24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3172 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3172  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  266  8e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.87367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3292  hypothetical protein  89.15 
 
 		 129 aa  249  1e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.918096  hitchhiker  0.0000025592 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1336  hypothetical protein  77.34 
 
 		 128 aa  215  1e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2646  hypothetical protein  86.82 
 
 		 129 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.995481 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1469  hypothetical protein  75 
 
 		 128 aa  209  9e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0253681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1439  hypothetical protein  75 
 
 		 128 aa  209  9e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.925762  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1433  hypothetical protein  75 
 
 		 128 aa  209  9e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2914  hypothetical protein  74.22 
 
 		 128 aa  209  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0257108  normal  0.856074 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1259  hypothetical protein  73.44 
 
 		 128 aa  203  7e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.44122  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2894  hypothetical protein  74.05 
 
 		 131 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0780795  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2653  hypothetical protein  77.48 
 
 		 128 aa  192  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2720  hypothetical protein  77.48 
 
 		 128 aa  192  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2827  hypothetical protein  77.48 
 
 		 128 aa  192  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1128  hypothetical protein  65.89 
 
 		 129 aa  188  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.162296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1543  hypothetical protein  64.84 
 
 		 128 aa  180  7e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1617  hypothetical protein  77.48 
 
 		 128 aa  173  9e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3187  hypothetical protein  27.55 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.207132  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002739  hypothetical protein  30.93 
 
 		 99 aa  51.6  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0446734  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0407  hypothetical protein  33.33 
 
 		 100 aa  51.2  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.135299  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0832  hypothetical protein  25.26 
 
 		 105 aa  49.3  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.191887  normal  0.109117 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03040  hypothetical protein  23.71 
 
 		 100 aa  45.4  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0686  hypothetical protein  34.25 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0890579  normal  0.814866 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3652  hypothetical protein  21.65 
 
 		 100 aa  43.9  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0710  hypothetical protein  26.32 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271211  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>