57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1508 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1508  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  366  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0694304 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1650  transposase IS4 family protein  55.96 
 
 		 432 aa  111  6e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.156297  normal  0.0326148 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4421  putative IS4 family transposase  48.67 
 
 		 427 aa  89.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0265932 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1302  IS4 family transposase  49.12 
 
 		 396 aa  65.1  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.24004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2739  transposase  35.29 
 
 		 462 aa  65.1  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.515856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2877  transposase  35.29 
 
 		 462 aa  65.1  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.156235  normal  0.359702 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4606  transposase  35.29 
 
 		 462 aa  65.1  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7107  transposase  35.29 
 
 		 462 aa  65.1  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4487  transposase IS4 family protein  46.38 
 
 		 403 aa  63.9  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0311  putative IS4 family transposase  47.27 
 
 		 445 aa  62  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36140  FOG transposase  41.18 
 
 		 401 aa  61.2  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0467  transposase IS701  39.24 
 
 		 416 aa  60.1  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.529272  normal  0.0154733 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1727  transposase IS701  39.24 
 
 		 416 aa  60.1  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1738  transposase IS701  39.24 
 
 		 416 aa  60.1  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2323  transposase IS701  39.24 
 
 		 416 aa  60.1  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.564706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2731  transposase IS701  39.24 
 
 		 416 aa  60.1  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.73421  normal  0.105734 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6861  transposase  36.59 
 
 		 402 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3530  transposase  44.29 
 
 		 399 aa  56.2  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.407698  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2600  transposase  44.29 
 
 		 399 aa  56.2  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0535521  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3272  transposase IS4 family protein  45.76 
 
 		 390 aa  55.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5626  transposase  38.71 
 
 		 417 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.35278 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4639  transposase IS4 family protein  44.23 
 
 		 394 aa  52.4  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3143  transposase IS4 family protein  44.23 
 
 		 418 aa  52.4  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5412  transposase  43.4 
 
 		 170 aa  51.2  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0306805  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3616  transposase  38.89 
 
 		 467 aa  48.1  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2537  transposase IS4 family protein  38.6 
 
 		 412 aa  47.8  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000138999  hitchhiker  0.00019554 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2535  transposase IS4 family protein  38.6 
 
 		 412 aa  47.8  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000011121  decreased coverage  0.000048455 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1609  transposase IS4 family protein  38.6 
 
 		 412 aa  47.8  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.200563  normal  0.245783 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1728  putative transposase  39.62 
 
 		 432 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.579187  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1763  putative transposase  39.62 
 
 		 435 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2753  transposase  39.22 
 
 		 298 aa  45.1  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0858288 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0887  transposase  37.5 
 
 		 428 aa  44.7  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1584  transposase  37.5 
 
 		 428 aa  44.7  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.501832  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1668  transposase  37.5 
 
 		 428 aa  44.7  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000920779  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4146  transposase  37.5 
 
 		 428 aa  44.7  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3628  transposase  37.5 
 
 		 428 aa  44.7  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.349747  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2785  transposase  37.5 
 
 		 428 aa  44.7  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.948606  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2511  transposase  29.82 
 
 		 396 aa  43.9  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0160995  normal  0.39101 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2296  transposase  29.82 
 
 		 396 aa  43.9  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00584103  normal  0.663647 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0126  ISRSO17-transposase protein  29.03 
 
 		 443 aa  43.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00370218  normal  0.579487 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0156  ISRSO17-transposase protein  29.03 
 
 		 445 aa  43.5  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0179045  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0475  ISRSO17-transposase protein  29.03 
 
 		 443 aa  43.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1135  ISRSO17-transposase protein  29.03 
 
 		 453 aa  43.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.408398  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41850  transposase  27.36 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1301  ISRSO17-transposase protein  29.03 
 
 		 453 aa  43.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32030  ISRSO17-transposase protein  27.36 
 
 		 453 aa  43.5  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16660  ISRSO17-transposase protein  27.36 
 
 		 453 aa  43.5  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1331  ISRSO17-transposase protein  29.03 
 
 		 453 aa  43.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1362  ISRSO17-transposase protein  29.03 
 
 		 453 aa  43.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.717233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1089  transposase, IS4  39.62 
 
 		 390 aa  43.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2794  transposase IS4 family protein  39.22 
 
 		 418 aa  43.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4960  transposase IS4 family protein  35.85 
 
 		 439 aa  42.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.651536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4227  transposase, IS4  39.62 
 
 		 432 aa  42  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3201  transposase  38.98 
 
 		 418 aa  41.2  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.25369  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0153  putative transposase  33.33 
 
 		 427 aa  41.2  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3076  transposase  30.67 
 
 		 478 aa  41.2  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3158  transposase  38.98 
 
 		 418 aa  41.2  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>