19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_1982 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1982  RNA-binding protein contains KH domain  100 
 
 		 145 aa  295  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000742091  normal  0.027281 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1955  RNA-binding protein (contains KH domain)-like protein  100 
 
 		 145 aa  295  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5263  hypothetical protein  50.71 
 
 		 144 aa  133  8e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.133032 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1144  hypothetical protein  55.1 
 
 		 128 aa  111  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0142983  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2771  hypothetical protein  46.09 
 
 		 123 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.341296 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2537  RNA-binding protein  45.95 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.0000157008  hitchhiker  0.00858549 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4356  hypothetical protein  59.15 
 
 		 112 aa  95.1  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000661569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1773  hypothetical protein  48.15 
 
 		 105 aa  81.6  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1379  KH domain protein  39.39 
 
 		 84 aa  51.6  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000155975  normal  0.609629 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1389  RNA-binding protein  34.62 
 
 		 73 aa  51.2  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0563249  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1980  RNA-binding protein  34.85 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1053  hypothetical protein  36.21 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2223  RNA-binding protein  28 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.17627e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2873  RNA-binding protein  27.4 
 
 		 84 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00320  RNA-binding protein (KH domain)  34.48 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000739144  hitchhiker  0.00000000000355006 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3759  hypothetical protein  28 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0453276  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0021  hypothetical protein  30.14 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.055536  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0711  nucleic acid binding protein  26.67 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000841646  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2222  hypothetical protein  29.33 
 
 		 80 aa  40.4  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000657625 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>