35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2537 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_2537  RNA-binding protein  100 
 
 		 142 aa  293  7e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.0000157008  hitchhiker  0.00858549 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1144  hypothetical protein  63.53 
 
 		 128 aa  119  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0142983  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5263  hypothetical protein  62.79 
 
 		 144 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.133032 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2771  hypothetical protein  56.7 
 
 		 123 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.341296 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4356  hypothetical protein  63.77 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000661569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1955  RNA-binding protein (contains KH domain)-like protein  50 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1982  RNA-binding protein contains KH domain  50 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000742091  normal  0.027281 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1773  hypothetical protein  41.84 
 
 		 105 aa  82.8  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0689  RNA-binding protein (contains KH domain protein)-like protein  33.77 
 
 		 100 aa  50.1  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000409438  hitchhiker  0.000420996 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10980  predicted RNA-binding protein (contains KH domain)  35.71 
 
 		 85 aa  50.1  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000425582  unclonable  0.00000000129686 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2050  hypothetical protein  30.26 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1389  RNA-binding protein  37.33 
 
 		 73 aa  48.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0563249  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2482  hypothetical protein  34.62 
 
 		 80 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0272988  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00320  RNA-binding protein (KH domain)  34.18 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000739144  hitchhiker  0.00000000000355006 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2484  hypothetical protein  35.44 
 
 		 82 aa  45.1  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.307356  normal  0.0960176 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1379  KH domain protein  29.11 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000155975  normal  0.609629 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2495  KH domain-containing protein  31.51 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000287664  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2222  hypothetical protein  32.05 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000657625 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09160  RNA-binding protein (KH domain)  35.44 
 
 		 81 aa  42  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.880979  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1980  RNA-binding protein  29.33 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2188  hypothetical protein  26.83 
 
 		 80 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0391463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1966  hypothetical protein  27.71 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.179038  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4174  hypothetical protein  27.71 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1946  hypothetical protein  27.71 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.801249  normal  0.846266 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2012  hypothetical protein  27.71 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.313357 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4007  hypothetical protein  30.26 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1301  KH domain protein  31.08 
 
 		 75 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000106186  unclonable  4.49317e-26 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07310  nucleic acid binding protein, containing KH domain  32.43 
 
 		 75 aa  40.4  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.97111e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3942  KH domain protein  31.08 
 
 		 75 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3584  hypothetical protein  29.73 
 
 		 75 aa  40  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  7.1205e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3602  hypothetical protein  29.73 
 
 		 75 aa  40  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000183566  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2870  KH, type 1  28.95 
 
 		 76 aa  40  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000364358  hitchhiker  0.000000513189 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3857  KH domain protein  29.73 
 
 		 75 aa  40  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.50741e-63 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3981  kh domain-containing protein  29.73 
 
 		 75 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000103911  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3694  KH domain-containing protein  29.73 
 
 		 75 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000170601  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>