73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2050 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_2050  hypothetical protein  100 
 
 
81 aa  156  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0515  hypothetical protein  40.54 
 
 
84 aa  60.1  0.00000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0882  hypothetical protein  38.89 
 
 
77 aa  53.1  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000154321  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0298  hypothetical protein  36.36 
 
 
79 aa  52.8  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000067955  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1496  nucleic acid binding protein  36.49 
 
 
78 aa  52  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0525102  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0030  hypothetical protein  38.24 
 
 
78 aa  51.6  0.000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00000268476  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1370  RNA-binding protein (KH domain)  36.11 
 
 
76 aa  51.6  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209331  normal  0.279466 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3759  hypothetical protein  34.72 
 
 
76 aa  50.8  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0453276  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1198  hypothetical protein  38.57 
 
 
75 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00403857  normal  0.0990302 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0657  hypothetical protein  37.5 
 
 
75 aa  50.8  0.000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000412714  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1633  RNA-binding protein  28.38 
 
 
81 aa  50.8  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2054  hypothetical protein  36.11 
 
 
75 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000563212  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1711  hypothetical protein  37.5 
 
 
75 aa  49.3  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000142636  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0741  nucleic acid binding protein  36.11 
 
 
76 aa  48.9  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000419264 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0768  nucleic acid binding protein  41.27 
 
 
76 aa  48.9  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000813244  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2537  RNA-binding protein  30.26 
 
 
142 aa  48.9  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.0000157008  hitchhiker  0.00858549 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0969  RNA-binding protein  36.11 
 
 
77 aa  49.3  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000537782  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1683  hypothetical protein  37.5 
 
 
75 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000180762  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1965  hypothetical protein  37.5 
 
 
75 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.780518  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0968  hypothetical protein  38.81 
 
 
76 aa  48.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000604549  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1980  RNA-binding protein  31.08 
 
 
78 aa  47.4  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07310  nucleic acid binding protein, containing KH domain  36.62 
 
 
75 aa  47.4  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.97111e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1964  hypothetical protein  25 
 
 
76 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2049  hypothetical protein  25 
 
 
76 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.24767  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1915  hypothetical protein  25 
 
 
76 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1353  RNA-binding protein (contains KH domain)-like protein  26.39 
 
 
89 aa  46.6  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000330341  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1089  nucleic acid binding protein  33.8 
 
 
83 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000185572  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1379  KH domain protein  35.21 
 
 
84 aa  46.2  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000155975  normal  0.609629 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1302  RNA-binding protein  38.89 
 
 
74 aa  46.2  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0145961  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2407  RNA binding protein  38.57 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000104085  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0663  hypothetical protein  31.94 
 
 
80 aa  46.2  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.82455  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2870  KH, type 1  34.38 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000364358  hitchhiker  0.000000513189 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0689  RNA-binding protein (contains KH domain protein)-like protein  27.78 
 
 
100 aa  45.4  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000409438  hitchhiker  0.000420996 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1168  hypothetical protein  31.17 
 
 
79 aa  45.8  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225392  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2451  KH, type 1  32.81 
 
 
76 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000946472  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2223  RNA-binding protein  36.11 
 
 
77 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.17627e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1144  hypothetical protein  31.58 
 
 
128 aa  46.2  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0142983  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0644  KH domain-containing protein  32.81 
 
 
76 aa  45.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.20541  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0021  hypothetical protein  29.73 
 
 
78 aa  45.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.055536  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1097  KH domain-containing protein  31.25 
 
 
76 aa  45.1  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00599879  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3492  KH, type 1, domain protein  34.38 
 
 
76 aa  44.3  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.05823e-30 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3430  KH, type 1, domain protein  34.38 
 
 
76 aa  44.3  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000151777  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1389  RNA-binding protein  29.58 
 
 
73 aa  44.3  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0563249  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4620  RNA-binding protein  27.78 
 
 
87 aa  43.9  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000138257  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1093  R-binding protein (contains KH domain)  29.87 
 
 
80 aa  43.9  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  5.71907e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2771  hypothetical protein  26.32 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.341296 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2873  RNA-binding protein  22.86 
 
 
84 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2188  hypothetical protein  28.79 
 
 
80 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0391463  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3762  KH domain-containing protein  32.81 
 
 
76 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000539033  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2084  hypothetical protein  31.88 
 
 
80 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1804  RNA-binding protein  46.15 
 
 
74 aa  43.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000242663  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1415  hypothetical protein  30.56 
 
 
75 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00178468  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0144  hypothetical protein  30.14 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0711  nucleic acid binding protein  44.68 
 
 
77 aa  42.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000841646  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1966  hypothetical protein  28.79 
 
 
80 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.179038  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2277  hypothetical protein  29.03 
 
 
72 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0054158  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2012  hypothetical protein  28.79 
 
 
80 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.313357 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1008  RNA-binding protein (KH domain)  30.65 
 
 
74 aa  41.6  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0103799  normal  0.256823 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3135  KH domain-containing protein  29.23 
 
 
77 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.020256  normal  0.101558 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5263  hypothetical protein  25 
 
 
144 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.133032 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1946  hypothetical protein  28.79 
 
 
80 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.801249  normal  0.846266 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4174  hypothetical protein  28.79 
 
 
80 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1288  RNA-binding protein  26.76 
 
 
75 aa  41.2  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5906  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12922  hypothetical protein  27.27 
 
 
80 aa  41.2  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.856852  normal  0.613221 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1053  hypothetical protein  21.92 
 
 
77 aa  41.2  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2484  hypothetical protein  30 
 
 
82 aa  40.8  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.307356  normal  0.0960176 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0325  hypothetical protein  21.92 
 
 
77 aa  40.8  0.006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.851867 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10980  predicted RNA-binding protein (contains KH domain)  34.72 
 
 
85 aa  41.2  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000425582  unclonable  0.00000000129686 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5925  hypothetical protein  27.03 
 
 
79 aa  40.4  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.159157  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00320  RNA-binding protein (KH domain)  35.21 
 
 
84 aa  40.4  0.008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000739144  hitchhiker  0.00000000000355006 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2886  hypothetical protein  27.78 
 
 
77 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.404491 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1618  hypothetical protein  30.43 
 
 
82 aa  40.4  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0250504  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09760  hypothetical protein  24.32 
 
 
79 aa  40.4  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0801933  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>