77 aa  86.7  9e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000114141  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01090  acyl carrier protein  63.64 
 
 
78 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000166866  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2553  acyl carrier protein  63.64 
 
 
78 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000526358  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1215  acyl carrier protein  63.64 
 
 
78 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000103813  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1473  acyl carrier protein  63.64 
 
 
78 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000839248  hitchhiker  0.00000000000000262365 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2507  acyl carrier protein  63.64 
 
 
78 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996587  hitchhiker  0.000000169384 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01098  hypothetical protein  63.64 
 
 
78 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000144532  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1232  acyl carrier protein  64.71 
 
 
79 aa  86.3  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152652  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1216  acyl carrier protein  63.64 
 
 
78 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.59624e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2230  acyl carrier protein  63.64 
 
 
78 aa  86.7  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.78439e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1075  acyl carrier protein  63.24 
 
 
78 aa  85.9  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.690942  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1672  acyl carrier protein  54.67 
 
 
77 aa  86.3  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2173  acyl carrier protein  63.64 
 
 
78 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000401427  hitchhiker  0.000000000000202194 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2033  acyl carrier protein  63.64 
 
 
78 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000123338  hitchhiker  0.00000256014 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1295  acyl carrier protein  63.64 
 
 
78 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000656136  decreased coverage  3.5580799999999995e-20 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1990  acyl carrier protein  63.64 
 
 
78 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000274294  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1266  acyl carrier protein  63.64 
 
 
78 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000000383773  normal  0.0632427 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1310  acyl carrier protein  63.64 
 
 
78 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000174722  decreased coverage  4.37915e-18 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2325  acyl carrier protein  62.12 
 
 
79 aa  85.9  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.596605  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3831  acyl carrier protein  61.76 
 
 
78 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67399  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1615  acyl carrier protein  59.42 
 
 
77 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.161415  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1907  acyl carrier protein  63.64 
 
 
78 aa  85.9  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000356515  hitchhiker  0.00000541151 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14930  acyl carrier protein  62.12 
 
 
78 aa  85.5  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  55.71 
 
 
75 aa  85.9  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1767  acyl carrier protein  64.18 
 
 
78 aa  85.5  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300385  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1420  acyl carrier protein  65.15 
 
 
79 aa  85.5  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.704183 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1416  acyl carrier protein  56.76 
 
 
76 aa  85.5  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.28944  normal  0.571191 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1588  acyl carrier protein  60.29 
 
 
78 aa  85.1  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000112562  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1648  acyl carrier protein  61.76 
 
 
80 aa  84.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00355954  normal  0.46932 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2018  Acyl carrier protein (ACP)  60 
 
 
78 aa  85.1  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000498687  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2502  acyl carrier protein  60.29 
 
 
78 aa  85.1  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000398484  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2807  acyl carrier protein  60.29 
 
 
78 aa  85.1  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000875833  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3198  acyl carrier protein  56.34 
 
 
78 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0370442 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>