40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2771 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2771  hypothetical protein  100 
 
 
123 aa  251  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.341296 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5263  hypothetical protein  58.49 
 
 
144 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.133032 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1144  hypothetical protein  59.34 
 
 
128 aa  118  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0142983  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2537  RNA-binding protein  56.7 
 
 
142 aa  116  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.0000157008  hitchhiker  0.00858549 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1955  RNA-binding protein (contains KH domain)-like protein  46.09 
 
 
145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1982  RNA-binding protein contains KH domain  46.09 
 
 
145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000742091  normal  0.027281 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4356  hypothetical protein  65.71 
 
 
112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000661569  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1773  hypothetical protein  37.11 
 
 
105 aa  79  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1389  RNA-binding protein  43.84 
 
 
73 aa  58.2  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0563249  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0689  RNA-binding protein (contains KH domain protein)-like protein  33.33 
 
 
100 aa  47  0.00009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000409438  hitchhiker  0.000420996 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1980  RNA-binding protein  40.32 
 
 
78 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10980  predicted RNA-binding protein (contains KH domain)  36.71 
 
 
85 aa  45.4  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000425582  unclonable  0.00000000129686 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2495  KH domain-containing protein  34.25 
 
 
75 aa  45.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000287664  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09160  RNA-binding protein (KH domain)  38.36 
 
 
81 aa  45.4  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.880979  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0021  hypothetical protein  39.13 
 
 
78 aa  44.3  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.055536  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07310  nucleic acid binding protein, containing KH domain  34.25 
 
 
75 aa  44.3  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.97111e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00320  RNA-binding protein (KH domain)  36.07 
 
 
84 aa  43.9  0.0007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000739144  hitchhiker  0.00000000000355006 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1820  KH domain protein  26.67 
 
 
93 aa  42.7  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000126603  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0969  RNA-binding protein  35.14 
 
 
77 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000537782  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2050  hypothetical protein  26.32 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1915  hypothetical protein  35.14 
 
 
76 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2484  hypothetical protein  36.36 
 
 
82 aa  42.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.307356  normal  0.0960176 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2049  hypothetical protein  35.14 
 
 
76 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.24767  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2223  RNA-binding protein  35.48 
 
 
77 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.17627e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2482  hypothetical protein  37.66 
 
 
80 aa  42.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0272988  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1416  KH type 2 domain protein  31.75 
 
 
88 aa  42  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000861561  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1964  hypothetical protein  35.14 
 
 
76 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1053  hypothetical protein  45.83 
 
 
77 aa  41.2  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0741  nucleic acid binding protein  37.5 
 
 
76 aa  41.6  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000419264 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1711  hypothetical protein  37.1 
 
 
75 aa  41.2  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000142636  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1379  KH domain protein  34.85 
 
 
84 aa  41.6  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000155975  normal  0.609629 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2873  RNA-binding protein  30.56 
 
 
84 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1008  RNA-binding protein (KH domain)  36.36 
 
 
74 aa  41.6  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0103799  normal  0.256823 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3040  hypothetical protein  33.78 
 
 
77 aa  41.2  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000354702  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2998  hypothetical protein  33.78 
 
 
77 aa  41.2  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000253135  normal  0.811405 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2277  hypothetical protein  37.88 
 
 
72 aa  40.8  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0054158  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0144  hypothetical protein  28.57 
 
 
137 aa  40.8  0.007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1089  nucleic acid binding protein  37.1 
 
 
83 aa  40.4  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000185572  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3681  hypothetical protein  46.67 
 
 
77 aa  40.4  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.989233 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2222  hypothetical protein  36.36 
 
 
80 aa  40  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000657625 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>