24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1678 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_1678  thiamineS protein  100 
 
 
74 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1382  thiamineS protein  54.17 
 
 
73 aa  69.3  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1044  thiamine S  50 
 
 
74 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000364009  hitchhiker  0.00000000250038 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1700  thiamineS protein  38.67 
 
 
75 aa  56.6  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2934  thiamineS protein  40.54 
 
 
74 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1351  thiamineS protein  40.54 
 
 
74 aa  55.1  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1876  thiamineS protein  37.84 
 
 
74 aa  53.9  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2422  thiamineS protein  39.19 
 
 
74 aa  53.9  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0889  thiamineS protein  35.53 
 
 
81 aa  53.5  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1707  molybdopterin converting factor, subunit 1  37.84 
 
 
74 aa  51.6  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0253  molybdopterin converting factor-like protein  39.19 
 
 
74 aa  50.8  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1955  thiamineS protein  38.96 
 
 
75 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2271  thiamineS protein  33.33 
 
 
78 aa  50.4  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1194  thiamineS protein  37.84 
 
 
74 aa  50.4  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0455  molybdopterin converting factor, small subunit  37.84 
 
 
74 aa  50.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683189  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1721  molybdopterin converting factor, small subunit  37.84 
 
 
74 aa  48.9  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000404625  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2318  thiamineS protein  33.78 
 
 
74 aa  47  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2503  thiamineS protein  32.91 
 
 
79 aa  45.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00377976  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0826  thiamineS protein  31.17 
 
 
79 aa  44.7  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000193313  hitchhiker  0.00000689197 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2458  hypothetical protein  33.78 
 
 
74 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1542  MoaD family protein  36.56 
 
 
95 aa  43.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1007  thiamineS protein  34.57 
 
 
79 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00214201  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0173  thiamineS protein  32 
 
 
75 aa  41.2  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00650406  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0278  thiamineS protein  25.93 
 
 
82 aa  40.4  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>