31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1484 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1484  hypothetical protein  100 
 
 		 377 aa  770    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2899  hypothetical protein  64.18 
 
 		 333 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0123115  hitchhiker  0.000697363 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1695  hypothetical protein  57.85 
 
 		 372 aa  443  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0466437  normal  0.4306 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0402  hypothetical protein  39.83 
 
 		 372 aa  252  7e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0403  hypothetical protein  34.17 
 
 		 376 aa  208  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0527  hypothetical protein  20.88 
 
 		 346 aa  62  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2347  hypothetical protein  21.91 
 
 		 333 aa  56.6  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0708  hypothetical protein  22.57 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0876  hypothetical protein  28.92 
 
 		 245 aa  55.1  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0538553  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3349  hypothetical protein  28.48 
 
 		 245 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000236372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0777  hypothetical protein  28.48 
 
 		 245 aa  53.9  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0484485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3246  hypothetical protein  28.48 
 
 		 245 aa  53.9  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0192004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0831  hypothetical protein  27.27 
 
 		 245 aa  52.8  0.000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.221265  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3461  protein of unknown function DUF481  27.27 
 
 		 245 aa  52.8  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2791  hypothetical protein  31.58 
 
 		 245 aa  52.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00000611146  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3536  hypothetical protein  27.27 
 
 		 245 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3655  hypothetical protein  27.27 
 
 		 245 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0756  hypothetical protein  32.99 
 
 		 246 aa  51.2  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.189796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3855  hypothetical protein  25.74 
 
 		 305 aa  50.4  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.248641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0652  hypothetical protein  27.98 
 
 		 246 aa  50.1  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000354938  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0878  hypothetical protein  32.99 
 
 		 246 aa  49.3  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000368102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0881  alanine racemase region  20.46 
 
 		 356 aa  48.9  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.140785  hitchhiker  0.000185996 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0756  hypothetical protein  22.22 
 
 		 249 aa  48.1  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.216313  hitchhiker  0.00000194898 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0934  hypothetical protein  26.35 
 
 		 245 aa  48.9  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0880  hypothetical protein  35.87 
 
 		 246 aa  47.8  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1733  hypothetical protein  24.35 
 
 		 317 aa  47.8  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0231419  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1681  protein of unknown function DUF481  27.69 
 
 		 419 aa  47.4  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0514  hypothetical protein  24.2 
 
 		 251 aa  46.6  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0608195  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4213  hypothetical protein  22.47 
 
 		 249 aa  46.2  0.0009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.195016  hitchhiker  0.000349999 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1764  hypothetical protein  22.73 
 
 		 351 aa  44.3  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0370  hypothetical protein  22.95 
 
 		 332 aa  44.3  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.397767 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>