31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4038 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4038  hypothetical protein  100 
 
 		 331 aa  619  1e-176  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4420  hypothetical protein  70.69 
 
 		 330 aa  305  6e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.204685  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5869  hypothetical protein  36.5 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00430744  normal  0.104668 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0730  Flp pilus assembly protein TadB-like protein  50 
 
 		 270 aa  62  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.258746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4890  type II secretion system protein  40.46 
 
 		 262 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.830749  normal  0.078643 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4804  type II secretion system protein  40.46 
 
 		 262 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.422865  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1385  type II secretion system protein  37.89 
 
 		 261 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0556186  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3160  hypothetical protein  37.14 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0670324 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2776  hypothetical protein  48.35 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0377209  hitchhiker  0.0000127528 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5406  type II secretion system protein  36.84 
 
 		 260 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0943658 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5191  type II secretion system protein  39.84 
 
 		 262 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0306742  hitchhiker  0.000243657 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35910  Flp pilus assembly protein TadB  37.23 
 
 		 282 aa  54.7  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0051  integral membrane protein  41.94 
 
 		 270 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.741215  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3907  Type II secretion system F domain protein  39.23 
 
 		 269 aa  53.9  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13688  transmembrane protein  40 
 
 		 266 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.76431e-37  normal  0.0719684 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0593  hypothetical protein  42.42 
 
 		 264 aa  50.1  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0215  type II secretion system protein  37.4 
 
 		 263 aa  49.7  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2539  hypothetical protein  30.77 
 
 		 336 aa  49.3  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0365  type II secretion system protein  33.59 
 
 		 258 aa  48.5  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000784709  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0248  type II secretion system protein  28.57 
 
 		 290 aa  47.8  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1045  type II secretion system protein  30 
 
 		 306 aa  47  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.506555  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1792  type II secretion system protein  30 
 
 		 335 aa  47.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0984165  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1771  type II secretion system protein  30 
 
 		 335 aa  47.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0120  hypothetical protein  30 
 
 		 306 aa  47  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0013193  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1775  type II secretion system protein  30 
 
 		 306 aa  47  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.628418  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1945  putative fimbriae-related outer membrane protein  30 
 
 		 335 aa  47.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000171773  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0519  Type II secretion system F domain protein  47.62 
 
 		 264 aa  46.6  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1981  putative integral membrane protein  36.46 
 
 		 272 aa  46.2  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0481  Flp pilus assembly protein TadB-like protein  42.22 
 
 		 234 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1406  type II secretion system protein  28.97 
 
 		 322 aa  43.1  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0277  type II secretion system protein  43.66 
 
 		 251 aa  42.7  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>