84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5263 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_5263  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  293  4e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.133032 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1955  RNA-binding protein (contains KH domain)-like protein  65.93 
 
 		 145 aa  133  9e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1982  RNA-binding protein contains KH domain  65.93 
 
 		 145 aa  133  9e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000742091  normal  0.027281 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2771  hypothetical protein  57.39 
 
 		 123 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.341296 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1144  hypothetical protein  50.38 
 
 		 128 aa  123  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0142983  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2537  RNA-binding protein  62.79 
 
 		 142 aa  118  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.0000157008  hitchhiker  0.00858549 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4356  hypothetical protein  66.67 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000661569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1773  hypothetical protein  44.68 
 
 		 105 aa  89.4  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2223  RNA-binding protein  37.33 
 
 		 77 aa  52.4  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.17627e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0021  hypothetical protein  29.87 
 
 		 78 aa  50.4  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.055536  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1379  KH domain protein  38.24 
 
 		 84 aa  50.4  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000155975  normal  0.609629 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1915  hypothetical protein  37.33 
 
 		 76 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2049  hypothetical protein  37.33 
 
 		 76 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.24767  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1964  hypothetical protein  37.33 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1198  hypothetical protein  33.78 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00403857  normal  0.0990302 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3306  RNA-binding protein (KH domain)  34.67 
 
 		 77 aa  47.8  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1389  RNA-binding protein  31.51 
 
 		 73 aa  47.4  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0563249  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07310  nucleic acid binding protein, containing KH domain  32.88 
 
 		 75 aa  47.4  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.97111e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1053  hypothetical protein  36.11 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1980  RNA-binding protein  34.85 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3759  hypothetical protein  32.88 
 
 		 76 aa  46.2  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0453276  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2998  hypothetical protein  33.33 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000253135  normal  0.811405 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3040  hypothetical protein  33.33 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000354702  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1513  hypothetical protein  35.14 
 
 		 79 aa  45.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.155704 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0689  RNA-binding protein (contains KH domain protein)-like protein  27.71 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000409438  hitchhiker  0.000420996 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2222  hypothetical protein  33.78 
 
 		 80 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000657625 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1966  hypothetical protein  30.26 
 
 		 80 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.179038  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00320  RNA-binding protein (KH domain)  37.7 
 
 		 84 aa  45.1  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000739144  hitchhiker  0.00000000000355006 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1415  hypothetical protein  33.78 
 
 		 75 aa  45.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00178468  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2024  hypothetical protein  33.33 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000350692  normal  0.0107931 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3593  hypothetical protein  31.08 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4174  hypothetical protein  30.26 
 
 		 80 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1946  hypothetical protein  30.26 
 
 		 80 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.801249  normal  0.846266 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2012  hypothetical protein  30.26 
 
 		 80 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.313357 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1093  R-binding protein (contains KH domain)  28.95 
 
 		 80 aa  44.7  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  5.71907e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12922  hypothetical protein  28.95 
 
 		 80 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.856852  normal  0.613221 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09160  RNA-binding protein (KH domain)  33.33 
 
 		 81 aa  44.7  0.0005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.880979  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2054  hypothetical protein  32.43 
 
 		 75 aa  44.3  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000563212  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0969  RNA-binding protein  33.33 
 
 		 77 aa  44.7  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000537782  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2495  KH domain-containing protein  32.88 
 
 		 75 aa  44.3  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000287664  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4007  hypothetical protein  27.27 
 
 		 78 aa  44.3  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2188  hypothetical protein  28.95 
 
 		 80 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0391463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1828  KH domain protein  33.33 
 
 		 80 aa  43.5  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0800729 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0968  hypothetical protein  33.33 
 
 		 76 aa  43.5  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000604549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1008  RNA-binding protein (KH domain)  37.5 
 
 		 74 aa  43.5  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0103799  normal  0.256823 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2873  RNA-binding protein  30.67 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2482  hypothetical protein  32.43 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0272988  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2143  hypothetical protein  30.67 
 
 		 77 aa  42.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3135  KH domain-containing protein  28.95 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.020256  normal  0.101558 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1802  hypothetical protein  28.21 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.116861  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1711  hypothetical protein  37.1 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000142636  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1301  KH domain protein  32.88 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000106186  unclonable  4.49317e-26 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2084  hypothetical protein  30.26 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1942  hypothetical protein  38.67 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3942  KH domain protein  32.88 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1353  RNA-binding protein (contains KH domain)-like protein  34.25 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000330341  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1416  KH type 2 domain protein  30.65 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000861561  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1097  KH domain-containing protein  28.21 
 
 		 76 aa  41.6  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00599879  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0325  hypothetical protein  33.78 
 
 		 77 aa  41.6  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.851867 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2886  hypothetical protein  30.67 
 
 		 77 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.404491 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3694  KH domain-containing protein  31.51 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000170601  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2050  hypothetical protein  25 
 
 		 81 aa  41.6  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3584  hypothetical protein  31.51 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  7.1205e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3602  hypothetical protein  31.51 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000183566  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09760  hypothetical protein  26.32 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0801933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3981  kh domain-containing protein  31.51 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000103911  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1149  hypothetical protein  29.73 
 
 		 77 aa  41.2  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0258994 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2308  hypothetical protein  28 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000463939  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3857  KH domain protein  31.51 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.50741e-63 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1965  hypothetical protein  31.08 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.780518  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1683  hypothetical protein  31.08 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000180762  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1662  RNA-binding protein  33.87 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000201798  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3666  RNA binding protein  31.51 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000056756  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23740  RNA-binding protein (KH domain)  32.79 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.860329  normal  0.190308 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2451  KH, type 1  28.21 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000946472  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2277  hypothetical protein  34.38 
 
 		 72 aa  40.8  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0054158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3891  KH domain protein  31.51 
 
 		 75 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000683055  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1089  nucleic acid binding protein  32.26 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000185572  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3885  KH domain-containing protein  31.51 
 
 		 77 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000801997  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1633  RNA-binding protein  33.33 
 
 		 81 aa  40.4  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1496  nucleic acid binding protein  27.03 
 
 		 78 aa  40.4  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0525102  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0882  hypothetical protein  30.67 
 
 		 77 aa  40.4  0.008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000154321  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0711  nucleic acid binding protein  32 
 
 		 77 aa  40  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000841646  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0144  hypothetical protein  27.27 
 
 		 137 aa  40  0.01  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>