63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1302 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1302  RNA-binding protein  100 
 
 		 74 aa  137  4.999999999999999e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0145961  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3759  hypothetical protein  39.19 
 
 		 76 aa  53.9  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0453276  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2223  RNA-binding protein  38.67 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.17627e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1496  nucleic acid binding protein  41.89 
 
 		 78 aa  52.8  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0525102  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2277  hypothetical protein  41.1 
 
 		 72 aa  52  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0054158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1711  hypothetical protein  41.89 
 
 		 75 aa  50.1  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000142636  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1198  hypothetical protein  39.19 
 
 		 75 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00403857  normal  0.0990302 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1389  RNA-binding protein  34.78 
 
 		 73 aa  49.7  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0563249  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1683  hypothetical protein  40.54 
 
 		 75 aa  48.9  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000180762  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1965  hypothetical protein  40.54 
 
 		 75 aa  48.9  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.780518  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0969  RNA-binding protein  40.54 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000537782  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2054  hypothetical protein  40.54 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000563212  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10980  predicted RNA-binding protein (contains KH domain)  48.61 
 
 		 85 aa  48.1  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000425582  unclonable  0.00000000129686 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1370  RNA-binding protein (KH domain)  39.19 
 
 		 76 aa  48.1  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209331  normal  0.279466 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0882  hypothetical protein  39.19 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000154321  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07310  nucleic acid binding protein, containing KH domain  40 
 
 		 75 aa  47.4  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.97111e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1353  RNA-binding protein (contains KH domain)-like protein  33.33 
 
 		 89 aa  47  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000330341  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1416  KH type 2 domain protein  51.79 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000861561  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0711  nucleic acid binding protein  37.14 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000841646  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0768  nucleic acid binding protein  36.49 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000813244  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2050  hypothetical protein  38.89 
 
 		 81 aa  46.2  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1980  RNA-binding protein  36.49 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2873  RNA-binding protein  34.25 
 
 		 84 aa  45.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1008  RNA-binding protein (KH domain)  36.99 
 
 		 74 aa  45.4  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0103799  normal  0.256823 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2870  KH, type 1  37.84 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000364358  hitchhiker  0.000000513189 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1089  nucleic acid binding protein  33.78 
 
 		 83 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000185572  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1097  KH domain-containing protein  37.84 
 
 		 76 aa  44.7  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00599879  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1379  KH domain protein  37.5 
 
 		 84 aa  45.1  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000155975  normal  0.609629 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1301  KH domain protein  35.14 
 
 		 75 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000106186  unclonable  4.49317e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3942  KH domain protein  35.14 
 
 		 75 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1415  hypothetical protein  36.49 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00178468  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0968  hypothetical protein  36.49 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000604549  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0644  KH domain-containing protein  38.67 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.20541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3981  kh domain-containing protein  33.78 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000103911  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3857  KH domain protein  33.78 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.50741e-63 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3694  KH domain-containing protein  33.78 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000170601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3584  hypothetical protein  33.78 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  7.1205e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0689  RNA-binding protein (contains KH domain protein)-like protein  38.36 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000409438  hitchhiker  0.000420996 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0657  hypothetical protein  36.49 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000412714  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3602  hypothetical protein  33.78 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000183566  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2407  RNA binding protein  39.19 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000104085  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2308  hypothetical protein  37.88 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000463939  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3492  KH, type 1, domain protein  37.84 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.05823e-30 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0741  nucleic acid binding protein  31.08 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000419264 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1536  hypothetical protein  35.14 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000921217  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3891  KH domain protein  33.78 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000683055  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3430  KH, type 1, domain protein  37.84 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000151777  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0030  hypothetical protein  33.78 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00000268476  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3762  KH domain-containing protein  37.84 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000539033  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3885  KH domain-containing protein  33.78 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000801997  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2451  KH, type 1  33.78 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000946472  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1093  R-binding protein (contains KH domain)  36.49 
 
 		 80 aa  41.6  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  5.71907e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2049  hypothetical protein  42.37 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.24767  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3306  RNA-binding protein (KH domain)  36.36 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1915  hypothetical protein  42.37 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2495  KH domain-containing protein  31.08 
 
 		 75 aa  40.8  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000287664  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0567  hypothetical protein  35.14 
 
 		 75 aa  40.8  0.007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000283736  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1633  RNA-binding protein  28.38 
 
 		 81 aa  40.8  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0541  RNA-binding protein  35.14 
 
 		 75 aa  40.8  0.007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000338376  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3666  RNA binding protein  33.78 
 
 		 75 aa  40.8  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000056756  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1662  RNA-binding protein  38.46 
 
 		 79 aa  40.4  0.008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000201798  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1802  hypothetical protein  37.88 
 
 		 76 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.116861  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0021  hypothetical protein  32.43 
 
 		 78 aa  40  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.055536  normal  0.167537 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>