21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1315 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1315  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  227  4e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3105  transposase IS4 family protein  77.78 
 
 		 260 aa  94  6e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.297989  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3041  transposase IS4 family protein  77.78 
 
 		 260 aa  94  6e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3646  transposase, IS4 family  63.89 
 
 		 260 aa  91.3  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1998  transposase IS4 family protein  61.11 
 
 		 259 aa  87.8  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0111459 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0963  hypothetical protein  70 
 
 		 326 aa  76.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6087  transposase IS4 family protein  47.22 
 
 		 280 aa  72  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0183  transposase IS4 family protein  47.22 
 
 		 280 aa  72  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0583  transposase IS4 family protein  47.22 
 
 		 280 aa  72  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.319362  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3271  transposase IS4 family protein  47.22 
 
 		 280 aa  72  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.524665  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3659  transposase IS4 family protein  47.22 
 
 		 280 aa  72  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3416  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  50 
 
 		 258 aa  71.2  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0585  transposase IS4 family protein  55.56 
 
 		 253 aa  60.8  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.384554  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0120  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2062  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 257 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.119885 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2531  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 257 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1783  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 257 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.138367 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0143  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 257 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2123  putative IS493-like transposase  43.75 
 
 		 76 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.701384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4558  transposase IS4 family protein  63.64 
 
 		 274 aa  54.3  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.16009  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0961  transposase, IS4  54.55 
 
 		 249 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0578745  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>