81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0022 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0022  30S ribosomal protein S21  100 
 
 		 70 aa  140  7e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0087  ribosomal protein S21  70 
 
 		 70 aa  101  3e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00102133  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0122  30S ribosomal protein S21  70 
 
 		 70 aa  100  9e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1544  30S ribosomal protein S21  70 
 
 		 70 aa  98.6  3e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.27547  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1587  30S ribosomal protein S21  68.57 
 
 		 70 aa  97.8  4e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0419  30S ribosomal protein S21  68.57 
 
 		 70 aa  97.8  4e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.723054  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0393  30S ribosomal protein S21  68.57 
 
 		 70 aa  97.8  4e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0039  30S ribosomal protein S21  68.57 
 
 		 70 aa  97.1  9e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1556  30S ribosomal protein S21  67.14 
 
 		 74 aa  96.7  1e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1898  30S ribosomal protein S21  42.19 
 
 		 66 aa  57.8  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0497287 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1016  30S ribosomal protein S21  42.37 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.403205  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1191  30S ribosomal protein S21  40 
 
 		 70 aa  49.7  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3093  30S ribosomal protein S21  37.29 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2385  30S ribosomal protein S21  40 
 
 		 70 aa  48.1  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.66325 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1809  ribosomal protein S21  38.33 
 
 		 71 aa  48.1  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000175133  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3053  30S ribosomal protein S21  38.98 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0062932  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2991  ribosomal protein S21  36.67 
 
 		 77 aa  46.2  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0529  30S ribosomal protein S21  38.33 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0313  ribosomal protein S21  41.67 
 
 		 71 aa  45.1  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00659412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5147  30S ribosomal protein S21  31.43 
 
 		 71 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4639  30S ribosomal protein S21  31.43 
 
 		 71 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.459831 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0539  ribosomal protein S21  31.43 
 
 		 71 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2060  30S ribosomal protein S21  38.33 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3017  30S ribosomal protein S21  35 
 
 		 71 aa  43.5  0.0009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161962  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1931  ribosomal protein S21  36.67 
 
 		 71 aa  43.9  0.0009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.235435  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04101  30S ribosomal protein S21  33.9 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.713135  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0326  30S ribosomal protein S21  33.9 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.433894 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3944  30S ribosomal protein S21  38.33 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1098  30S ribosomal protein S21  33.33 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0269  ribosomal protein S21  33.9 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.34279 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1089  30S ribosomal protein S21  44.19 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3487  30S ribosomal protein S21  35 
 
 		 71 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000434103  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0636  30S ribosomal protein S21  35 
 
 		 71 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000159667  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0634  30S ribosomal protein S21  35 
 
 		 71 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000614997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3358  30S ribosomal protein S21  35 
 
 		 71 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000000749532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1804  30S ribosomal protein S21  33.9 
 
 		 71 aa  42  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0635  ribosomal protein S21  35 
 
 		 71 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.12914e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0785  30S ribosomal protein S21  35 
 
 		 71 aa  42  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000840421  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0550  30S ribosomal protein S21  35 
 
 		 71 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000276369  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3499  30S ribosomal protein S21  35 
 
 		 71 aa  42  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  2.79306e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3395  30S ribosomal protein S21  35 
 
 		 71 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000100201  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02885  hypothetical protein  35 
 
 		 71 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000339059  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3368  30S ribosomal protein S21  35 
 
 		 71 aa  42  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000285201  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3469  30S ribosomal protein S21  35 
 
 		 71 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000763372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3463  30S ribosomal protein S21  35 
 
 		 71 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000248235  normal  0.0117511 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4377  30S ribosomal protein S21  35 
 
 		 71 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000254067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3565  30S ribosomal protein S21  35 
 
 		 71 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000476189  normal  0.236523 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3399  30S ribosomal protein S21  35 
 
 		 71 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000123882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0301  30S ribosomal protein S21  35 
 
 		 71 aa  42  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000000915609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2519  30S ribosomal protein S21  33.33 
 
 		 71 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.58825 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0719  30S ribosomal protein S21  33.33 
 
 		 71 aa  42  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00024481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1366  30S ribosomal protein S21  44.19 
 
 		 67 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3471  30S ribosomal protein S21  35 
 
 		 71 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000524554  normal  0.190946 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0555  30S ribosomal protein S21  35 
 
 		 71 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.0089e-17  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02935  30S ribosomal protein S21  35 
 
 		 71 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000377875  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3245  30S ribosomal protein S21  35 
 
 		 71 aa  42  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3626999999999999e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3529  30S ribosomal protein S21  35 
 
 		 71 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000026344  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4298  30S ribosomal protein S21  35 
 
 		 71 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0121061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00851  30S ribosomal protein S21  35 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0047  30S ribosomal protein S21  35 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000427193  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001621  SSU ribosomal protein S21p  35 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000157507  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1237  30S ribosomal protein S21  36.67 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.916672  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0618  30S ribosomal protein S21  35 
 
 		 71 aa  41.2  0.004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.141682  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0336  30S ribosomal protein S21  36.67 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0836  30S ribosomal protein S21  36.67 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2207  30S ribosomal protein S21  36.67 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0618  30S ribosomal protein S21  36.67 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4816  30S ribosomal protein S21  36.67 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.56281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4482  30S ribosomal protein S21  36.67 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.590266  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3883  30S ribosomal protein S21  36.67 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.396408 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1517  30S ribosomal protein S21  36.67 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.975916  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2529  30S ribosomal protein S21  36.67 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2387  30S ribosomal protein S21  36.67 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.989571  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0369  30S ribosomal protein S21  36.67 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1736  30S ribosomal protein S21  33.9 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.688471  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3644  30S ribosomal protein S21  36.67 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2609  30S ribosomal protein S21P  38.33 
 
 		 70 aa  40.8  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.257683  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1918  30S ribosomal protein S21  36.36 
 
 		 58 aa  40.8  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.295608  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2280  30S ribosomal protein S21  35 
 
 		 79 aa  40.4  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2307  30S ribosomal protein S21  35 
 
 		 79 aa  40.4  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2823  30S ribosomal protein S21  36.67 
 
 		 70 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>