121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1804 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1804  RNA-binding protein  100 
 
 		 74 aa  140  4e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000242663  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0647  RNA-binding protein  74.32 
 
 		 74 aa  114  5e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.534792  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1225  RNA-binding protein  72 
 
 		 75 aa  103  8e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000401296  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1230  RNA-binding protein  72 
 
 		 75 aa  103  8e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000705626  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0321  RNA-binding protein  60.53 
 
 		 76 aa  83.6  9e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000789402  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2308  hypothetical protein  46.03 
 
 		 78 aa  66.2  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000463939  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1513  hypothetical protein  40.32 
 
 		 79 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.155704 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2223  RNA-binding protein  46.77 
 
 		 77 aa  62  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.17627e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0644  KH domain-containing protein  40 
 
 		 76 aa  61.2  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.20541  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2182  KH domain-containing protein  43.55 
 
 		 75 aa  61.2  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.161429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1802  hypothetical protein  44.44 
 
 		 76 aa  61.2  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.116861  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2870  KH, type 1  41.33 
 
 		 76 aa  60.5  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000364358  hitchhiker  0.000000513189 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3430  KH, type 1, domain protein  42.67 
 
 		 76 aa  60.5  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000151777  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3492  KH, type 1, domain protein  42.67 
 
 		 76 aa  60.5  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.05823e-30 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2451  KH, type 1  42.67 
 
 		 76 aa  60.1  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000946472  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0030  hypothetical protein  41.79 
 
 		 78 aa  59.7  0.00000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00000268476  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1828  KH domain protein  40.62 
 
 		 80 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0800729 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0663  hypothetical protein  42.86 
 
 		 80 aa  59.3  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.82455  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3422  KH domain-containing protein  38.1 
 
 		 80 aa  58.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0313217  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1370  RNA-binding protein (KH domain)  45.07 
 
 		 76 aa  59.3  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209331  normal  0.279466 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1301  KH domain protein  43.28 
 
 		 75 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000106186  unclonable  4.49317e-26 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2143  hypothetical protein  42.86 
 
 		 77 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1089  nucleic acid binding protein  40.98 
 
 		 83 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000185572  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1496  nucleic acid binding protein  46.03 
 
 		 78 aa  58.2  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0525102  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1097  KH domain-containing protein  40 
 
 		 76 aa  57.4  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00599879  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3942  KH domain protein  43.28 
 
 		 75 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1980  RNA-binding protein  40.98 
 
 		 78 aa  57.4  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3762  KH domain-containing protein  41.33 
 
 		 76 aa  57  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000539033  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2495  KH domain-containing protein  40.3 
 
 		 75 aa  57  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000287664  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3306  RNA-binding protein (KH domain)  41.27 
 
 		 77 aa  57  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1306  hypothetical protein  41.94 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0882  hypothetical protein  47.54 
 
 		 77 aa  55.1  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000154321  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3694  KH domain-containing protein  40.3 
 
 		 75 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000170601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3584  hypothetical protein  40.3 
 
 		 75 aa  55.1  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  7.1205e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3602  hypothetical protein  40.3 
 
 		 75 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000183566  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3981  kh domain-containing protein  40.3 
 
 		 75 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000103911  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2998  hypothetical protein  38.1 
 
 		 77 aa  55.1  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000253135  normal  0.811405 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3040  hypothetical protein  38.1 
 
 		 77 aa  55.1  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000354702  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3666  RNA binding protein  41.79 
 
 		 75 aa  55.1  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000056756  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3857  KH domain protein  40.3 
 
 		 75 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.50741e-63 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1195  hypothetical protein  40.32 
 
 		 86 aa  54.7  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.915237 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2886  hypothetical protein  39.68 
 
 		 77 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.404491 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0225  hypothetical protein  39.68 
 
 		 80 aa  54.3  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.657133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0325  hypothetical protein  33.33 
 
 		 77 aa  53.9  0.0000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.851867 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3885  KH domain-containing protein  40.3 
 
 		 77 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000801997  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0980  hypothetical protein  34.38 
 
 		 75 aa  53.9  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.747535  normal  0.258716 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3891  KH domain protein  40.3 
 
 		 75 aa  53.5  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000683055  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0021  hypothetical protein  36.67 
 
 		 78 aa  53.5  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.055536  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1618  hypothetical protein  37.1 
 
 		 82 aa  53.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0250504  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2084  hypothetical protein  37.1 
 
 		 80 aa  53.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4007  hypothetical protein  35.48 
 
 		 78 aa  53.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2222  hypothetical protein  31.75 
 
 		 80 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000657625 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1168  RNA-binding protein (KH domain)  33.33 
 
 		 79 aa  52.8  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1168  hypothetical protein  35.82 
 
 		 79 aa  52  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225392  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2539  hypothetical protein  30.77 
 
 		 78 aa  52.4  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160005  normal  0.11735 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2484  hypothetical protein  36.51 
 
 		 82 aa  52.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.307356  normal  0.0960176 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1471  KH domain protein  30.3 
 
 		 79 aa  52.4  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0670497 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2482  hypothetical protein  31.75 
 
 		 80 aa  51.6  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0272988  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0969  RNA-binding protein  35.82 
 
 		 77 aa  52  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000537782  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5925  hypothetical protein  33.87 
 
 		 79 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.159157  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0986  KH domain protein  31.75 
 
 		 79 aa  52  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.0000000000116002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1098  hypothetical protein  46.03 
 
 		 77 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.337348  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3593  hypothetical protein  33.87 
 
 		 77 aa  51.2  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1966  hypothetical protein  40.98 
 
 		 80 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.179038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2012  hypothetical protein  40.98 
 
 		 80 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.313357 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1946  hypothetical protein  40.98 
 
 		 80 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.801249  normal  0.846266 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4174  hypothetical protein  40.98 
 
 		 80 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0711  nucleic acid binding protein  42.62 
 
 		 77 aa  51.6  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000841646  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09980  RNA-binding protein (KH domain)  32.26 
 
 		 80 aa  51.6  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.4486  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3259  hypothetical protein  31.75 
 
 		 80 aa  51.2  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0689  RNA-binding protein (contains KH domain protein)-like protein  38.71 
 
 		 100 aa  51.2  0.000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000409438  hitchhiker  0.000420996 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1198  hypothetical protein  40.98 
 
 		 75 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00403857  normal  0.0990302 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09760  hypothetical protein  32.26 
 
 		 79 aa  50.8  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0801933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1053  hypothetical protein  32.31 
 
 		 77 aa  50.4  0.000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2024  hypothetical protein  36.51 
 
 		 77 aa  50.4  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000350692  normal  0.0107931 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2188  hypothetical protein  39.34 
 
 		 80 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0391463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0968  hypothetical protein  39.34 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000604549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12922  hypothetical protein  35 
 
 		 80 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.856852  normal  0.613221 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1399  hypothetical protein  32.26 
 
 		 79 aa  49.7  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00422733 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23740  RNA-binding protein (KH domain)  30.3 
 
 		 79 aa  50.1  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.860329  normal  0.190308 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1560  RNA-binding protein  29.69 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0831203 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0768  nucleic acid binding protein  39.34 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000813244  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1149  hypothetical protein  34.92 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0258994 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1536  hypothetical protein  47.46 
 
 		 76 aa  48.9  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000921217  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3759  hypothetical protein  36.07 
 
 		 76 aa  48.9  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0453276  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07310  nucleic acid binding protein, containing KH domain  40.98 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.97111e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1288  RNA-binding protein  35 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5906  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09160  RNA-binding protein (KH domain)  33.33 
 
 		 81 aa  48.5  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.880979  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2054  hypothetical protein  36.36 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000563212  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1665  RNA-binding protein  35 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00331015  hitchhiker  0.0035897 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1915  hypothetical protein  32.79 
 
 		 76 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1711  hypothetical protein  40.98 
 
 		 75 aa  47.8  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000142636  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2049  hypothetical protein  32.79 
 
 		 76 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.24767  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1008  RNA-binding protein (KH domain)  36.51 
 
 		 74 aa  47.4  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0103799  normal  0.256823 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1379  KH domain protein  34.29 
 
 		 84 aa  47.4  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000155975  normal  0.609629 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1964  hypothetical protein  32.79 
 
 		 76 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2673  RNA-binding protein  35.59 
 
 		 75 aa  47  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0307943  hitchhiker  0.000000249091 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1683  hypothetical protein  40.98 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000180762  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0657  hypothetical protein  36.36 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000412714  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1353  RNA-binding protein (contains KH domain)-like protein  28.57 
 
 		 89 aa  46.2  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000330341  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>