25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0724 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0724  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  347  6e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.262033 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0670  hypothetical protein  53.3 
 
 		 181 aa  175  4e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3135  hypothetical protein  48.75 
 
 		 228 aa  67  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.376033 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4486  hypothetical protein  43.96 
 
 		 218 aa  61.2  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0757843  normal  0.0218675 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0672  hypothetical protein  42.31 
 
 		 85 aa  58.5  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.368804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5044  hypothetical protein  35.26 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0726  hypothetical protein  42.68 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.290467 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11258  hypothetical protein  42.65 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144269 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2282  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  46.03 
 
 		 320 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.441037  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2321  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  46.03 
 
 		 320 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.46375  normal  0.0771435 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2329  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  46.03 
 
 		 320 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0783564  normal  0.0873524 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3999  hypothetical protein  42.86 
 
 		 179 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.397855  normal  0.350916 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1470  hypothetical protein  36.45 
 
 		 104 aa  52  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.856687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4059  hypothetical protein  42.11 
 
 		 185 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.910239 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3985  hypothetical protein  42.11 
 
 		 185 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2937  hypothetical protein  32.89 
 
 		 129 aa  48.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.875115 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4437  hypothetical protein  38.24 
 
 		 484 aa  42.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0486392 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1726  hypothetical protein  32.1 
 
 		 94 aa  42  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.525839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0532  hypothetical protein  37.5 
 
 		 162 aa  42  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.250908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1385  HesB/YadR/YfhF  37.8 
 
 		 105 aa  42.4  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000550441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2843  hypothetical protein  43.33 
 
 		 110 aa  41.6  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.15317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2703  hypothetical protein  33.9 
 
 		 160 aa  41.6  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2179  hypothetical protein  33.72 
 
 		 161 aa  41.6  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.806217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2142  hypothetical protein  31.25 
 
 		 102 aa  41.2  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0397  hypothetical protein  31.58 
 
 		 137 aa  40.8  0.009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.334737  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>