14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1695 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1695  hypothetical protein  100 
 
 		 372 aa  761    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0466437  normal  0.4306 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2899  hypothetical protein  80.18 
 
 		 333 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0123115  hitchhiker  0.000697363 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1484  hypothetical protein  57.85 
 
 		 377 aa  443  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0402  hypothetical protein  35.86 
 
 		 372 aa  236  6e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0403  hypothetical protein  36.53 
 
 		 376 aa  203  4e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0527  hypothetical protein  22.36 
 
 		 346 aa  69.7  0.00000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2347  hypothetical protein  21.56 
 
 		 333 aa  56.6  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0756  hypothetical protein  30 
 
 		 246 aa  50.8  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.189796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0881  alanine racemase region  21.53 
 
 		 356 aa  50.4  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.140785  hitchhiker  0.000185996 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1681  protein of unknown function DUF481  26.15 
 
 		 419 aa  49.3  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0880  hypothetical protein  30 
 
 		 246 aa  48.5  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0708  hypothetical protein  25.86 
 
 		 239 aa  47  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0944  hypothetical protein  21.81 
 
 		 337 aa  45.8  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.659342  normal  0.734525 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3855  hypothetical protein  23.19 
 
 		 305 aa  42.7  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.248641  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>