51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4507 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4507  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  246  6e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5017  hypothetical protein  93.44 
 
 		 122 aa  231  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000206604 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3816  hypothetical protein  60.75 
 
 		 121 aa  134  6.0000000000000005e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911141 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6315  membrane protein-like protein  64.52 
 
 		 109 aa  130  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.421326  normal  0.32672 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2130  hypothetical protein  62.64 
 
 		 110 aa  127  7.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.733046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1160  protein of unknown function DUF485  54.46 
 
 		 115 aa  124  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.280766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2861  hypothetical protein  56.36 
 
 		 116 aa  124  5e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.147308  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0070  protein of unknown function DUF485  53.98 
 
 		 118 aa  122  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3374  protein of unknown function DUF485  61.17 
 
 		 119 aa  121  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3168  protein of unknown function DUF485  59.57 
 
 		 114 aa  120  8e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0533569  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12110  predicted membrane protein  50.91 
 
 		 114 aa  117  7.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.185749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03070  predicted membrane protein  49.52 
 
 		 110 aa  116  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.876945  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2140  hypothetical protein  55.88 
 
 		 138 aa  114  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.533174  normal  0.34536 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4563  hypothetical protein  56.86 
 
 		 116 aa  115  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.973146  normal  0.560314 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4129  hypothetical protein  52.34 
 
 		 105 aa  113  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0463053  normal  0.660738 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1395  protein of unknown function DUF485  47.46 
 
 		 126 aa  113  7.999999999999999e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000134862 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4054  hypothetical protein  52.34 
 
 		 105 aa  113  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.785898  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4283  hypothetical protein  51.4 
 
 		 105 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1377  hypothetical protein  49.55 
 
 		 126 aa  111  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0348  hypothetical protein  47.79 
 
 		 120 aa  107  7.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.614159  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0218  protein of unknown function DUF485  48.6 
 
 		 133 aa  106  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1968  protein of unknown function DUF485  52.94 
 
 		 122 aa  105  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.611939  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1813  protein of unknown function DUF485  49.11 
 
 		 115 aa  102  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4126  protein of unknown function DUF485  53.12 
 
 		 132 aa  101  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06900  predicted membrane protein  45.05 
 
 		 124 aa  99.8  1e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1074  protein of unknown function DUF485  49.06 
 
 		 112 aa  98.2  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111715  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13330  predicted membrane protein  52.13 
 
 		 136 aa  94  6e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.221279  normal  0.152082 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0695  protein of unknown function DUF485  55.1 
 
 		 118 aa  93.6  7e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3658  protein of unknown function DUF485  47.62 
 
 		 111 aa  92.8  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.285838  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2995  protein of unknown function DUF485  48.57 
 
 		 148 aa  70.9  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.987637  normal  0.33193 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5173  protein of unknown function DUF485  44.74 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0828  protein of unknown function DUF485  31.25 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1339  hypothetical protein  32.97 
 
 		 102 aa  52  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0144  hypothetical protein  31.37 
 
 		 104 aa  50.1  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1725  hypothetical protein  27.84 
 
 		 113 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.370617  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3287  hypothetical protein  39.06 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1702  hypothetical protein  29.67 
 
 		 113 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1776  hypothetical protein  29.67 
 
 		 113 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.298522  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2636  hypothetical protein  26.26 
 
 		 102 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.236815  normal  0.0699685 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2623  hypothetical protein  26.26 
 
 		 102 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.310407 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1329  hypothetical protein  30.21 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392251  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1634  hypothetical protein  29.67 
 
 		 113 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1479  hypothetical protein  29.67 
 
 		 113 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1489  hypothetical protein  29.67 
 
 		 113 aa  45.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0531536  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1517  hypothetical protein  29.67 
 
 		 113 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.768712  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2486  hypothetical protein  26.26 
 
 		 102 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.424644  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3273  hypothetical protein  26.26 
 
 		 102 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1522  hypothetical protein  29.67 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5184  hypothetical protein  29.55 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.401693  normal  0.159857 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0532  hypothetical protein  29.55 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0969  hypothetical protein  29.41 
 
 		 109 aa  40.4  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>