More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2723 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2723  alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 338 aa  680    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0619136  normal  0.4282 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2101  alcohol dehydrogenase  63.82 
 
 		 340 aa  421  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0244583 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4359  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  50.29 
 
 		 343 aa  338  8e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71630  alcohol dehydrogenase  39.18 
 
 		 342 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.689289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6215  alcohol dehydrogenase  39.18 
 
 		 342 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4951  alcohol dehydrogenase  39.24 
 
 		 337 aa  211  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.179579  normal  0.722562 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0120  alcohol dehydrogenase  37.21 
 
 		 340 aa  209  4e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5308  alcohol dehydrogenase  35.94 
 
 		 341 aa  209  6e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346008  normal  0.295753 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1905  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.88 
 
 		 336 aa  208  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3732  alcohol dehydrogenase  38.19 
 
 		 336 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.564534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0428  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  37.61 
 
 		 341 aa  207  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3677  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.5 
 
 		 342 aa  206  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.212434  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07960  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  37.72 
 
 		 342 aa  206  5e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5870  alcohol dehydrogenase  40.71 
 
 		 341 aa  205  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.801122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2912  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.6 
 
 		 342 aa  203  3e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9223  alcohol dehydrogenase  36.92 
 
 		 347 aa  203  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2461  alcohol dehydrogenase  36.92 
 
 		 344 aa  202  5e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.806463  normal  0.872152 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1631  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.62 
 
 		 335 aa  202  5e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205329  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5867  alcohol dehydrogenase  37.9 
 
 		 342 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.74196  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3928  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  37.9 
 
 		 342 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4438  alcohol dehydrogenase  37.9 
 
 		 342 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2367  alcohol dehydrogenase  37.21 
 
 		 344 aa  202  8e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.305861 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2868  alcohol dehydrogenase  37.72 
 
 		 342 aa  201  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1821  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.1 
 
 		 342 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2642  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  37.61 
 
 		 357 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0311111  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0132  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  37.61 
 
 		 341 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1046  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  37.61 
 
 		 341 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2784  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  37.61 
 
 		 341 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95808  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0157  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  37.61 
 
 		 341 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1872  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.32 
 
 		 341 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.76 
 
 		 337 aa  201  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1300  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  37.61 
 
 		 341 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1889  alcohol dehydrogenase  37.43 
 
 		 343 aa  200  3e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2341  alcohol dehydrogenase  36.55 
 
 		 348 aa  199  3.9999999999999996e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3130  putative propanol-preferring alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  37.03 
 
 		 341 aa  199  7e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.320516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1093  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.92 
 
 		 342 aa  199  7e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417827 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0272  alcohol dehydrogenase  36.05 
 
 		 344 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0203  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.66 
 
 		 344 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0237  alcohol dehydrogenase  34.99 
 
 		 336 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.15535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0195  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.66 
 
 		 344 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4330  alcohol dehydrogenase  36.73 
 
 		 342 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0511391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5668  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.77 
 
 		 339 aa  197  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2945  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.27 
 
 		 336 aa  196  5.000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.232638 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1693  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.13 
 
 		 343 aa  195  7e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4434  alcohol dehydrogenase  36.34 
 
 		 341 aa  195  7e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.660571 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2996  alcohol dehydrogenase  37.32 
 
 		 344 aa  194  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3044  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.92 
 
 		 338 aa  194  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.165067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3231  alcohol dehydrogenase  36.26 
 
 		 344 aa  193  3e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.232586  normal  0.423242 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3087  alcohol dehydrogenase  35.47 
 
 		 340 aa  192  6e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2787  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.17 
 
 		 340 aa  192  6e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0147345 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21430  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  35.76 
 
 		 343 aa  192  8e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2455  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.55 
 
 		 341 aa  192  9e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0402803  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3853  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.43 
 
 		 336 aa  192  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5768  alcohol dehydrogenase  35.67 
 
 		 342 aa  191  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1066  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  38.6 
 
 		 339 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.743833  normal  0.0804762 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5179  alcohol dehydrogenase  37.61 
 
 		 348 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1967  alcohol dehydrogenase  36.52 
 
 		 344 aa  189  7e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0774  alcohol dehydrogenase  34.88 
 
 		 342 aa  189  7e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.623956  normal  0.377339 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0752  alcohol dehydrogenase  36.64 
 
 		 341 aa  189  7e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0027127  normal  0.0151897 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0028  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.5 
 
 		 342 aa  187  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0233433  decreased coverage  0.000000000133046 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0527  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  35.65 
 
 		 344 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0720  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.47 
 
 		 342 aa  183  3e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.546912  normal  0.597384 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3870  alcohol dehydrogenase  36.73 
 
 		 338 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  normal  0.388912 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0931  alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.26 
 
 		 339 aa  179  4e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0581  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.88 
 
 		 368 aa  179  7e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3322  alcohol dehydrogenase  34.43 
 
 		 338 aa  173  5e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.596213  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1311  alcohol dehydrogenase  35.28 
 
 		 348 aa  172  5.999999999999999e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.14429 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6430  alcohol dehydrogenase  38.01 
 
 		 338 aa  169  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.400755 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf738  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  31.14 
 
 		 350 aa  168  1e-40  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00889  alcohol dehydrogenase  35.61 
 
 		 343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2555  alcohol dehydrogenase  36.84 
 
 		 339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.726644  normal  0.319996 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0054  alcohol dehydrogenase  34.29 
 
 		 338 aa  161  1e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000063384  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0491  alcohol dehydrogenase  37.83 
 
 		 337 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.186055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0502  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  37.83 
 
 		 337 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0602082  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0513  alcohol dehydrogenase  37.83 
 
 		 337 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0562  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.43 
 
 		 347 aa  159  5e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1719  alcohol dehydrogenase  34.29 
 
 		 344 aa  157  3e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0768  alcohol dehydrogenase  31.73 
 
 		 341 aa  156  4e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6148  alcohol dehydrogenase  36.39 
 
 		 343 aa  156  6e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1496  alcohol dehydrogenase  30.64 
 
 		 342 aa  155  9e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000183073  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_27980  alcohol dehydrogenase  30.23 
 
 		 348 aa  155  1e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1990  alcohol dehydrogenase  31.16 
 
 		 340 aa  154  1e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.275067  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1193  alcohol dehydrogenase  31.27 
 
 		 344 aa  154  2e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2398  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.33 
 
 		 333 aa  154  2e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.732037  normal  0.947201 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0121  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  34.43 
 
 		 338 aa  153  4e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6441  alcohol dehydrogenase  35.8 
 
 		 343 aa  152  8e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0372  alcohol dehydrogenase  37.61 
 
 		 342 aa  151  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0643  alcohol dehydrogenase  29.89 
 
 		 336 aa  151  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02510  alcohol dehydrogenase, putative  30.64 
 
 		 357 aa  151  2e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.886451  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0628  alcohol dehydrogenase  29.89 
 
 		 336 aa  151  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2050  alcohol dehydrogenase  30.75 
 
 		 345 aa  150  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0843649  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3075  alcohol dehydrogenase  31.18 
 
 		 345 aa  150  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582004 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1541  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.32 
 
 		 409 aa  149  4e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2111  alcohol dehydrogenase  31.34 
 
 		 345 aa  149  5e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.161911  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2048  alcohol dehydrogenase  31.34 
 
 		 345 aa  149  5e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.892087  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2267  alcohol dehydrogenase  31.34 
 
 		 345 aa  149  5e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2293  alcohol dehydrogenase  31.34 
 
 		 345 aa  149  5e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000403222 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2296  alcohol dehydrogenase  31.34 
 
 		 347 aa  149  8e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.52857  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2089  alcohol dehydrogenase  31.05 
 
 		 345 aa  149  8e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.431747  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1098  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.54 
 
 		 361 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000632504  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>