29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1007 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1007  hypothetical protein  100 
 
 		 558 aa  1085    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.517138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1376  hypothetical protein  30.87 
 
 		 576 aa  165  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1070  protein of unknown function DUF324  28.52 
 
 		 597 aa  108  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1859  hypothetical protein  28.93 
 
 		 594 aa  99.8  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2526  hypothetical protein  25.63 
 
 		 504 aa  95.9  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3292  hypothetical protein  32 
 
 		 622 aa  95.9  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.798448 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1918  hypothetical protein  29.67 
 
 		 513 aa  80.9  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3212  hypothetical protein  23.72 
 
 		 443 aa  77.8  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20530  uncharacterized RAMP superfamily protein probably involved in DNA repair  27.33 
 
 		 415 aa  68.6  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0984  CRISPR-associated RAMP protein, SSO1426 family  26.62 
 
 		 274 aa  67  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1149  hypothetical protein  27.65 
 
 		 447 aa  64.7  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0538158  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1801  CRISPR-associated Csm3 family protein  27.63 
 
 		 282 aa  64.3  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2051  CRISPR-associated Csm3 family protein  23.46 
 
 		 260 aa  62.8  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2392  hypothetical protein  25.78 
 
 		 338 aa  59.3  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.556583  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1834  hypothetical protein  21.31 
 
 		 472 aa  58.2  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2390  SSO1426 family CRISPR-associated RAMP protein  25.63 
 
 		 299 aa  56.6  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.293028  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0365  CRISPR-associated Csm3 family protein  26.1 
 
 		 289 aa  53.9  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00395983 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0138  protein of unknown function DUF324  21.18 
 
 		 474 aa  53.9  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0364  hypothetical protein  25.41 
 
 		 354 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00389442 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0740  hypothetical protein  27.75 
 
 		 257 aa  52.4  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0101279  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0188  CRISPR-associated Csm3 family protein  27.07 
 
 		 288 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3258  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  25.83 
 
 		 251 aa  50.1  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5586  CRISPR-associated RAMP protein, SSO1426 family  27.39 
 
 		 280 aa  48.5  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.199853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1629  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  21.43 
 
 		 215 aa  48.1  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0187  hypothetical protein  32.17 
 
 		 355 aa  46.6  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1228  protein of unknown function DUF324  26.82 
 
 		 453 aa  45.8  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.726427  normal  0.459796 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0985  protein of unknown function DUF324  36 
 
 		 298 aa  45.1  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1800  hypothetical protein  39.44 
 
 		 299 aa  43.9  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2986  protein of unknown function DUF324  29.95 
 
 		 541 aa  43.5  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0321062  normal  0.494788 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>