13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1773 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1773  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  204  4e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1144  hypothetical protein  47.06 
 
 		 128 aa  94.4  5e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0142983  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5263  hypothetical protein  44.68 
 
 		 144 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.133032 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2537  RNA-binding protein  41.84 
 
 		 142 aa  82.8  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.0000157008  hitchhiker  0.00858549 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1955  RNA-binding protein (contains KH domain)-like protein  48.75 
 
 		 145 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1982  RNA-binding protein contains KH domain  48.75 
 
 		 145 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000742091  normal  0.027281 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2771  hypothetical protein  37.11 
 
 		 123 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.341296 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4356  hypothetical protein  45.83 
 
 		 112 aa  76.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000661569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1389  RNA-binding protein  34.25 
 
 		 73 aa  45.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0563249  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1379  KH domain protein  32.91 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000155975  normal  0.609629 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0689  RNA-binding protein (contains KH domain protein)-like protein  26.14 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000409438  hitchhiker  0.000420996 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2873  RNA-binding protein  33.78 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10980  predicted RNA-binding protein (contains KH domain)  26.58 
 
 		 85 aa  40.4  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000425582  unclonable  0.00000000129686 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>