17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2311 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2311  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 424 aa  851    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.4937 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4121  helix-turn-helix domain-containing protein  94.08 
 
 		 184 aa  317  2e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3931  hypothetical protein  36.9 
 
 		 445 aa  96.3  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00536629  normal  0.131737 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4668  hypothetical protein  41.96 
 
 		 425 aa  90.1  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7276  hypothetical protein  31.78 
 
 		 475 aa  68.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209812  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4411  hypothetical protein  41.67 
 
 		 166 aa  64.7  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.959952 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4886  hypothetical protein  44 
 
 		 250 aa  61.6  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0163  hypothetical protein  30.25 
 
 		 505 aa  60.8  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6244  hypothetical protein  32.81 
 
 		 418 aa  57  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.699378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2099  tetratricopeptide TPR_4  32.31 
 
 		 470 aa  52  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9241  hypothetical protein  27.57 
 
 		 428 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6314  helix-turn-helix domain-containing protein  28.99 
 
 		 443 aa  46.6  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2778  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  41.27 
 
 		 401 aa  46.2  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5545  XRE family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 443 aa  44.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2843  transcriptional regulator, XRE family  38.24 
 
 		 401 aa  45.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07960  Helix-turn-helix protein  30.67 
 
 		 444 aa  44.3  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1022  XRE family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 441 aa  43.9  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.936661 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>