247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0844 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0844  putative lipoprotein thiredoxin  100 
 
 
185 aa  380  1e-105  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0882  Redoxin domain protein  38.3 
 
 
183 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1061  possible periplasmic thioredoxin  31.85 
 
 
205 aa  98.2  7e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0521  putative lipoprotein  34.95 
 
 
185 aa  97.8  8e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.747119  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1341  putative lipoprotein  34.95 
 
 
185 aa  97.4  1e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.346269  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1222  putative lipoprotein  34.95 
 
 
185 aa  97.4  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1124  thioredoxin domain-containing protein  30.2 
 
 
200 aa  92.4  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0059  thioredoxin domain-containing protein  34.16 
 
 
198 aa  92.4  4e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.457756  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0616  thioredoxin domain-containing protein  29.7 
 
 
200 aa  91.7  5e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.28635  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1396  thiredoxin  34.17 
 
 
196 aa  91.3  8e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1112  thioredoxin domain-containing protein  31.96 
 
 
197 aa  89.4  3e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0500  thiredoxin  32.42 
 
 
184 aa  88.2  6e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1249  thioredoxin domain-containing protein  29.21 
 
 
200 aa  87.8  8e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0694  hypothetical protein  31.48 
 
 
199 aa  79  0.00000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0711  thioredoxin domain-containing protein  35.14 
 
 
198 aa  78.2  0.00000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1311  transporter  31.94 
 
 
211 aa  75.1  0.0000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0971109  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1628  thioredoxin domain-containing protein  26.83 
 
 
201 aa  75.1  0.0000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.325697  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1212  conserved hypothetical lipoprotein  28.02 
 
 
181 aa  63.5  0.000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0506  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.76 
 
 
175 aa  58.5  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0010915  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  28.73 
 
 
183 aa  57.8  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1328  thiredoxin  28.37 
 
 
185 aa  57.4  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1445  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.64 
 
 
182 aa  56.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0469  redoxin domain-containing protein  30.33 
 
 
190 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1313  Redoxin domain protein  32.2 
 
 
182 aa  56.2  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000515497  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0030  Redoxin domain protein  31.73 
 
 
179 aa  55.5  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6264  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.08 
 
 
173 aa  55.5  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.92814  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2118  thioredoxin  27.08 
 
 
164 aa  55.5  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0260  Redoxin domain protein  39.66 
 
 
730 aa  54.7  0.0000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00568025  normal  0.921803 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0032  Redoxin domain protein  27.05 
 
 
182 aa  54.3  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000358102  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2682  thioredoxin  25.86 
 
 
183 aa  53.9  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3927  thioredoxin-like  28.32 
 
 
174 aa  53.9  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298512  normal  0.186192 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3280  thioredoxin-related protein  35.82 
 
 
171 aa  53.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0274  cytochrome c biogenesis protein, putative  33.8 
 
 
194 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0190  cytochrome c biogenesis protein, putative  33.8 
 
 
201 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.648376  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1561  thioredoxin  28.8 
 
 
164 aa  53.5  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00616006  normal  0.258468 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3229  thioredoxin-related protein  40 
 
 
170 aa  53.1  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000047722  normal  0.231945 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2114  thioredoxin family protein  29.92 
 
 
159 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.14615  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0027  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.39 
 
 
185 aa  53.5  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5421  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.46 
 
 
194 aa  52.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  31.88 
 
 
173 aa  52  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.03 
 
 
184 aa  52  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2082  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.75 
 
 
380 aa  51.6  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0739  putative cytochrome C-type biogenesis protein  27.45 
 
 
403 aa  50.4  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0112308  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0475  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.19 
 
 
157 aa  50.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0330837 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18200  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.86 
 
 
178 aa  50.4  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000397372  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1054  thioredoxin  26.71 
 
 
173 aa  50.1  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000221964  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0403  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.3 
 
 
174 aa  50.1  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0051  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.03 
 
 
178 aa  49.3  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.523254  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0738  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.97 
 
 
170 aa  49.3  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.296036  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2293  thioredoxin family protein  30.43 
 
 
183 aa  49.3  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1916  redoxin domain-containing protein  26.85 
 
 
155 aa  48.9  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000172621  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4183  Redoxin domain protein  24.6 
 
 
201 aa  48.9  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438979  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2013  thiol:disulfide interchange protein, thioredoxin family protein  37.14 
 
 
176 aa  48.9  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0451  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  33.77 
 
 
180 aa  48.9  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4156  Redoxin domain protein  24.6 
 
 
204 aa  48.9  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.042351  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1890  redoxin domain-containing protein  26.85 
 
 
155 aa  48.9  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000501621  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2403  Redoxin domain protein  26.85 
 
 
155 aa  48.9  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000463478  hitchhiker  0.00393062 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1923  redoxin domain-containing protein  26.85 
 
 
155 aa  48.9  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00232148  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1223  Redoxin domain protein  26.21 
 
 
170 aa  48.5  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.337108  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0721  cytochrome C biogenesis protein  28.16 
 
 
403 aa  48.9  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3058  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.44 
 
 
188 aa  48.5  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2276  Redoxin domain protein  33.75 
 
 
171 aa  48.5  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3381  redoxin domain-containing protein  31.34 
 
 
171 aa  48.5  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232312  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0240  Redoxin domain protein  30.19 
 
 
188 aa  48.1  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  28.95 
 
 
168 aa  48.1  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0049  Redoxin domain protein  31.09 
 
 
180 aa  47.8  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0841  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30 
 
 
174 aa  47.8  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0364  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40 
 
 
170 aa  47.8  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000189648  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3579  thioredoxin  24.11 
 
 
107 aa  47.8  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.248424  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6861  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.35 
 
 
191 aa  47.8  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0694  thioredoxin  37.5 
 
 
106 aa  47.4  0.0001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.690768  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0413  periplasmic protein thiol  27.42 
 
 
197 aa  47.8  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2212  thioredoxin-like  22.31 
 
 
133 aa  47.8  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.249121  normal  0.498719 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2296  thioredoxin  27.36 
 
 
103 aa  47.4  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1133  thioredoxin  28.45 
 
 
98 aa  47.4  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.114517  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0403  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.04 
 
 
174 aa  47.8  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000117414  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14280  thioredoxin  25.69 
 
 
102 aa  46.6  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.978477  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0866  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.08 
 
 
183 aa  46.6  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4040  electron transport protein SCO1/SenC like  23.81 
 
 
201 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.419524  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2724  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.57 
 
 
188 aa  47  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32328  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  26.85 
 
 
108 aa  46.6  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1959  redoxin domain-containing protein  22.43 
 
 
189 aa  46.2  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0329542  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0817  Redoxin domain protein  25.56 
 
 
182 aa  47  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0724066  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2624  Redoxin domain protein  24.59 
 
 
204 aa  46.6  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1249  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.29 
 
 
331 aa  46.6  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.768567  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2855  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25 
 
 
184 aa  46.6  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1638  thioredoxin family protein  39.53 
 
 
328 aa  45.8  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5344  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.21 
 
 
661 aa  46.2  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0371216  normal  0.0467727 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0187  thioredoxin  36.96 
 
 
108 aa  46.2  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00849594 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3733  redoxin  50 
 
 
187 aa  46.2  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.78163 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4009  redoxin domain-containing protein  35.19 
 
 
332 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3813  Redoxin domain protein  35.19 
 
 
305 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.79 
 
 
187 aa  46.2  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0243  redoxin domain-containing protein  21.26 
 
 
184 aa  45.8  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.487537  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0050  redoxin domain-containing protein  23.77 
 
 
180 aa  46.2  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.577845  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2111  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.72 
 
 
390 aa  46.2  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.245531  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3018  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  34.78 
 
 
178 aa  45.8  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24350  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  23.45 
 
 
203 aa  46.2  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1400  Redoxin domain protein  38.1 
 
 
188 aa  45.8  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.25356  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1632  Redoxin domain protein  24.58 
 
 
190 aa  45.4  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.565368  normal  0.246886 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>